PDB-4j91: Diamond-shaped octameric structure of KtrA with ADP bound

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4j91

タイトル

Diamond-shaped octameric structure of KtrA with ADP bound

要素

Ktr system potassium uptake protein A

キーワード

METAL TRANSPORT / Diamond-shaped octameric ring / RCK domain / potassium transport regulation / KtrB membrane protein / cytosol

機能・相同性

機能・相同性情報

monoatomic cation transmembrane transporter activity / potassium ion transport / identical protein binding / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Bacillus subtilis (枯草菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.93 Å

データ登録者

Vieira-Pires, R.S. / Morais-Cabral, J.H.

引用

ジャーナル: Nature / 年: 2013
タイトル: The structure of the KtrAB potassium transporter
著者: Vieira-Pires, R.S. / Szollosi, A. / Morais-Cabral, J.H.

履歴

登録	2013年2月15日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2013年4月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年8月7日	Group: Database references
改定 1.2	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4j91.cif.gz	348.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4j91.ent.gz	290 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4j91.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j9/4j91 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j9/4j91	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4j7cC 4j90C 2hmtS 2hmuS 2hmvS 2hms 2hmw S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6s5n-2 6s7r-1 6s5o-2 6s5c-1 6s2j-1 4j90-1 6s5d-1 7bsl-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#38 - 2003年2月カリウムチャネル (Potassium Channels) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Ktr system potassium uptake protein A

B: Ktr system potassium uptake protein A

C: Ktr system potassium uptake protein A

D: Ktr system potassium uptake protein A

ヘテロ分子

101 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Ktr system potassium uptake protein A

B: Ktr system potassium uptake protein A

C: Ktr system potassium uptake protein A

D: Ktr system potassium uptake protein A

ヘテロ分子

A: Ktr system potassium uptake protein A

B: Ktr system potassium uptake protein A

C: Ktr system potassium uptake protein A

D: Ktr system potassium uptake protein A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
203 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	147.932, 84.630, 113.675
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 128.370, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
1	2	A
2	2	B
3	2	C
4	2	D

/ NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: タンパク質	Ktr system potassium uptake protein A / K(+)-uptake protein KtrA 分子量: 24916.760 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / 遺伝子: ktrA, yuaA, BSU31090 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL 21 (DE3) / 参照: UniProt: O32080
#2: 化合物	ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP 分子量: 427.201 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.8 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.05 % / Mosaicity: 0 °
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: 0.1M citrate pH5.6, 14.5% polyethylene glycol 2000, 0.2M ammonium sulphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ESRF

/ ビームライン: ID14-1 / 波長: 0.9334 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2011年6月19日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9334 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.781→89.123 Å / Num. all: 27727 / Num. obs: 27727 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 0.9 / 冗長度: 4.9 % / R_sym value: 0.053 / Net I/σ(I): 21.6

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) all	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	R_pim(I) all	R_rim(I) all	R_sym value	Net I/σ(I) obs	% possible all
2.78-2.93	4.8	0.925	0.827	0.9	19307	4004	0.41	0.925	0.827	2.3	99.1
2.93-3.11	4.9	0.477	0.427	1.8	18897	3819	0.21	0.477	0.427	4.2	99.9
3.11-3.32	4.9	0.254	0.227	3.4	17582	3575	0.113	0.254	0.227	7.6	99.9
3.32-3.59	4.9	0.12	0.107	7.1	16331	3346	0.054	0.12	0.107	15	99.8
3.59-3.93	4.9	0.078	0.07	10.7	15205	3096	0.035	0.078	0.07	20.9	99.7
3.93-4.4	4.9	0.042	0.037	18.8	13561	2779	0.019	0.042	0.037	32.8	99.9
4.4-5.08	4.9	0.032	0.029	23.9	11981	2459	0.014	0.032	0.029	42	99.9
5.08-6.22	4.9	0.029	0.026	25.5	10304	2121	0.013	0.029	0.026	42.4	99.9
6.22-8.8	4.8	0.023	0.021	27.5	7747	1626	0.011	0.023	0.021	51.3	99.9
8.8-42.315	4.5	0.021	0.018	31.3	4044	902	0.01	0.021	0.018	71.4	97.6

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALA	3.3.20	データスケーリング
PHASER		位相決定
直接法		位相決定
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
DNA		データ収集
XSCALE		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 2HMT, 2HMU, 2HMV

2hmt

2hmu

2hmv

解像度: 2.93→89.12 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.916 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.888 / WR_factor R_free: 0.2616 / WR_factor R_work: 0.2358 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / FOM work R set: 0.782 / SU B: 44.29 / SU ML: 0.384 / SU R Cruickshank DPI: 0.4183 / SU R_free: 0.4501 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.45 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT U VALUES : RESIDUAL ONLY

