PDB-4hps: Crystal Structure of a Pyrrolidone-carboxylate peptidase 1 (targe...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4hps

タイトル

Crystal Structure of a Pyrrolidone-carboxylate peptidase 1 (target ID NYSGRC-012831) from Xenorhabdus bovienii SS-2004 in space group P21

要素

Pyrrolidone-carboxylate peptidase

キーワード

HYDROLASE / Structural Genomics / NYSGRC / PSI-Biology / New York Structural Genomics Research Consortium

機能・相同性

機能・相同性情報

pyroglutamyl-peptidase I / pyroglutamyl-peptidase activity / proteolysis / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Xenorhabdus bovienii (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.55 Å

データ登録者

Ghosh, A. / Almo, S.C. / New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC)

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Crystal Structure of a Pyrrolidone-carboxylate peptidase 1 (target ID NYSGRC-012831) from Xenorhabdus bovienii SS-2004 in space group P21
著者: Ghosh, A. / Ahmed, A. / Banu, R. / Bhoshle, R. / Bonanno, J. / Chamala, S. / Chowdhury, S. / Fiser, A. / Glenn, A.S. / Hillerich, B. / Khafizov, K. / Lafleur, J. / Love, J.D. / Seidel, R. / ...

履歴

登録	2012年10月24日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年11月14日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月15日	Group: Database references / Refinement description / カテゴリ: citation_author / software Item: _citation_author.name / _software.classification ..._citation_author.name / _software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version
改定 1.2	2023年9月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb4hps.ent.gz	282.9 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	4hps_full_validation.pdf.gz	471.8 KB	表示
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CIF形式データ	4hps_validation.cif.gz	57.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hp/4hps ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hp/4hps	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4gxhS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1wns-d 7b0f-d 4avc-d 3eqx-d 4ahc-1 5w8s-1 3b3d-d 3ewz-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: NYSGRC-012831

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Pyrrolidone-carboxylate peptidase

B: Pyrrolidone-carboxylate peptidase

C: Pyrrolidone-carboxylate peptidase

D: Pyrrolidone-carboxylate peptidase

ヘテロ分子

99.5 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	77.06, 73.34, 80.54
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 111.960, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

詳細

There is one biological unit (a tetramer) in the asymmetric unit (chains A, B, C, and D)

#1: タンパク質	Pyrrolidone-carboxylate peptidase / 5-oxoprolyl-peptidase / Pyroglutamyl-peptidase I 分子量: 24747.102 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 1-206 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Xenorhabdus bovienii (バクテリア) 株: SS-2004 / 遺伝子: pcp, XBJ1_1667 / プラスミド: pSGC-His / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) pRIL / 参照: UniProt: D3V0W1, pyroglutamyl-peptidase I
#2: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 15 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 782 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.13 Å³/Da / 溶媒含有率: 42.32 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 0.8 M Lithium Chloride, 0.1 M Tris:HCl, 32% (w/v) PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 77 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

NSLS

/ ビームライン: X29A / 波長: 1.075 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2012年9月21日

放射

モノクロメーター: ROSENBAUM-ROCK DOUBLE CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.075 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.55→50 Å / Num. all: 115820 / Num. obs: 115757 / % possible obs: 96.1 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 5.7 % / B_iso Wilson estimate: 19.8 Å² / R_merge(I) obs: 0.055 / Χ²: 1.252 / Net I/σ(I): 12.8

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
1.55-1.58	5.7	0.8	5637	1.227	1	94
1.58-1.61	5.7	0.712	5649	1.278	1	94.2
1.61-1.64	5.7	0.592	5695	1.35	1	94.6
1.64-1.67	5.7	0.48	5653	1.283	1	94.7
1.67-1.71	5.7	0.41	5722	1.343	1	94.9
1.71-1.75	5.7	0.354	5677	1.272	1	95
1.75-1.79	5.8	0.299	5717	1.297	1	95.4
1.79-1.84	5.8	0.229	5765	1.284	1	95.8
1.84-1.89	5.7	0.206	5718	1.52	1	95.7
1.89-1.95	5.8	0.161	5781	1.449	1	96.2
1.95-2.02	5.8	0.118	5787	1.262	1	96.4
2.02-2.1	5.8	0.096	5800	1.306	1	96.5
2.1-2.2	5.8	0.079	5858	1.246	1	97
2.2-2.32	5.8	0.069	5852	1.233	1	97.2
2.32-2.46	5.7	0.06	5860	1.123	1	97.5
2.46-2.65	5.7	0.054	5904	1.192	1	97.8
2.65-2.92	5.7	0.045	5910	1.103	1	98.1
2.92-3.34	5.6	0.039	5976	1.104	1	98.2
3.34-4.21	5.5	0.032	5958	1.093	1	98.2
4.21-50	5.6	0.029	5901	1.077	1	95.4

