PDB-4u0b: Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide, P212121 crystal form

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4u0b

タイトル

Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide, P212121 crystal form

要素

Capsid protein p24
Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

キーワード

VIRAL PROTEIN / Capsid / Complex

機能・相同性

機能・相同性情報

exon-exon junction complex binding / positive regulation of RNA export from nucleus / mRNA cleavage factor complex / co-transcriptional mRNA 3'-end processing, cleavage and polyadenylation pathway / interchromatin granule / Processing of Intronless Pre-mRNAs / perichromatin fibrils / mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex / mRNA alternative polyadenylation / mRNA 3'-end processing ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (ヒト免疫不全ウイルス)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Price, A.J. / Jacques, D.A. / James, L.C.

引用

ジャーナル: Plos Pathog. / 年: 2014
タイトル: Host Cofactors and Pharmacologic Ligands Share an Essential Interface in HIV-1 Capsid That Is Lost upon Disassembly.
著者: Price, A.J. / Jacques, D.A. / McEwan, W.A. / Fletcher, A.J. / Essig, S. / Chin, J.W. / Halambage, U.D. / Aiken, C. / James, L.C.

履歴

登録	2014年7月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2014年11月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.2	2024年10月23日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4u0b.cif.gz	999.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4u0b.ent.gz	843.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4u0b.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u0/4u0b ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u0/4u0b	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4u0aSC 4u0cC 4u0dC 4u0eC 4u0fC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4wym-1 6v2f-2 4wym-2 6v2f-3 3h4e-2 5hgl-d 5tsx-2 4u0d-1 4u0e-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (3) #87 - 2007年3月ジンクフィンガー (Zinc Fingers) 類似性 (2) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (1) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Capsid protein p24

B: Capsid protein p24

C: Capsid protein p24

D: Capsid protein p24

E: Capsid protein p24

F: Capsid protein p24

G: Capsid protein p24

H: Capsid protein p24

I: Capsid protein p24

J: Capsid protein p24

K: Capsid protein p24

L: Capsid protein p24

M: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

N: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

O: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

P: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

Q: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

R: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

S: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

T: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

U: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

V: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

W: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

X: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

324 kDa, 24 ポリマー
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1

A: Capsid protein p24

B: Capsid protein p24

C: Capsid protein p24

D: Capsid protein p24

E: Capsid protein p24

F: Capsid protein p24

M: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

N: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

O: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

P: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

Q: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

R: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
162 kDa, 12 ポリマー
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2

G: Capsid protein p24

H: Capsid protein p24

I: Capsid protein p24

J: Capsid protein p24

K: Capsid protein p24

L: Capsid protein p24

S: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

T: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

U: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

V: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

W: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

X: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
162 kDa, 12 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	135.130, 135.890, 208.190
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	4	A	1 - 145
2	1	1	4	B	1 - 145
3	1	1	4	C	1 - 145
4	1	1	4	D	1 - 145
5	1	1	4	E	1 - 145
6	1	1	4	F	1 - 145
7	1	1	4	G	1 - 145
8	1	1	4	H	1 - 145
9	1	1	4	I	1 - 145
10	1	1	4	J	1 - 145
11	1	1	4	K	1 - 145
12	1	1	4	L	1 - 145
1	1	2	4	A	146 - 999
2	1	2	4	B	146 - 999
3	1	2	4	C	146 - 999
4	1	2	4	D	146 - 999
5	1	2	4	E	146 - 999
6	1	2	4	F	146 - 999
7	1	2	4	G	146 - 999
8	1	2	4	H	146 - 999
9	1	2	4	I	146 - 999
10	1	2	4	J	146 - 999
11	1	2	4	K	146 - 999
12	1	2	4	L	146 - 999

NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: タンパク質	Capsid protein p24 / Pr55Gag 分子量: 25461.271 Da / 分子数: 12 / 変異: yes / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (ヒト免疫不全ウイルス) 株: isolate NY5 / 遺伝子: gag / プラスミド: pET11a / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P12493
#2: タンパク質・ペプチド	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 / Cleavage and polyadenylation specificity factor 68 kDa subunit / CPSF 68 kDa subunit / Pre-mRNA ...Cleavage and polyadenylation specificity factor 68 kDa subunit / CPSF 68 kDa subunit / Pre-mRNA cleavage factor Im 68 kDa subunit / Protein HPBRII-4/7 分子量: 1550.796 Da / 分子数: 12 / Fragment: UNP residues 276-290 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16630
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.95 Å³/Da / 溶媒含有率: 58.28 %
結晶化	温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 20% v/v PEG 300, 10% v/v glycerol, 5% w/v PEG 8K, 0.1 M TRIS

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I24 / 波長: 0.9686 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年7月6日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9686 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→48.6 Å / Num. obs: 89373 / % possible obs: 95.1 % / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.069 / Net I/σ(I): 11.7
反射シェル	解像度: 2.8→2.95 Å / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.588 / % possible all: 97.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0049	精密化
iMOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
PHASER		位相決定
PDB_EXTRACT	3.14	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4U0A

4u0a

解像度: 2.8→48.6 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.928 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.91 / SU B: 36.856 / SU ML: 0.315 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 1.33 / ESU R Free: 0.369 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : WITH TLS ADDED

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2619	4479	5 %	RANDOM
R_work	0.2295	84854	-	-
obs	0.2311	89333	94.13 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 229.13 Å² / B_iso mean: 85.338 Å² / B_iso min: 37.05 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.17 Å²	0 Å²	-0 Å²
2-	-	0.39 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.21 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.8→48.6 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19931	0	0	0	19931
残基数	-	-	-	-	2596

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.004	0.019	20452
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	19496
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	0.739	1.964	27838
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.67	3.001	44943
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	3.927	5	2569
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	31.126	24.847	848
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.242	15	3355
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.779	15	110
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.04	0.2	3130
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.021	22972
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	4372
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	3.202	7.254	10357
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	3.201	7.254	10356
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	5.172	12.225	12872

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	1	A	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.16	0.5
1	2	B	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.15	0.5
1	3	C	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.13	0.5
1	4	D	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.11	0.5
1	5	E	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.11	0.5
1	6	F	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.11	0.5
1	7	G	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.21	0.5
1	8	H	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.18	0.5
1	9	I	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.1	0.5
1	10		1995	MEDIUM POSITIONAL	0.11	0.5
1	11	A	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.1	0.5
1	12	B	1995	MEDIUM POSITIONAL	0.13	0.5
1	1	A	1995	MEDIUM THERMAL	7.3	2
1	2	B	1995	MEDIUM THERMAL	7.44	2
1	3	C	1995	MEDIUM THERMAL	6.97	2
1	4	D	1995	MEDIUM THERMAL	5.84	2
1	5	E	1995	MEDIUM THERMAL	6.28	2
1	6	F	1995	MEDIUM THERMAL	5.15	2
1	7	G	1995	MEDIUM THERMAL	6.86	2
1	8	H	1995	MEDIUM THERMAL	7.18	2
1	9	I	1995	MEDIUM THERMAL	5.74	2
1	10		1995	MEDIUM THERMAL	5.82	2
1	11	A	1995	MEDIUM THERMAL	9.21	2
1	12	B	1995	MEDIUM THERMAL	5.25	2
2	1	A	976	MEDIUM POSITIONAL	0.23	0.5
2	2	B	976	MEDIUM POSITIONAL	0.16	0.5
2	3	C	976	MEDIUM POSITIONAL	0.14	0.5
2	4	D	976	MEDIUM POSITIONAL	0.13	0.5
2	5	E	976	MEDIUM POSITIONAL	0.13	0.5
2	6	F	976	MEDIUM POSITIONAL	0.25	0.5
2	7	G	976	MEDIUM POSITIONAL	0.18	0.5
2	8	H	976	MEDIUM POSITIONAL	0.2	0.5
2	9	I	976	MEDIUM POSITIONAL	0.13	0.5
2	10		976	MEDIUM POSITIONAL	0.21	0.5
2	11	A	976	MEDIUM POSITIONAL	0.18	0.5
2	12	B	976	MEDIUM POSITIONAL	0.26	0.5
2	1	A	976	MEDIUM THERMAL	13.37	2
2	2	B	976	MEDIUM THERMAL	11.69	2
2	3	C	976	MEDIUM THERMAL	8.02	2
2	4	D	976	MEDIUM THERMAL	7.87	2
2	5	E	976	MEDIUM THERMAL	7.14	2
2	6	F	976	MEDIUM THERMAL	12.78	2
2	7	G	976	MEDIUM THERMAL	8.7	2
2	8	H	976	MEDIUM THERMAL	10.56	2
2	9	I	976	MEDIUM THERMAL	6.93	2
2	10		976	MEDIUM THERMAL	15.3	2
2	11	A	976	MEDIUM THERMAL	8.83	2
2	12	B	976	MEDIUM THERMAL	12.66	2

