PDB-4j0q: Crystal structure of Pseudomonas putida elongation factor Tu (EF-Tu)

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4j0q

タイトル

Crystal structure of Pseudomonas putida elongation factor Tu (EF-Tu)

要素

Elongation factor Tu-A

キーワード

TRANSLATION / GDP / GTP / GTPase / elongation / pseudomonas

機能・相同性

機能・相同性情報

protein-synthesizing GTPase / guanosine tetraphosphate binding / translation elongation factor activity / GTPase activity / GTP binding / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Pseudomonas putida (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.294 Å

データ登録者

Scotti, J.S. / McDonough, M.A. / Schofield, C.J.

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2014
タイトル: Human oxygen sensing may have origins in prokaryotic elongation factor Tu prolyl-hydroxylation
著者: Scotti, J.S. / Leung, I.K.H. / Ge, W. / Bentley, M.A. / Paps, J. / Kramer, H.B. / Lee, J. / Aik, W. / Choi, H. / Paulsen, S.M. / Bowman, L.A.H. / Loik, N.D. / Horita, S. / Ho, C.H. / Kershaw, ...

履歴

登録	2013年1月31日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2014年2月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2014年9月17日	Group: Database references
改定 1.2	2014年10月1日	Group: Database references
改定 1.3	2017年11月15日	Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version
改定 1.4	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4j0q.cif.gz	732 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4j0q.ent.gz	607.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4j0q.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j0/4j0q ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j0/4j0q	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4iw3SC 4j25C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6i8r-d 2hdn-1 2hdn-5 3u6k-1 5opd-1 5w75-3 3u2q-d 4ajy-d 4w9l-3 5nvy-4 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#81 - 2006年9月伸長因子 (Elongation Factors) 類似性 (13) #121 - 2010年1月 70Sリボソーム (70S Ribosomes) 類似性 (13) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (13) #104 - 2008年8月セレノシステイン合成酵素 (Selenocysteine Synthase) 類似性 (6) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Elongation factor Tu-A

B: Elongation factor Tu-A

C: Elongation factor Tu-A

D: Elongation factor Tu-A

E: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

240 kDa, 5 ポリマー
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1

A: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
48.3 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
48 kDa, 1 ポリマー
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3

C: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
48 kDa, 1 ポリマー
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4

D: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
48 kDa, 1 ポリマー
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5

E: Elongation factor Tu-A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
48.2 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	212.505, 155.624, 99.298
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 114.760, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	E-403- MES

-
タンパク質 , 1種, 5分子 ABCDE

#1: タンパク質	Elongation factor Tu-A / EF-Tu-A 分子量: 47378.891 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pseudomonas putida (バクテリア) / 株: KT2440 / 遺伝子: PP_0440, tuf-1, tufA / プラスミド: pET28 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q88QP8

-
非ポリマー , 5種, 334分子

#2: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#3: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸分子量: 195.237 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#5: 化合物	ChemComp-MPD / (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL / (S)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル分子量: 118.174 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₂ / コメント: 沈殿剤*YM
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 316 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.15 Å³/Da / 溶媒含有率: 60.91 % / Mosaicity: 0.49 °
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: 0.1M MgOAc, 20% MPD, 0.05M MES pH 5.6, 10mM SrCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

Diamond

/ ビームライン: I03 / 波長: 0.9763 Å

検出器

タイプ: Pilatus 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年10月23日

放射

モノクロメーター: DOUBLE CRYSTAL MONOCHROMATOR / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9763 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.294→50 Å / Num. all: 130376 / Num. obs: 129510 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 6.6 % / B_iso Wilson estimate: 64.07 Å² / R_merge(I) obs: 0.056 / Χ²: 1.144 / Net I/σ(I): 10.3

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2.3-2.38	5.6	0.826	12208	1.082	1	93.9
2.38-2.48	6.5	0.698	12989	1.089	1	99.9
2.48-2.59	6.6	0.462	12977	1.119	1	100
2.59-2.73	6.7	0.308	12981	1.168	1	100
2.73-2.9	6.6	0.195	13018	1.21	1	100
2.9-3.12	6.9	0.118	13047	1.227	1	100
3.12-3.44	6.7	0.076	13014	1.172	1	100
3.44-3.93	6.8	0.057	13034	1.182	1	99.9
3.93-4.95	6.9	0.044	13088	1.066	1	100
4.95-50	6.7	0.041	13154	1.112	1	99.6

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	4.27 Å	48.24 Å
Translation	4.27 Å	48.24 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.5.2	位相決定
PHENIX	1.8.1_1168	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
GDA		データ収集