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX	1.8.1_1168	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
CBASS		データ収集
HKL-3000		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4GXH

4gxh

解像度: 1.55→39.762 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.23 / SU ML: 0.15 / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 22.08 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1999	5783	5 %	RANDOM
R_work	0.1726	-	-	-
obs	0.174	115697	96.03 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 99.04 Å² / B_iso mean: 31.7635 Å² / B_iso min: 12.64 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.55→39.762 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6284	0	15	782	7081

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	6498
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.072	8897
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.072	1046
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	1161
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.242	2361

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.5505-1.5681	0.2777	180	0.2447	3520	3700	93
1.5681-1.5865	0.3005	190	0.2486	3560	3750	94
1.5865-1.6059	0.311	174	0.2576	3618	3792	94
1.6059-1.6262	0.3052	185	0.2775	3577	3762	94
1.6262-1.6476	0.2595	186	0.2301	3578	3764	95
1.6476-1.6702	0.2249	170	0.1989	3644	3814	95
1.6702-1.694	0.2278	202	0.2029	3568	3770	95
1.694-1.7193	0.256	184	0.1933	3617	3801	95
1.7193-1.7462	0.2295	198	0.193	3623	3821	95
1.7462-1.7748	0.2102	177	0.1946	3579	3756	95
1.7748-1.8054	0.2475	207	0.1975	3631	3838	95
1.8054-1.8382	0.2214	194	0.189	3686	3880	96
1.8382-1.8736	0.2499	186	0.208	3633	3819	96
1.8736-1.9118	0.2464	200	0.2278	3599	3799	95
1.9118-1.9534	0.2377	205	0.1918	3631	3836	96
1.9534-1.9988	0.2122	188	0.1768	3657	3845	96
1.9988-2.0488	0.1852	197	0.1704	3694	3891	97
2.0488-2.1042	0.2177	189	0.1729	3664	3853	96
2.1042-2.1661	0.1936	213	0.1698	3706	3919	97
2.1661-2.2361	0.1825	206	0.1661	3670	3876	97
2.2361-2.316	0.2059	194	0.1671	3724	3918	97
2.316-2.4087	0.2064	193	0.1664	3705	3898	97
2.4087-2.5183	0.1875	194	0.1754	3738	3932	98
2.5183-2.651	0.2305	191	0.1791	3741	3932	98
2.651-2.8171	0.2282	186	0.1758	3744	3930	98
2.8171-3.0345	0.2144	187	0.1744	3795	3982	98
3.0345-3.3398	0.2079	221	0.1722	3754	3975	98
3.3398-3.8227	0.1552	205	0.1521	3772	3977	98
3.8227-4.8149	0.1448	188	0.1333	3766	3954	97
4.8149-39.7748	0.1885	193	0.1642	3720	3913	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.5884	3.9225	6.3888	7.5302	3.912	6.7218	-0.1805	-0.335	-0.008	-0.3402	-0.0369	-0.1284	-0.3419	-0.2723	0.2298	0.1394	0.0076	0.0314	0.1299	0.0675	0.1494	-35.3734	-49.899	11.6569
2	6.9697	3.5675	3.5655	6.6084	5.3948	8.0053	0.2703	-0.383	-0.0872	0.3495	-0.011	-0.6593	0.2221	0.4008	-0.2756	0.2124	0.0034	-0.0556	0.2426	0.0459	0.2528	-31.2331	-47.4087	7.1585
3	1.4842	0.0724	0.2916	2.151	-1.0999	1.7985	0.0028	-0.2501	-0.1672	0.191	0.0664	-0.0957	0.1637	0.1033	-0.0799	0.1767	0.0452	-0.0171	0.1672	-0.0016	0.1692	-43.6186	-51.171	8.6465