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2784	1193	5 %	RANDOM
R_work	0.2516	-	-	-
all	0.253	23792	-	-
obs	0.253	23792	99.68 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 245.02 Å² / B_iso mean: 96.577 Å² / B_iso min: 22.39 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-2.85 Å²	0 Å²	0.5 Å²
2-	-	-1.34 Å²	0 Å²
3-	-	-	4.8 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.93→89.12 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6626	0	108	0	6734

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.011	0.019	6735
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.352	1.978	9123
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.876	5	835
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.271	25.254	295
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.811	15	1196
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	22.248	15	28
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.099	0.2	1066
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	4906

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: TIGHT THERMAL / Weight position: 0.5

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	1038	5.81
1	2	B	1038	10.03
1	3	C	1038	9.09
1	4	D	1038	8.3
2	1	A	396	13.31
2	2	B	396	16.7
2	3	C	396	16.2
2	4	D	396	7.51

LS精密化シェル

解像度: 2.93→3.006 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.414	79	-
R_work	0.356	1607	-
all	-	1686	-
obs	-	-	99.88 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.5381	0.512	-0.4034	4.489	2.5252	3.8412	-0.3787	0.0398	0.4018	-0.0519	0.0752	0.5479	-0.8107	-0.1811	0.3035	0.3364	0.0714	-0.101	0.0316	0.0043	0.3209	21.3653	43.5005	-14.8893
2	12.2878	-3.2004	-2.2549	21.8591	-8.6273	4.5019	-1.0699	0.7191	-0.0761	0.3683	1.2614	0.5866	0.0371	-0.9525	-0.1915	0.3661	0.2053	-0.2326	0.6756	-0.2357	0.5639	13.4545	33.4765	-21.6918
3	1.0921	-1.1133	1.3715	3.6406	-2.127	4.3093	-0.1299	0.3111	-0.1704	-0.4389	0.063	-0.0731	0.056	0.1931	0.0669	0.1479	-0.1237	0.0484	0.1695	-0.0813	0.2517	28.2195	25.376	-17.6741
4	21.1065	-5.738	21.1392	21.5267	16.4071	45.797	2.212	-0.4607	-2.0096	-4.8187	-0.439	0.4951	-2.5556	-1.1135	-1.7731	1.1651	0.0234	-0.0364	0.3676	0.2237	1.2887	48.3667	26.2895	-17.4284
5	17.1028	-3.2589	-9.571	11.407	-10.9908	25.443	-2.1977	-0.8229	-0.6148	1.5918	-0.469	-1.1592	1.517	2.7053	2.6667	0.9877	0.4847	0.0879	0.5478	0.3001	0.8231	65.0164	25.751	-10.9057
6	8.0756	2.0139	-1.1353	14.0976	-9.6467	8.6104	-0.6194	-0.8997	-0.5335	0.4353	0.1139	-0.9002	-0.1056	0.4866	0.5055	0.1348	0.1627	0.1496	0.4923	0.2401	0.8033	59.6452	28.0178	-12.4412
7	3.7436	-1.4807	-0.6324	2.9276	-0.6977	4.1314	0.225	0.1545	-0.4759	-0.3699	0.0892	0.1592	0.5461	0.1127	-0.3142	0.1432	0.0066	-0.0695	0.0395	-0.0842	0.2594	30.8099	9.6985	-3.7703
8	12.3891	-2.6124	-2.6458	9.6628	-3.6329	8.5754	-0.2407	-0.5152	-0.4191	0.0462	0.0536	0.0568	-0.0037	0.4918	0.1871	0.0949	0.0496	-0.0774	0.076	-0.0578	0.2179	36.1529	12.5368	3.5111
9	6.272	0.79	2.1384	1.6409	-1.0489	6.382	0.0801	-0.3613	-0.2709	0.2495	0.306	-0.0526	0.2307	-0.1777	-0.3861	0.1295	0.0559	-0.0199	0.1197	-0.0285	0.2311	31.8832	19.1077	7.4439
10	0.8718	-0.4333	2.0614	0.5352	-0.9613	6.3119	-0.2721	0.0785	-0.0682	0.2619	0.1373	-0.1896	-0.7246	0.3231	0.1348	0.2517	-0.0237	-0.0567	0.1441	-0.0916	0.2688	32.2081	31.1028	-2.6245
11	8.8031	0.346	-2.1506	3.9483	0.4184	8.2855	-0.3601	0.5279	-1.1846	-0.2289	0.1106	0.2768	-0.1623	-0.4989	0.2496	0.2061	-0.1535	0.1524	0.1627	-0.1552	0.3554	47.4568	36.2482	-28.6581
12	3.6449	-3.182	2.1892	8.331	-0.3203	7.2812	0.1077	0.4374	-0.5722	0.3644	-0.1714	0.376	0.5869	0.1154	0.0637	0.2314	-0.1759	0.1208	0.2895	-0.2243	0.3739	49.5617	34.1359	-31.5394