LS精密化シェル

解像度: 2.8→2.873 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.381	369	-
R_work	0.331	6359	-
all	-	6728	-
obs	-	-	97.07 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.3446	0.7865	0.0512	2.9161	0.9851	1.2424	-0.2898	0.1115	0.3486	-0.2397	0.0186	0.4319	0.1106	-0.0094	0.2713	0.1159	0.0004	-0.0144	0.1081	-0.0074	0.1846	-17.4358	47.0768	-5.2531
2	1.3959	-0.1094	-0.505	2.3314	-0.2019	3.061	-0.275	-0.0179	-0.3416	0.1241	-0.0021	0.5871	0.5529	-0.1454	0.2771	0.1991	-0.002	0.2286	0.0543	-0.0035	0.4122	-30.905	30.6052	9.6332
3	1.1391	-0.0388	1.093	0.5027	-0.2691	3.8461	-0.3521	-0.388	-0.3887	0.175	0.1319	0.1495	0.1916	-0.2465	0.2202	0.337	0.243	0.3329	0.2213	0.2322	0.341	-27.0824	29.155	36.2981
4	0.6789	0.6229	-0.796	1.2482	-0.9235	1.8562	-0.2434	-0.5387	-0.1965	0.1607	-0.1422	0.0238	0.2282	0.6205	0.3856	0.3288	0.4171	0.1758	0.6373	0.2629	0.197	-10.1865	45.3271	47.7056
5	3.2567	1.4957	-2.3897	0.9773	-0.8345	3.8163	0.0979	-0.4696	0.3126	0.234	0.0594	0.1708	-0.2375	1.0426	-0.1573	0.1819	0.089	0.0171	0.4962	0.0221	0.0707	4.5755	62.1282	32.566
6	1.2176	-0.6333	-0.0203	0.794	1.5377	5.3716	-0.1182	0.0224	0.1989	-0.2368	0.0537	-0.0951	-0.9916	0.0546	0.0645	0.231	-0.0047	-0.054	0.1497	-0.0077	0.1232	0.5394	64.1908	5.9816
7	1.9646	-0.0571	0.6329	0.6876	0.0588	2.3727	-0.0414	-0.0141	-0.4286	-0.0209	-0.163	0.3005	0.1563	-0.4564	0.2044	0.0418	0.009	-0.008	0.2249	-0.2388	0.3923	-71.3846	70.2836	42.9009
8	0.8523	-0.1109	-0.2643	1.5714	-1.1714	3.1213	0.1744	0.3053	-0.0129	-0.454	-0.2886	0.325	0.4333	-0.1364	0.1142	0.2325	0.2192	-0.1716	0.3463	-0.265	0.2976	-72.7871	73.6115	16.0921
9	1.3999	0.3469	0.4593	1.9879	-0.1049	1.8006	0.0525	0.4752	-0.097	-0.4918	-0.2701	0.1262	-0.3209	-0.0665	0.2176	0.3522	0.2787	-0.1049	0.3841	-0.0651	0.1185	-56.8069	89.9427	4.3329
10	1.0911	1.2846	1.0554	2.0511	2.0262	4.598	0.0156	0.3644	-0.1503	-0.2535	0.2066	-0.2006	-1.2933	0.3245	-0.2222	0.504	0.0109	-0.0093	0.241	-0.0375	0.0821	-40.4334	106.2529	19.4308
11	0.3694	-0.5255	-0.5706	1.1302	0.2618	5.9544	0.1144	-0.0263	0.0352	-0.0584	-0.1633	-0.0484	-0.3143	0.8419	0.0488	0.0958	-0.0496	0.0192	0.1744	0.0072	0.0227	-38.2415	102.3287	45.7227
12	3.3648	0.6411	-1.2812	2.4801	0.1434	1.3488	-0.0171	-0.3207	-0.4819	0.0816	-0.2892	-0.1611	-0.043	-0.1089	0.3063	0.0279	0.0084	0.0012	0.134	-0.0187	0.1441	-54.7317	84.211	57.5394
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20	4.3485	-0.3125	-0.8097	7.5868	4.2471	2.4764	-0.4585	-0.381	0.3693	0.5373	0.3264	0.4531	0.3809	0.2315	0.1322	0.3493	-0.1357	-0.065	0.3682	-0.0208	0.3729	-77.3107	60.5149	34.2406
21	2.0026	-2.4076	-0.8314	3.6874	-0.3192	2.5521	0.6017	0.4193	-0.9643	-0.9668	-0.4217	1.5187	0.1637	-0.3859	-0.18	0.3414	0.0167	-0.3461	0.4395	-0.2671	0.671	-69.8497	73.1254	1.4049
22	3.4385	-3.8443	-0.6575	4.3358	0.7507	0.1336	0.508	0.5019	-0.178	-0.6815	-0.5251	0.161	-0.1523	-0.0984	0.0171	0.4846	0.0511	0.0702	0.3208	-0.0309	0.0781	-46.5265	99.1712	-1.4468
23	7.562	-5.5703	-0.1347	4.1086	0.1111	0.0301	0.6515	0.7814	0.361	-0.5538	-0.5688	-0.28	-0.1274	0.0575	-0.0827	0.5461	-0.2595	0.1967	0.4543	0.0471	0.1723	-28.5926	110.8205	27.0704
24	6.9596	-5.9399	-3.9711	5.1435	3.3822	2.3097	0.3233	-0.3483	1.2973	-0.1546	0.1818	-1.1887	-0.1392	0.1813	-0.5051	0.1162	-0.1635	-0.0256	0.5173	0.0044	0.9343	-35.2581	96.6047	59.2038

