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Yorodumi- PDB-4xgz: Crystal structure of human paxillin LD2 motif in complex with Fab... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4xgz | ||||||
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Title | Crystal structure of human paxillin LD2 motif in complex with Fab fragment | ||||||
Components |
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Keywords | CELL ADHESION / synthetic antibody / paxillin / LD motif / immunoglobulin / Fab fragment / complex / focal adhesion | ||||||
Function / homology | Function and homology information Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components / Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions / vinculin binding / neuropilin binding / signal complex assembly / microtubule associated complex / growth hormone receptor signaling pathway / GAB1 signalosome / endothelial cell migration / Smooth Muscle Contraction ...Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components / Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions / vinculin binding / neuropilin binding / signal complex assembly / microtubule associated complex / growth hormone receptor signaling pathway / GAB1 signalosome / endothelial cell migration / Smooth Muscle Contraction / PTK6 Regulates RHO GTPases, RAS GTPase and MAP kinases / stress fiber / positive regulation of stress fiber assembly / substrate adhesion-dependent cell spreading / transforming growth factor beta receptor signaling pathway / cellular response to reactive oxygen species / VEGFA-VEGFR2 Pathway / beta-catenin binding / cell-cell junction / cell migration / lamellipodium / cell cortex / protein phosphatase binding / cell adhesion / focal adhesion / signal transduction / metal ion binding / plasma membrane / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.5 Å | ||||||
Authors | Nocula-Lugowska, M. / Lugowski, M. / Salgia, R. / Kossiakoff, A.A. | ||||||
Funding support | United States, 1items
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Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2015 Title: Engineering Synthetic Antibody Inhibitors Specific for LD2 or LD4 Motifs of Paxillin. Authors: Nocula-Lugowska, M. / Lugowski, M. / Salgia, R. / Kossiakoff, A.A. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4xgz.cif.gz | 1 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4xgz.ent.gz | 891.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4xgz.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 4xgz_validation.pdf.gz | 742.5 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 4xgz_full_validation.pdf.gz | 818.7 KB | Display | |
Data in XML | 4xgz_validation.xml.gz | 173.8 KB | Display | |
Data in CIF | 4xgz_validation.cif.gz | 239.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xg/4xgz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xg/4xgz | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 4xh2C 3pgfS C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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