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- PDB-4mnq: TCR-peptide specificity overrides affinity enhancing TCR-MHC inte... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 4mnq
タイトルTCR-peptide specificity overrides affinity enhancing TCR-MHC interactions
要素
  • Beta-2-microglobulin
  • HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain
  • Telomerase reverse transcriptase
  • Uncharacterized protein, T-cell receptor, sp3.4 alpha chain
  • V_segment translation product, T-cell receptor beta-1 chain C region
キーワードIMMUNE SYSTEM / Surface plasmon resonance (SPR) / BIAcoreTM / peptide-major histocompatibility complex (pMHC): T-cell receptor (TCR) / T-cells / high affinity TCR / two-step binding / adoptive therapy / Immunoglobulin / Adaptive immune response
機能・相同性
機能・相同性情報


positive regulation of hair cycle / template-free RNA nucleotidyltransferase / positive regulation of transdifferentiation / TERT-RMRP complex / DNA strand elongation / RNA-directed RNA polymerase complex / positive regulation of protein localization to nucleolus / siRNA transcription / telomerase catalytic core complex / RNA-templated DNA biosynthetic process ...positive regulation of hair cycle / template-free RNA nucleotidyltransferase / positive regulation of transdifferentiation / TERT-RMRP complex / DNA strand elongation / RNA-directed RNA polymerase complex / positive regulation of protein localization to nucleolus / siRNA transcription / telomerase catalytic core complex / RNA-templated DNA biosynthetic process / establishment of protein localization to telomere / Regulation of MITF-M-dependent genes involved in DNA replication, damage repair and senescence / nuclear telomere cap complex / siRNA processing / telomere maintenance via recombination / alpha-beta T cell receptor complex / positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration / telomerase holoenzyme complex / telomerase RNA binding / positive regulation of memory T cell activation / T cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target / TAP complex binding / Golgi medial cisterna / positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell activation / CD8-positive, alpha-beta T cell activation / positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation / T cell receptor complex / CD8 receptor binding / RNA-templated transcription / DNA biosynthetic process / telomeric DNA binding / positive regulation of stem cell proliferation / Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse / Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains / antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I / beta-2-microglobulin binding / endoplasmic reticulum exit site / antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-dependent / mitochondrial nucleoid / TAP binding / alpha-beta T cell activation / protection from natural killer cell mediated cytotoxicity / Generation of second messenger molecules / negative regulation of cellular senescence / Telomere Extension By Telomerase / replicative senescence / positive regulation of Wnt signaling pathway / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / Co-inhibition by PD-1 / antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-independent / antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib / positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle / telomere maintenance via telomerase / RNA-directed DNA polymerase activity / negative regulation of endothelial cell apoptotic process / detection of bacterium / T cell receptor binding / response to cadmium ion / positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation / telomere maintenance / positive regulation of nitric-oxide synthase activity / : / : / positive regulation of receptor binding / early endosome lumen / Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression / negative regulation of receptor binding / DAP12 interactions / cellular response to iron ion / positive regulation of D-glucose import / lumenal side of endoplasmic reticulum membrane / Endosomal/Vacuolar pathway / mitochondrion organization / Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC / peptide antigen assembly with MHC class II protein complex / cellular response to iron(III) ion / antigen processing and presentation of exogenous protein antigen via MHC class Ib, TAP-dependent / MHC class II protein complex / negative regulation of forebrain neuron differentiation / Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex / ER to Golgi transport vesicle membrane / peptide antigen assembly with MHC class I protein