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4IW3

4iw3

解像度: 2.294→48.242 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / FOM work R set: 0.8132 / SU ML: 0.27 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.85 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2129	2006	1.55 %	Random
R_work	0.1736	-	-	-
obs	0.1742	129450	99.95 %	-
all	-	129510	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 184.07 Å² / B_iso mean: 67.1045 Å² / B_iso min: 18.67 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.294→48.242 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14005	0	221	316	14542

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	14538
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.254	19836
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.066	2333
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	2554
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.381	5325

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	Num. reflection obs	% reflection obs (%)
2.2938-2.3511	0.3401	131	0.2927	8023	8154	8154	87
2.3511-2.4147	0.2853	140	0.2595	9090	9230	9230	99
2.4147-2.4858	0.2804	146	0.2353	9144	9290	9290	100
2.4858-2.566	0.2677	142	0.2134	9175	9317	9317	100
2.566-2.6577	0.2659	144	0.2066	9145	9289	9289	100
2.6577-2.7641	0.273	145	0.2054	9207	9352	9352	100
2.7641-2.8899	0.2276	144	0.202	9148	9292	9292	100
2.8899-3.0422	0.2456	147	0.1987	9171	9318	9318	100
3.0422-3.2328	0.2611	145	0.1987	9213	9358	9358	100
3.2328-3.4823	0.2733	139	0.203	9188	9327	9327	100
3.4823-3.8326	0.2189	149	0.1893	9191	9340	9340	100
3.8326-4.3869	0.1838	143	0.1521	9241	9384	9384	100
4.3869-5.5258	0.152	145	0.1374	9211	9356	9356	100
5.5258-48.2526	0.2075	146	0.1577	9297	9443	9443	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.2213	-0.3821	-0.2411	2.4511	-0.1708	1.1991	-0.0727	-0.394	-0.3227	0.494	0.0939	0.0513	-0.0458	0.0734	-0.0501	0.4193	0.1972	0.003	0.448	0.0812	0.4145	183.2399	-55.1897	29.3018
2	2.3551	-0.1269	-0.4356	1.4559	-0.5921	1.8071	-0.0677	-0.0257	-0.0897	0.1708	0.1101	-0.0435	-0.0276	0.0949	-0.0386	0.3616	0.122	0.0016	0.3608	0.0188	0.349	185.7051	-52.6268	20.0715
3	1.1455	0.0387	1.1163	0.8388	0.2306	1.9456	0.0011	0.1791	-0.052	-0.0294	0.0664	-0.1504	0.1623	-0.0279	-0.0727	0.3201	-0.0264	0.0263	0.3633	-0.1024	0.3711	223.2926	-54.6067	35.1149
4	3.0581	0.4349	0.2448	2.082	0.0458	2.3038	0.0588	0.3853	0.9049	-0.1895	0.0385	0.1687	-0.7766	0.1234	-0.1112	0.6115	-0.0653	0.0441	0.4729	0.1331	0.5883	209.4757	-36.1441	20.5034
5	1.6507	-0.4548	-0.2995	1.9391	-0.0691	1.4631	0.1631	-0.1656	-0.2668	0.1453	-0.3101	0.3952	0.2288	-0.1662	0.0929	0.7043	-0.0111	0.1533	0.3515	-0.0799	0.521	157.1046	-5.8917	7.2835
6	1.9443	0.0856	-0.3277	1.9831	0.3066	1.4046	0.2285	0.1564	-0.0656	-0.0936	-0.2122	-0.0395	0.2001	0.1801	-0.005	0.5307	0.068	0.112	0.342	-0.0532	0.3844	162.443	-0.6862	0.7605
7	1.5031	0.7753	0.3916	2.2565	-0.8738	2.6033	-0.0829	-0.1239	-0.1781	-0.1734	0.1179	-0.2771	0.1666	0.1934	-0.0343	0.2814	0.0709	0.017	0.3814	-0.0331	0.2977	177.0042	-38.3541	-2.2962
8	1.6871	-0.3876	-0.2512	2.7833	-0.0369	2.1012	0.122	-0.5184	0.5924	0.213	-0.0086	-0.8465	-0.3119	0.54	-0.0888	0.3835	-0.0708	-0.0126	0.6329	-0.1415	0.6788	187.9296	-14.4297	2.2494
9	2.1152	-0.4498	-0.0902	2.015	0.4542	2.2136	0.1301	0.2844	0.0955	-0.2706	-0.2477	-0.1036	-0.2828	0.1637	0.0951	0.3079	0.0164	0.0061	0.3182	0.0767	0.3608	154.1404	-35.6726	24.4903
10	2.032	-0.8107	-0.0461	1.5617	-0.301	2.9492	0.1196	0.0305	0.1024	0.0666	-0.1488	0.0893	-0.2235	0.2065	0.0283	0.2676	-0.0443	-0.0015	0.2159	0.0393	0.291	151.3373	-39.0636	33.3825
11	0.9846	0.1875	0.6296	1.8857	-0.5782	1.0608	0.2251	-0.1226	0.27	0.3572	0.0372	0.7853	-0.3653	-0.3862	-0.0914	0.8451	-0.0145	0.4099	0.3449	-0.0562	0.8747	133.7901	-2.6423	33.4592
12	1.6191	0.0127	-0.4282	2.6391	-0.4279	1.8865	0.1719	-0.515	0.252	1.314	-0.0287	-0.0438	-0.5259	0.37	-0.0728	1.2366	-0.2567	0.1036	0.537	-0.1296	0.4449	149.3191	-15.9438	50.4882
13	2.5176	-0.0207	-1.235	2.9064	-0.1693	3.0747	-0.3792	0.2301	-0.3311	-0.0733	0.0575	0.145	0.2832	-0.2376	0.2721	0.3537	-0.0761	0.065	0.2604	-0.0378	0.3696	169.4378	-55.6258	-29.0639
14	1.5116	-0.1338	0.2764	0.7281	-0.1479	1.1836	0.0797	0.6261	0.4764	0.1331	-0.0721	-0.1291	-0.2009	0.1972	0.445	0.6994	-0.2475	-0.4591	1.2476	0.3559	0.8477	155.992	-31.269	-55.536
15	1.3303	-1.1552	-0.0389	1.1081	-0.0379	1.5008	-0.3178	0.9391	0.4761	-0.3371	-0.0919	-0.0009	-0.0163	-0.2795	0.3104	0.7114	-0.3168	-0.3247	1.3226	0.2157	0.7627	157.208	-38.6016	-57.935
16	1.1135	-0.4025	0.0818	1.7815	0.0174	1.5874	-0.1246	1.0246	-0.3751	-0.3198	-0.1777	0.2844	0.4267	-0.4153	0.2727	0.8692	-0.3214	-0.0245	1.3929	-0.2197	0.6145	160.8946	-58.0177	-58.3688
17	1.2251	0.493	-0.4075	1.1284	-0.1884	1.3127	-0.5778	0.2493	0.2875	0.2333	-0.1419	-0.0631	-0.1754	-0.2308	0.03	0.6395	0.0654	-0.6238	1.1983	-0.3535	0.8556	127.4364	-31.9228	-26.1869
18	2.4909	0.0286	0.1558	4.6794	-0.4611	1.9682	-0.239	-0.0306	0.0312	-0.0413	-0.0022	0.122	0.0878	-0.2123	0.2491	0.5002	-0.0691	0.1067	0.4972	-0.1434	0.5639	142.9595	-52.8213	1.1821
19	1.7019	-0.0986	0.2943	1.0266	-0.619	1.0563	-0.2206	-0.2242	-0.3364	-0.1572	-0.0614	0.2945	0.3167	-0.6586	0.2624	0.5395	-0.1662	0.1074	0.7629	-0.274	0.7526	130.8672	-55.7599	-3.3211
20	1.963	0.1589	0.2262	1.0661	-0.3726	3.1204	-0.5064	0.0737	-0.4503	-0.1342	-0.0202	0.1394	0.0816	-0.4977	0.3728	0.4155	-0.1935	0.0229	1.0354	-0.3434	0.8566	123.2375	-55.0077	-7.5348