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 220
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	1 - 220
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	1 - 220
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	1 - 220
5	X-RAY DIFFRACTION	5	E	1 - 220
6	X-RAY DIFFRACTION	6	F	1 - 220
7	X-RAY DIFFRACTION	7	G	1 - 220
8	X-RAY DIFFRACTION	8	H	1 - 220
9	X-RAY DIFFRACTION	9	I	1 - 220
10	X-RAY DIFFRACTION	10	J	1 - 220
11	X-RAY DIFFRACTION	11	K	1 - 220
12	X-RAY DIFFRACTION	12	L	1 - 220
13	X-RAY DIFFRACTION	13	M	313 - 326
14	X-RAY DIFFRACTION	14	N	313 - 325
15	X-RAY DIFFRACTION	15	O	313 - 326
16	X-RAY DIFFRACTION	16	P	313 - 326
17	X-RAY DIFFRACTION	17	Q	313 - 326
18	X-RAY DIFFRACTION	18	R	313 - 326
19	X-RAY DIFFRACTION	19	S	313 - 326
20	X-RAY DIFFRACTION	20	T	313 - 326
21	X-RAY DIFFRACTION	21	U	313 - 326
22	X-RAY DIFFRACTION	22	V	313 - 326
23	X-RAY DIFFRACTION	23	W	313 - 326
24	X-RAY DIFFRACTION	24	X	313 - 326

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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