complex / regulation of erythrocyte differentiation / regulation of iron ion transport / MHC class I peptide loading complex / transcription coactivator binding / response to molecule of bacterial origin / HFE-transferrin receptor complex / T cell mediated cytotoxicity / regulation of protein stability / antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I / PML body / positive regulation of T cell cytokine production / antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II / MHC class I protein complex / positive regulation of immune response / peptide antigen binding / positive regulation of miRNA transcription / negative regulation of neurogenesis / positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
類似検索 - 分子機能
: / : / Telomerase reverse transcriptase, C-terminal extension / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA binding domain / Telomerase reverse transcriptase / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA-binding domain / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA binding domain / : / : / T-cell receptor alpha chain, constant domain ...: / : / Telomerase reverse transcriptase, C-terminal extension / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA binding domain / Telomerase reverse transcriptase / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA-binding domain / Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA binding domain / : / : / T-cell receptor alpha chain, constant domain / Domain of unknown function (DUF1968) / : / MHC class I, alpha chain, C-terminal / MHC_I C-terminus / MHC class I-like antigen recognition-like / Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1 / MHC class I alpha chain, alpha1 alpha2 domains / Class I Histocompatibility antigen, domains alpha 1 and 2 / Immunoglobulin V-Type / Beta-2-Microglobulin / : / MHC class I-like antigen recognition-like / MHC class I-like antigen recognition-like superfamily / Immunoglobulin V-set domain / MHC classes I/II-like antigen recognition protein / Immunoglobulin V-set domain / : / Reverse transcriptase domain / Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) / Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site / Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature. / Immunoglobulin C-Type / Immunoglobulin C1-set / Immunoglobulin C1-set domain / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulin-like fold / DNA/RNA polymerase superfamily / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
T cell receptor beta variable 6-5 / Ig-like domain-containing protein / T-cell receptor, sp3.4 alpha chain / Telomerase reverse transcriptase / T cell receptor beta constant 1 / HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain / HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain / Beta-2-microglobulin
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
Pan troglodytes (チンパンジー)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.742 Å
データ登録者Rizkallah, P.J. / Cole, D.K. / Sewell, A.K. / Jakobsen, B.K.
引用ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2014
タイトル: T-cell receptor (TCR)-peptide specificity overrides affinity-enhancing TCR-major histocompatibility complex interactions.
著者: Cole, D.K. / Miles, K.M. / Madura, F. / Holland, C.J. / Schauenburg, A.J. / Godkin, A.J. / Bulek, A.M. / Fuller, A. / Akpovwa, H.J. / Pymm, P.G. / Liddy, N. / Sami, M. / Li, Y. / Rizkallah, P. ...著者: Cole, D.K. / Miles, K.M. / Madura, F. / Holland, C.J. / Schauenburg, A.J. / Godkin, A.J. / Bulek, A.M. / Fuller, A. / Akpovwa, H.J. / Pymm, P.G. / Liddy, N. / Sami, M. / Li, Y. / Rizkallah, P.J. / Jakobsen, B.K. / Sewell, A.K.
履歴
登録2013年9月11日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02013年11月13日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12013年12月4日Group: Database references
改定 1.22014年5月14日Group: Database references
改定 1.32017年8月2日Group: Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / software
改定 1.42024年10月16日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain
B: Beta-2-microglobulin
C: Telomerase reverse transcriptase
D: Uncharacterized protein, T-cell receptor, sp3.4 alpha chain
E: V_segment translation product, T-cell receptor beta-1 chain C region
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)94,5708
ポリマ－94,3545
非ポリマー2163
水37821
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area11940 Å2
ΔGint-56 kcal/mol
Surface area38070 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)94.220, 48.490, 118.070
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 107.860, 90.000
Int Tables number4
Space group name H-MP1211

