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- PDB-4mj1: unliganded BK Polyomavirus VP1 pentamer -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 4mj1
タイトルunliganded BK Polyomavirus VP1 pentamer
要素VP1 capsid protein
キーワードVIRAL PROTEIN / antiparallel beta sandwich / jelly-roll topology / polyomavirus / receptor switch / virus major capsid protein / attachment to host-cell surface receptors
機能・相同性
機能・相同性情報


caveolin-mediated endocytosis of virus by host cell / T=7 icosahedral viral capsid / endocytosis involved in viral entry into host cell / virion attachment to host cell / host cell nucleus / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能
Capsid protein VP1,Polyomavirus / Polyomavirus Vp1; Chain A / Capsid protein VP1,Polyomavirus / Polyomavirus capsid protein VP1 superfamily / Polyomavirus coat protein / Double-stranded DNA virus, group I, capsid / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Major capsid protein VP1 / Capsid protein VP1
類似検索 - 構成要素
生物種BK polyomavirus (ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å
データ登録者Neu, U. / Stroh, L.J. / Stehle, T.
引用ジャーナル: Plos Pathog. / 年: 2013
タイトル: A Structure-Guided Mutation in the Major Capsid Protein Retargets BK Polyomavirus.
著者: Neu, U. / Allen, S.A. / Blaum, B.S. / Liu, Y. / Frank, M. / Palma, A.S. / Stroh, L.J. / Feizi, T. / Peters, T. / Atwood, W.J. / Stehle, T.
履歴
登録2013年9月3日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02013年11月6日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年9月20日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: VP1 capsid protein
B: VP1 capsid protein
C: VP1 capsid protein
D: VP1 capsid protein
E: VP1 capsid protein
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)151,94315
ポリマ－151,3055
非ポリマー63810
水15,565864
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area24310 Å2
ΔGint-209 kcal/mol
Surface area44850 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)144.900, 152.290, 62.720
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number18
Space group name H-MP21212
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID詳細
11A
21B
31C
41D
51E