4	6.4369	-7.057	-1.833	9.5887	4.144	4.3775	0.4136	0.1792	-0.3071	-0.1683	-0.1626	0.0892	0.4497	-0.2845	-0.2394	0.2587	-0.0411	-0.0717	0.1463	0.0684	0.2872	-55.4839	-60.8157	1.4892
5	2.2264	1.0267	-0.8731	2.4523	-1.0588	2.3623	0.0197	-0.2864	0.0509	0.2191	0.0572	0.1322	-0.039	0.0227	-0.0825	0.1431	0.0332	-0.0183	0.1588	0.005	0.1534	-49.1377	-44.1513	6.9928
6	7.2777	-1.2392	-2.6382	9.1292	0.2356	4.9165	-0.0112	0.5985	-0.7736	-0.7367	-0.0781	0.3466	0.5464	-0.1093	0.0797	0.2664	0.0338	-0.0218	0.2063	-0.0703	0.2508	-38.7481	-51.2497	-13.0973
7	4.9242	1.2771	2.3165	7.7347	0.9345	8.0931	-0.0003	-0.4361	0.4037	0.4742	-0.1149	-0.2258	-0.5441	0.132	-0.0607	0.1465	-0.0307	-0.0676	0.1469	0.0098	0.1889	-36.3402	-38.4879	4.7803
8	9.2347	-3.5127	5.1038	4.0429	-2.5095	7.2797	-0.2174	0.0716	-0.1801	0.5856	-0.0831	0.0594	-0.302	0.0951	0.2886	0.2237	-0.043	0.0339	0.1005	-0.0818	0.1408	-63.0017	-53.3943	-45.8167
9	1.3095	-0.1118	-0.2985	1.2084	0.394	2.7611	-0.0169	0.1757	-0.1931	-0.1168	0.0599	0.1284	0.4021	-0.176	-0.0357	0.2535	-0.0423	-0.0095	0.1348	-0.0128	0.1633	-59.5678	-52.2215	-45.4601
10	2.9393	3.522	-0.3683	5.4346	-1.8381	3.135	0.188	-0.1604	-0.3182	0.3092	-0.0066	-0.1238	0.8651	0.5306	-0.1884	0.4701	0.1654	-0.0106	0.255	-0.0505	0.2884	-43.3834	-60.9691	-38.5058
11	2.1666	-4.2124	-0.5485	9.347	-0.6059	3.3503	0.2005	0.4361	0.1888	-0.5203	-0.2086	-0.5012	0.1218	0.4099	-0.076	0.1822	-0.0322	0.0216	0.2725	-0.0573	0.1968	-44.6457	-46.1053	-48.9581
12	1.843	-1.2801	-1.0222	2.0194	1.4483	2.8717	0.01	0.1077	0.0197	-0.0517	0.0862	-0.0879	0.0057	0.0798	-0.1159	0.1831	-0.038	0.003	0.1169	-0.0123	0.1494	-53.3831	-44.8041	-43.2869
13	9.7294	0.0197	-0.0369	9.4032	-2.9033	7.2502	-0.2119	-0.4986	-0.7998	0.3042	-0.0026	-0.7226	0.6753	0.3193	0.1645	0.2669	0.0333	0.0291	0.1531	0.033	0.2266	-61.0208	-52.5917	-24.1077
14	3.3446	-0.9489	0.7753	7.4511	-2.9654	8.0377	0.0702	0.147	0.1771	-0.1769	-0.1202	0.105	-0.3221	-0.1072	0.007	0.1422	-0.0029	-0.036	0.1057	-0.0285	0.1343	-64.7993	-40.9074	-42.4108
15	7.1483	0.0783	-1.8237	2.2095	-0.3258	3.8614	-0.3616	0.1763	-0.1032	0.0891	0.1379	-0.4752	-0.3922	1.3945	0.1392	0.2783	-0.1403	0.0072	0.7385	-0.0611	0.284	-23.2157	-36.7019	-24.9955
16	1.7953	0.021	0.9456	1.3125	-0.011	1.1812	-0.156	0.3765	0.234	-0.2505	0.1179	-0.2854	-0.4208	1.369	0.0418	0.3015	-0.2327	0.0376	0.7519	-0.0383	0.2591	-27.0768	-36.6811	-32.9792
17	2.6259	-1.0281	0.8373	5.9345	0.5708	2.4145	-0.349	0.3661	0.3458	-0.047	0.1567	0.0974	-0.5746	0.8365	0.1731	0.3199	-0.1593	-0.0154	0.3764	-0.0097	0.2117	-38.1259	-34.06	-39.6345
18	1.5996	0.2943	0.0058	1.7679	0.2761	2.8464	-0.0638	0.3772	-0.0966	-0.1989	0.1794	-0.1888	0.0886	1.0608	-0.0927	0.1955	-0.0048	0.0139	0.503	-0.1016	0.2068	-30.864	-44.3192	-33.9541
19	8.6637	4.5568	4.4549	7.8084	-0.8147	6.8502	-0.0338	0.054	0.3274	-0.0961	0.0488	0.5302	-0.4776	-0.4118	0.0231	0.1922	0.0167	0.0058	0.2028	-0.0083	0.1644	-38.8235	-37.415	-14.4678
20	3.4656	-1.2726	-2.6624	2.9562	0.7423	2.3094	0.3352	1.0888	-0.3118	0.0624	-0.3151	-0.3735	0.3309	1.4328	-0.1876	0.1914	0.2606	-0.0459	0.9372	-0.1729	0.3489	-23.3992	-48.9503	-25.0079