-
要素

-
タンパク質 , 4種, 4分子 ABDE

#1: タンパク質 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain / MHC class I antigen A*2


分子量: 31951.316 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HLA-A, HLAA / プラスミド: pGMT7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta DE3 / 参照: UniProt: P01892, UniProt: P04439*PLUS
#2: タンパク質 Beta-2-microglobulin / Beta-2-microglobulin form pI 5.3


分子量: 11879.356 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: B2M, CDABP0092, HDCMA22P / プラスミド: pGMT7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta DE3 / 参照: UniProt: P61769
#4: タンパク質 Uncharacterized protein, T-cell receptor, sp3.4 alpha chain


分子量: 22245.559 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Pan troglodytes (チンパンジー), (組換発現) Homo sapiens (ヒト)
遺伝子: LOC452776 / プラスミド: pGMT7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta DE3 / 参照: UniProt: H2RG00, UniProt: K7N5M9
#5: タンパク質 V_segment translation product, T-cell receptor beta-1 chain C region


分子量: 27135.082 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TCRBV13S1, TRBC1 / プラスミド: pGMT7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta DE3 / 参照: UniProt: A0A585, UniProt: P01850

-
タンパク質・ペプチド , 1種, 1分子 C

#3: タンパク質・ペプチド Telomerase reverse transcriptase / HEST2 / Telomerase catalytic subunit / Telomerase-associated protein 2 / TP2


分子量: 1142.434 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: MAGE hTERT 540-548 sequence / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O14746, RNA-directed DNA polymerase

-
非ポリマー , 3種, 24分子

#6: 化合物 ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル


分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C3H8O3
#7: 化合物 ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル


分子量: 62.068 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6O2
#8: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 21 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.72 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.82 %
結晶化温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5
詳細: TRIS 0.02M, 20% PEG 4000, 0.01M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I03 / 波長: 0.9763 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年6月30日
放射モノクロメーター: Si 111 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9763 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.74→42.15 Å / Num. obs: 26577 / % possible obs: 82 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.6 % / Rmerge(I) obs: 0.121 / Net I/σ(I): 8.3
反射 シェル
解像度 (Å)冗長度 (%)Rmerge(I) obsMean I/σ(I) obsDiffraction-ID% possible all
2.74-2.811.60.9091.8185.6
12.26-42.151.40.03919166.5

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類NB
Aimless0.1.16データスケーリング
PHASER位相決定
REFMAC5.7.0029精密化
PDB_EXTRACT3.11データ抽出
XSCALEデータスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.742→42.15 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.933 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.878 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU B: 37.958 / SU ML: 0.35 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.412 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.28438 1344 5.1 %RANDOM
Rwork0.214 ---
obs0.21767 25218 97.65 %-
all-26562 --
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 64.941 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--0.1 Å20 Å20.78 Å2
2--0.7 Å2-0 Å2
3----0.7 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.742→42.15 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数6649 0 14 21 6684
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0120.0196851
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d0.0010.026168
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.5711.9279317
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg0.8283.00214172
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg8.4455820
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg38.21923.864352
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg20.491151084
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg18.2381546
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0890.2978
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0060.0217858
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other0.0010.021700
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it1.4662.9813295
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_other1.4662.9813294
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it2.4274.4684110
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it1.6453.1083556
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded
LS精密化 シェル解像度: 2.742→2.813 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.428 95 -
Rwork0.343 1858 -
obs--98.74 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
15.02691.33110.46262.58040.45433.48730.12430.3027-0.0235-0.0875-0.00930.177-0.0274-0.4157-0.1150.0320.0253-0.00680.0829-0.00050.086432.67940.2716-12.4552
22.3432-1.4284-1.50228.82645.70468.87370.0369-0.06910.72080.1561-0.3570.3512-0.7887-0.71680.32010.32240.0779-0.01020.3287-0.03460.492916.44114.780115.6706
35.69391.6877-2.81453.6395-3.37459.48250.0107-0.4098-0.11330.4250.0890.0084-0.09040.0885-0.09980.0680.0325-0.0070.0612-0.03720.133933.5477-0.178614.9051
43.3409-0.46630.84412.4697-2.127111.8846-0.09560.49120.1172-0.39490.07820.0084-0.2823-1.08180.01740.16740.0394-0.04840.44380.00250.313726.0301-2.6319-43.1843
57.9537-1.4320.04985.9832-0.24697.22870.25270.4527-0.4434-0.4365-0.0550.1590.1114-0.8568-0.19780.2298-0.1257-0.03360.74680.0320.225931.7237-13.6212-73.9581
64.1345-0.4797-0.60085.26783.740310.6931-0.13560.0836-0.4321-0.11650.2848-0.28730.70330.4341-0.14920.14130.0336-0.02760.16440.01030.239944.9337-14.9881-36.8261
73.6326-0.24060.73253.8319-0.87537.9096-0.04230.3542-0.26450.02090.1302-0.22370.2130.0557-0.08780.1792-0.0990.10470.4551-0.22110.273646.4708-13.0984-66.8903
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A1 - 180
2X-RAY DIFFRACTION1C1 - 9
3X-RAY DIFFRACTION2A181 - 276
4X-RAY DIFFRACTION3B0 - 99
5X-RAY DIFFRACTION4D1 - 115
6X-RAY DIFFRACTION5D116 - 210
7X-RAY DIFFRACTION6E0 - 115
8X-RAY DIFFRACTION7E116 - 250

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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