登録情報 | データベース: PDB / ID: 4jy9 |
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タイトル | X-ray snapshots of possible intermediates in the time course of synthesis and degradation of protein-bound Fe4S4 clusters |
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要素 | FEFE-HYDROGENASE MATURASE |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / Radical SAM Protein / FeFe-hydrogenase active site Assembly / Fe4S4 cluster / S-adenosyl-L-methionine |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
water-soluble vitamin biosynthetic process / sulfur compound biosynthetic process / : / : / 酸化還元酵素; 含硫化合物に対し酸化酵素として働く / : / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / transferase activity / oxidoreductase activity / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Biotin and Thiamin Synthesis associated domain / [FeFe]-hydrogenase maturation HydE, radical SAM / HydE/PylB-like / Biotin and thiamin synthesis-associated domain / Biotin and Thiamin Synthesis associated domain / Elp3/MiaB/NifB / Elongator protein 3, MiaB family, Radical SAM / Radical SAM superfamily / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM ...Biotin and Thiamin Synthesis associated domain / [FeFe]-hydrogenase maturation HydE, radical SAM / HydE/PylB-like / Biotin and thiamin synthesis-associated domain / Biotin and Thiamin Synthesis associated domain / Elp3/MiaB/NifB / Elongator protein 3, MiaB family, Radical SAM / Radical SAM superfamily / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / IRON/SULFUR CLUSTER / [FeFe] hydrogenase maturase subunit HydE類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Thermotoga maritima (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.6 Å |
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データ登録者 | Nicolet, Y. / Rohac, R. / Martin, L. / Fontecilla-Camps, J.C. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2013 タイトル: X-ray snapshots of possible intermediates in the time course of synthesis and degradation of protein-bound Fe4S4 clusters. 著者: Nicolet, Y. / Rohac, R. / Martin, L. / Fontecilla-Camps, J.C. |
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履歴 | 登録 | 2013年3月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年5月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年5月15日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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