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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4jkn | ||||||
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タイトル | Mercury Metallated Pseudomonas aeruginosa Azurin at 1.54 A | ||||||
![]() | Azurin | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT / Mercury metallation | ||||||
機能・相同性 | ![]() transition metal ion binding / periplasmic space / electron transfer activity / copper ion binding / zinc ion binding / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Zampino, A.P. / Masters, F.M. / Bladholm, E.L. / Berry, S.B. / Panzner, M.J. / Ziegler, C.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Mercury metallation of the copper protein azurin and structural insight into possible heavy metal reactivity. 著者: Zampino, A.P. / Masters, F.M. / Bladholm, E.L. / Panzner, M.J. / Berry, S.M. / Leeper, T.C. / Ziegler, C.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 300.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 249 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1e67S S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13961.799 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 21-148 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-HG / #3: 化合物 | ChemComp-NO3 / #4: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.97 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / pH: 5.5 詳細: 3.2 M ammonium sulfate, 0.5 M lithium nitrate, 50 mM sodium acetate, pH 5.5, soaked with 3 fold excess Mercury Chloride , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: SEALED TUBE / タイプ: BRUKER / 波長: 1.54 Å |
検出器 | タイプ: APEX II CCD / 検出器: CCD / 日付: 2011年11月11日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.536→28.24 Å / Num. obs: 73480 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(I): 4.5 |
反射 シェル | 解像度: 1.536→1.74 Å / % possible all: 90.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.536→19.66 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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