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 4

Dom-IDComponent-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
11ASNASNASPASPAA52 - 5927 - 34
21ASNASNASPASPBB52 - 5927 - 34
31ASNASNASPASPCC52 - 5927 - 34
41ASNASNASPASPDD52 - 5927 - 34
51ASNASNASPASPEE52 - 5927 - 34
12ASNASNLEULEUAA61 - 6936 - 44
22ASNASNLEULEUBB61 - 6936 - 44
32ASNASNLEULEUCC61 - 6936 - 44
42ASNASNLEULEUDD61 - 6936 - 44
52ASNASNLEULEUEE61 - 6936 - 44
13SERSERASPASPAA70 - 7845 - 53
23SERSERASPASPBB70 - 7845 - 53
33SERSERASPASPCC70 - 7845 - 53
43SERSERASPASPDD70 - 7845 - 53
53SERSERASPASPEE70 - 7845 - 53
14METMETALAALAAA84 - 9159 - 66
24METMETALAALABB84 - 9159 - 66
34METMETALAALACC84 - 9159 - 66
44METMETALAALADD84 - 9159 - 66
54METMETALAALAEE84 - 9159 - 66
15THRTHRSERSERAA117 - 12492 - 99
25THRTHRSERSERBB117 - 12492 - 99
35THRTHRSERSERCC117 - 12492 - 99
45THRTHRSERSERDD117 - 12492 - 99
55THRTHRSERSEREE117 - 12492 - 99
16LEULEUGLNGLNAA126 - 133101 - 108
26LEULEUGLNGLNBB126 - 133101 - 108
36LEULEUGLNGLNCC126 - 133101 - 108
46LEULEUGLNGLNDD126 - 133101 - 108
56LEULEUGLNGLNEE126 - 133101 - 108
17VALVALHISHISAA135 - 136110 - 111
27VALVALHISHISBB135 - 136110 - 111
37VALVALHISHISCC135 - 136110 - 111
47VALVALHISHISDD135 - 136110 - 111
57VALVALHISHISEE135 - 136110 - 111
18HISHISLEULEUAA138 - 159113 - 134
28HISHISLEULEUBB138 - 159113 - 134
38HISHISLEULEUCC138 - 159113 - 134
48HISHISLEULEUDD138 - 159113 - 134
58HISHISLEULEUEE138 - 159113 - 134
19METMETLEULEUAA161 - 165136 - 140
29METMETLEULEUBB161 - 165136 - 140
39METMETLEULEUCC161 - 165136 - 140
49METMETLEULEUDD161 - 165136 - 140
59METMETLEULEUEE161 - 165136 - 140
110ASNASNTHRTHRAA167 - 170142 - 145
210ASNASNTHRTHRBB167 - 170142 - 145
310ASNASNTHRTHRCC167 - 170142 - 145
410ASNASNTHRTHRDD167 - 170142 - 145
510ASNASNTHRTHREE167 - 170142 - 145
111GLYGLYPROPROAA175 - 179150 - 154
211GLYGLYPROPROBB175 - 179150 - 154
311GLYGLYPROPROCC175 - 179150 - 154
411GLYGLYPROPRODD175 - 179150 - 154
511GLYGLYPROPROEE175 - 179150 - 154
112PROPROALAALAAA182 - 184157 - 159
212PROPROALAALABB182 - 184157 - 159
312PROPROALAALACC182 - 184157 - 159
412PROPROALAALADD182 - 184157 - 159
512PROPROALAALAEE182 - 184157 - 159
113SERSERGLNGLNAA186 - 187161 - 162
213SERSERGLNGLNBB186 - 187161 - 162
313SERSERGLNGLNCC186 - 187161 - 162
413SERSERGLNGLNDD186 - 187161 - 162
513SERSERGLNGLNEE186 - 187161 - 162
114ASNASNALAALAAA190 - 195165 - 170
214ASNASNALAALABB190 - 195165 - 170
314ASNASNALAALACC190 - 195165 - 170
414ASNASNALAALADD190 - 195165 - 170
514ASNASNALAALAEE190 - 195165 - 170
115LEULEUSERSERAA197 - 213172 - 188
215LEULEUSERSERBB197 - 213172 - 188
315LEULEUSERSERCC197 - 213172 - 188
415LEULEUSERSERDD197 - 213172 - 188
515LEULEUSERSEREE197 - 213172 - 188
116GLUGLUGLYGLYAA216 - 227191 - 202
216GLUGLUGLYGLYBB216 - 227191 - 202
316GLUGLUGLYGLYCC216 - 227191 - 202
416GLUGLUGLYGLYDD216 - 227191 - 202
516GLUGLUGLYGLYEE216 - 227191 - 202
117PROPROASNASNAA231 - 238206 - 213
217PROPROASNASNBB231 - 238206 - 213
317PROPROASNASNCC231 - 238206 - 213
417PROPROASNASNDD231 - 238206 - 213
517PROPROASNASNEE231 - 238206 - 213
118LEULEUASPASPAA244 - 246219 - 221
218LEULEUASPASPBB244 - 246219 - 221
318LEULEUASPASPCC244 - 246219 - 221
418LEULEUASPASPDD244 - 246219 - 221
518LEULEUASPASPEE244 - 246219 - 221
119GLYGLYLEULEUAA251 - 253226 - 228
219GLYGLYLEULEUBB251 - 253226 - 228
319GLYGLYLEULEUCC251 - 253226 - 228
419GLYGLYLEULEUDD251 - 253226 - 228
519GLYGLYLEULEUEE251 - 253226 - 228
120SERSERSERSERAA258 - 273233 - 248
220SERSERSERSERBB258 - 273233 - 248
320SERSERSERSERCC258 - 273233 - 248
420SERSERSERSERDD258 - 273233 - 248
520SERSERSERSEREE258 - 273233 - 248
121GLNGLNLYSLYSAA277 - 287252 - 262
221GLNGLNLYSLYSBB277 - 287252 - 262
321GLNGLNLYSLYSCC277 - 287252 - 262
421GLNGLNLYSLYSDD277 - 287252 - 262
521GLNGLNLYSLYSEE277 - 287252 - 262
122PHEPHEASPASPAA75 - 7850 - 53
222PHEPHEASPASPBB75 - 7850 - 53
322PHEPHEASPASPCC75 - 7850 - 53
422PHEPHEASPASPDD75 - 7850 - 53
522PHEPHEASPASPEE75 - 7850 - 53

