登録情報 データベース : PDB / ID : 4p8w 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The crystal structures of YKL-39 in the presence of chitooligosaccharides (GlcNAc4) were solved to resolutions of 1.9 angstrom 要素Chitinase-3-like protein 2 詳細 キーワード SUGAR BINDING PROTEIN / Chitinase 3-like protein 2 / human YKL-39 / Family-18 chitinase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
chitin catabolic process / chitin binding / carbohydrate binding / carbohydrate metabolic process / hydrolase activity / extracellular space / extracellular region 類似検索 - 分子機能 Chitinase A; domain 3 - #10 / Chitinase insertion domain superfamily / Chitinase II / Glyco_18 / Glycosyl hydrolases family 18 (GH18) domain profile. / Glycoside hydrolase family 18, catalytic domain / Glycosyl hydrolases family 18 / Chitinase A; domain 3 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily ... Chitinase A; domain 3 - #10 / Chitinase insertion domain superfamily / Chitinase II / Glyco_18 / Glycosyl hydrolases family 18 (GH18) domain profile. / Glycoside hydrolase family 18, catalytic domain / Glycosyl hydrolases family 18 / Chitinase A; domain 3 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Roll / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.87 Å 詳細データ登録者 Suginta, W. / Ranok, A. / Robinson, R.C. / Wongsantichon, J. 資金援助 タイ, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 The Higher Education Commission CHE500307 タイ
引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2015タイトル : Structural and Thermodynamic Insights into Chitooligosaccharide Binding to Human Cartilage Chitinase 3-like Protein 2 (CHI3L2 or YKL-39).著者 : Ranok, A. / Wongsantichon, J. / Robinson, R.C. / Suginta, W. 履歴 登録 2014年4月1日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2014年12月3日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年12月17日 Group : Database references改定 1.2 2015年2月4日 Group : Derived calculations改定 1.3 2015年2月11日 Group : Database references改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / citation / entity / entity_src_gen / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_mod_residue / pdbx_struct_oper_list / pdbx_validate_close_contact / refine_hist / struct_asym / struct_conn / struct_keywords / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _citation.journal_id_CSD / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.src_method / _entity.type / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_database_status.pdb_format_compatible / _pdbx_entity_nonpoly.entity_id / _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details / _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id / _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id / _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _refine_hist.number_atoms_solvent / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand / _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid / _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein / _struct_asym.entity_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_keywords.text 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年12月27日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
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