登録情報 データベース : PDB / ID : 4m1u 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The crystal structure of Stx2 and a disaccharide ligand 要素Shiga toxin 2 A-subunit Shiga toxin 2 B subunit 詳細キーワード HYDROLASE / rRNA N-glycosylase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
hemolysis by symbiont of host erythrocytes / rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / toxin activity / negative regulation of translation / extracellular region 類似検索 - 分子機能 OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) - #70 / Shiga-like toxin, subunit A / Shiga-like toxin, beta subunit / Shiga-like toxin beta subunit / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Enterotoxin / Ribosome-inactivating protein conserved site ... OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) - #70 / Shiga-like toxin, subunit A / Shiga-like toxin, beta subunit / Shiga-like toxin beta subunit / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Enterotoxin / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Few Secondary Structures / Irregular / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Beta Barrel / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE / rRNA N-glycosylase / Shiga toxin 2 B subunit 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli O157:H7 (大腸菌)Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.56 Å 詳細データ登録者 Yin, J. / James, M.N.G. / Jacobson, J.M. / Kitov, P.I. / Bundle, D.R. / Mulvey, G. / Armstrong, G. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2014タイトル : The crystal structure of shiga toxin type 2 with bound disaccharide guides the design of a heterobifunctional toxin inhibitor.著者 : Jacobson, J.M. / Yin, J. / Kitov, P.I. / Mulvey, G. / Griener, T.P. / James, M.N. / Armstrong, G. / Bundle, D.R. 履歴 登録 2013年8月4日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2013年11月20日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2013年12月4日 Group : Database references改定 1.2 2014年2月19日 Group : Database references改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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