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要素

#1: タンパク質
VP1 capsid protein


分子量: 30261.039 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) BK polyomavirus (ウイルス) / プラスミド: pET15b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q85235, UniProt: P03088*PLUS
#2: 化合物
ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル


分子量: 92.094 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C3H8O3
#3: 化合物
ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド


分子量: 35.453 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 864 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.29 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.21 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5
詳細: 16-18 % PEG 3,350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.25 M LiCl , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1 Å
検出器タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年1月28日
放射モノクロメーター: Bartels monochromator (DCCM) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2→50 Å / Num. all: 94566 / Num. obs: 94342 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(F): -3 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 4.1 % / Biso Wilson estimate: 27.1 Å2 / Net I/σ(I): 11.01
反射 シェル解像度: 2→2.05 Å / 冗長度: 4.1 % / Mean I/σ(I) obs: 2.4 / Num. unique all: 6939 / % possible all: 98.4

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
RemDAqデータ収集
PHASER位相決定
REFMAC5.5.0102精密化
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3BWQ

3bwq


解像度: 2→47.42 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.96 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.941 / SU B: 7.547 / SU ML: 0.094 / Isotropic thermal model: isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.156 / ESU R Free: 0.139 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.19876 3296 3.5 %RANDOM
Rwork0.16091 ---
all0.16224 94340 --
obs0.16224 91044 99.78 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 18.461 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2→47.42 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数9843 0 35 864 10742
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.010.02210227
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d0.0010.026848
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.2461.95813934
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg0.819316768
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg6.25451312
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg37.43524.602465
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg12.537151640
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg22.1491558
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0750.21550
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0050.02111507
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other0.0010.021984
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it1.29346441
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_other0.58742601
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it1.865510448
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it2.32863786
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it3.18873465
Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / 数: 2205 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Auth asym-IDタイプRms dev position (Å)Weight position
Amedium positional0.160.5
Bmedium positional0.130.5
Cmedium positional0.130.5
Dmedium positional0.130.5
Emedium positional0.130.5
Amedium thermal0.62
Bmedium thermal0.62
Cmedium thermal0.622
Dmedium thermal0.72
Emedium thermal0.672
LS精密化 シェル解像度: 2→2.052 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.251 249 -
Rwork0.22 6567 -
obs-6816 98.45 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