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(CHAIN A AND RESID 9:43)	A	9 - 43
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(CHAIN A AND RESID 60:206)	A	60 - 206
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(CHAIN A AND RESID 207:300)	A	207 - 300
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(CHAIN A AND RESID 301:397)	A	301 - 397
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(CHAIN B AND RESID 9:60)	B	9 - 60
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(CHAIN B AND RESID 61:206)	B	61 - 206
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(CHAIN B AND RESID 207:297)	B	207 - 297
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(CHAIN B AND RESID 298:397)	B	298 - 397
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(CHAIN C AND RESID 9:60)	C	9 - 60
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(CHAIN C AND RESID 61:206)	C	61 - 206
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(CHAIN C AND RESID 207:296)	C	207 - 296
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(CHAIN C AND RESID 297:397)	C	297 - 397
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(CHAIN D AND RESID 9:206)	D	9 - 206
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(CHAIN D AND RESID 207:245)	D	207 - 245
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(CHAIN D AND RESID 246:322)	D	246 - 322
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(CHAIN D AND RESID 323:397)	D	323 - 397
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(CHAIN E AND RESID 9:206)	E	9 - 206
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(CHAIN E AND RESID 207:241)	E	207 - 241
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(CHAIN E AND RESID 242:362)	E	242 - 362
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(CHAIN E AND RESID 363:397)	E	363 - 397

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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