21	5.4274	1.3951	-1.596	2.9455	-0.8058	5.7549	-0.1322	0.025	-0.0029	-0.1694	-0.0157	0.3449	0.0224	-0.7022	0.1274	0.1469	0.0699	-0.0115	0.2375	-0.0001	0.2073	-78.0457	-39.3227	-12.8131
22	1.6246	-0.2368	0.5261	1.7497	0.587	1.9399	0.0076	-0.2709	0.1112	0.0578	-0.054	0.3088	-0.1856	-0.6608	0.0431	0.1489	0.0598	0.0223	0.3155	0.0237	0.2109	-74.3127	-38.6626	-4.8324
23	5.1139	-0.9493	3.3448	2.1506	-7.1452	6.6536	-0.1133	0.0913	0.3606	-0.1772	-0.257	-0.2426	-0.2389	0.0426	0.3241	0.3038	0.0768	-0.006	0.1472	-0.0435	0.2389	-60.972	-28.8249	-1.0947
24	1.0881	0.3032	0.4818	2.1336	0.8087	2.4895	0.0308	-0.2499	-0.044	0.1972	0.0116	0.0721	0.1202	-0.4204	-0.0483	0.1106	0.0091	0.0089	0.2116	0.051	0.1615	-69.366	-45.6303	-1.6934
25	2.0712	-5.1463	4.3933	2.1232	1.5527	9.124	-0.0818	0.0873	0.545	-0.07	0.0281	-0.453	-0.5141	0.6078	0.049	0.1795	-0.0174	0.0147	0.1504	0.0298	0.2148	-62.5426	-38.8125	-23.2382
26	5.064	1.7943	-3.1743	7.0146	-2.7327	7.617	0.0871	-0.4893	-0.2635	0.1273	0.0057	0.4978	0.4491	-0.4304	-0.0889	0.1332	-0.0421	-0.0264	0.2543	0.0378	0.2246	-76.6994	-51.4036	-12.2831

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid -4 through 18 )	A
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 19 through 34 )	A
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 35 through 84 )	A
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 85 through 104 )	A
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 105 through 168 )	A
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 169 through 185 )	A
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 186 through 206 )	A
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid -2 through 18 )	B
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 19 through 84 )	B
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 85 through 104 )	B
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 105 through 117 )	B
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 118 through 168 )	B
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 169 through 185 )	B
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 186 through 206 )	B
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 2 through 35 )	C
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 36 through 84 )	C
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 85 through 117 )	C
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 118 through 168 )	C
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 169 through 185 )	C
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 186 through 206 )	C
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 2 through 35 )	D
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 36 through 84 )	D
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 85 through 104 )	D
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 105 through 168 )	D
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 169 through 185 )	D
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 186 through 206 )	D

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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