11.14260.0804-0.03911.02070.08091.3260.0414-0.04210.19260.00110.0140.0265-0.27520.0162-0.05550.12340.03970.02380.0406-0.01320.110628.275249.021322.5809
21.8059-0.64241.8961.3485-1.3655.2198-0.0044-0.13960.0534-0.00760.07710.04680.0424-0.121-0.07260.0362-0.01930.04780.0235-0.03250.085238.827946.418419.9992
32.13680.4937-0.47660.9842-0.19161.64430.0116-0.00640.06020.03760.05290.104-0.0758-0.1618-0.06450.070.01940.02150.02580.00070.045622.230540.697519.7682
41.2174-0.38890.46421.4839-1.31744.95740.0380.10090.0732-0.1048-0.00180.0425-0.02030.0227-0.03620.0475-0.00690.02840.0117-0.00620.084932.165446.28912.2484
51.8687-0.4257-0.05121.5466-0.03640.9745-0.0136-0.10520.17410.08490.0384-0.25-0.07390.2381-0.02480.0848-0.0452-0.02630.1049-0.02770.139660.446244.024826.5536
61.21080.3842-0.45892.9232-2.10033.51630.08480.05590.1038-0.00380.073-0.03240.04610.0184-0.15780.0085-0.00180.00640.0957-0.0580.10162.514235.680818.1827
71.3817-0.4345-0.36531.36780.26171.52260.022-0.08370.15780.0830.0244-0.0544-0.14360.0225-0.04640.0558-0.0227-0.00770.07-0.02450.0851.335346.877922.4247
81.55030.0995-0.78181.6091-1.10874.78240.01310.17120.0862-0.1405-0.0124-0.07250.02320.0864-0.00070.0326-0.02150.00450.071-0.02790.102859.332841.74213.0212
91.41280.56140.54682.132-0.31450.71130.1335-0.0963-0.25060.24230.0024-0.35270.16980.1441-0.13590.13450.0659-0.08480.1596-0.01160.230565.758711.129626.4076
102.70441.2191-1.86121.8097-1.19434.50980.032-0.0625-0.2176-0.03910.0145-0.23010.0030.2233-0.04650.06490.0226-0.05890.0281-0.0280.136355.07717.694418.822
111.98711.04630.84081.96440.70531.472-0.02660.0584-0.067-0.09390.0548-0.2559-0.04330.199-0.02820.0510.01220.00620.0628-0.00070.147466.323921.553916.9732
122.3980.2018-1.99011.41580.48746.9981-0.00990.2079-0.1269-0.06790.0124-0.2230.0157-0.1723-0.00260.0396-0.0027-0.0110.0299-0.01620.150759.865711.154315.7712
133.85060.4319-7.91811.4149-0.140831.4213-0.1360.8937-0.0488-0.44720.05150.14140.2151-2.32790.08450.259-0.0253-0.03780.2964-0.01840.173227.9344-0.8335-5.6929
141.4088-0.4187-0.38720.92310.05280.3940.0023-0.078-0.20550.06660.0226-0.06620.1449-0.0719-0.02480.1223-0.035-0.0420.04590.03940.105137.9099-0.93718.859
151.8535-0.36830.54791.1053-0.0391.40180.05720.0906-0.03160.0108-0.0018-0.18480.06820.126-0.05540.0669-0.0186-0.00270.0231-0.0060.106746.41461.924111.7471
161.3132-0.3151-0.13321.91861.58574.99430.01580.0831-0.1029-0.201-0.0281-0.0454-0.1701-0.05760.01230.0407-0.0106-0.0180.01510.01490.073935.68180.96810.1431
170.8307-0.2147-0.38971.01470.34783.59410.00560.03980.0334-0.0287-0.02590.1037-0.1972-0.56130.02030.05620.00770.00870.12150.0310.089613.608822.93114.7725
181.328-0.43110.21071.3459-1.97845.41590.0498-0.0059-0.0867-0.0590.09560.13820.1668-0.6152-0.14540.0357-0.0252-0.00680.0996-0.00190.054311.716916.82810.7903
190.5679-0.1147-0.00381.46120.3591.07540.0279-0.0432-0.07090.06180.0270.020.0941-0.0668-0.05490.0316-0.00210.00230.06760.02870.040420.84216.022118.8721
201.05560.10031.01660.7363-0.20246.37360.00210.0997-0.041-0.05570.0228-0.0105-0.1011-0.0826-0.0250.01710.0150.02130.02910.02070.047417.214622.09839.1764
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A33 - 93
2X-RAY DIFFRACTION2A94 - 144
3X-RAY DIFFRACTION3A145 - 239
4X-RAY DIFFRACTION4A240 - 296
5X-RAY DIFFRACTION5B34 - 91
6X-RAY DIFFRACTION6B92 - 141
7X-RAY DIFFRACTION7B142 - 240
8X-RAY DIFFRACTION8B241 - 297
9X-RAY DIFFRACTION9C43 - 91
10X-RAY DIFFRACTION10C92 - 144
11X-RAY DIFFRACTION11C145 - 262
12X-RAY DIFFRACTION12C263 - 295
13X-RAY DIFFRACTION13D32 - 50
14X-RAY DIFFRACTION14D51 - 178
15X-RAY DIFFRACTION15D179 - 254
16X-RAY DIFFRACTION16D255 - 297
17X-RAY DIFFRACTION17E32 - 73
18X-RAY DIFFRACTION18E74 - 116
19X-RAY DIFFRACTION19E117 - 245
20X-RAY DIFFRACTION20E246 - 297

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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