13	2.737	-0.2733	-0.0373	6.5185	1.0499	3.879	-0.155	-0.0294	-0.3832	-0.168	-0.1869	-0.2464	0.219	0.0823	0.3419	0.1656	0.1686	0.0723	0.2018	0.0908	0.2387	7.8339	8.7685	26.7531
14	4.0727	-1.3189	0.7394	4.1113	0.5976	4.8753	-0.294	-0.1571	-0.8239	-0.2959	0.0622	0.6698	0.0493	-0.4572	0.2318	0.1066	0.0576	0.0279	0.2329	0.0585	0.2745	-4.2241	10.2015	26.0221
15	5.1255	1.6137	-1.3847	4.5693	0.2042	0.5397	0.0043	-0.421	0.2422	0.0873	0.0108	0.3055	-0.0916	-0.0072	-0.0151	0.166	0.2162	-0.0665	0.3886	-0.0226	0.1783	-1.7537	25.0905	30.6278
16	0.5151	-0.1346	2.2327	7.7635	-2.5072	10.2125	0.1014	-0.0483	-0.0345	0.4875	-0.1841	-0.6095	0.0365	-0.1598	0.0826	0.4733	0.0599	-0.1808	0.5343	0.032	0.0971	19.9044	30.0385	44.0828
17	0.1701	0.3871	-0.9405	5.5551	2.6129	10.2512	0.0888	0.0002	0.0095	-1.1785	-0.287	-0.1062	-1.2677	-0.1621	0.1982	0.7034	-0.0731	-0.215	0.5567	0.1913	0.4989	31.3494	30.0291	59.1873
18	0.9181	2.2798	-0.1916	7.7045	0.1325	2.4734	0.2527	-0.3087	-0.2713	-0.3727	-0.5041	-1.4661	-0.2929	0.2614	0.2513	0.7052	-0.1799	-0.056	0.6778	0.1744	0.7519	30.3999	26.7255	53.8226
19	2.8066	-0.4607	-0.1811	3.2702	-0.3294	4.668	-0.1223	-0.1098	0.4194	0.194	0.1082	-0.0624	-0.6135	0.0433	0.0141	0.2436	0.0917	-0.031	0.0707	-0.0474	0.1256	19.1277	40.5228	24.4913
20	3.4136	1.3779	-2.4546	1.7376	-0.5289	1.9789	-0.0075	-0.3677	-0.3475	0.0151	-0.0433	-0.5295	-0.074	0.2259	0.0509	0.1782	0.1509	-0.0176	0.3023	0.0738	0.2338	18.7196	22.7505	28.7714
21	34.0784	-6.2892	-9.2675	2.9937	-1.3747	9.5643	-1.2487	-0.1787	-1.3426	1.2533	0.5673	-0.2637	-0.9097	0.3998	0.6814	0.7139	0.4628	-0.3824	0.9066	-0.2812	0.6593	17.8166	16.3336	49.5136
22	4.481	2.7059	-5.0766	5.9984	-12.5625	26.5171	-1.501	-0.0171	0.5355	0.0249	-0.5424	-0.6607	-0.234	1.5315	2.0434	1.1611	0.0696	0.0464	1.2866	0.225	1.3299	-1.1741	18.0416	58.9803
23	2.535	4.0262	3.0825	14.0104	-3.2919	14.6377	0.2239	-0.8947	-0.5396	1.379	0.4367	-0.4228	-0.81	-1.739	-0.6606	0.8945	0.2555	0.0303	1.5323	0.5071	0.2609	10.0811	18.1801	62.2555
24	10.0943	6.0251	4.6317	5.1831	2.7172	2.9465	0.4553	-1.3577	-0.5958	0.9488	-0.4257	0.0051	0.0242	-0.3256	-0.0297	0.7387	0.1068	-0.0227	0.7871	0.2805	0.2228	8.3156	18.094	56.59

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	8 - 77
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	78 - 96
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	97 - 142
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	143 - 155
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	156 - 174
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	177 - 222
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	8 - 65
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	66 - 79
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	80 - 104
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	105 - 138
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	139 - 173
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	174 - 222
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	8 - 45
14	X-RAY DIFFRACTION	14	C	46 - 99
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	100 - 127
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	128 - 157
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	161 - 182
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	183 - 222
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	8 - 96
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	97 - 143
21	X-RAY DIFFRACTION	21	D	144 - 157
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	158 - 166
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	167 - 185
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	186 - 222

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-位相決定

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)