+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4gjx | ||||||
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Title | Crystal structure of CD23 lectin domain mutant D258A | ||||||
Components | Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor | ||||||
Keywords | IMMUNE SYSTEM / Receptor | ||||||
Function / homology | Function and homology information low-affinity IgE receptor activity / B cell antigen processing and presentation / Fc receptor-mediated immune complex endocytosis / positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin / NOTCH2 intracellular domain regulates transcription / macrophage activation / IgE binding / positive regulation of killing of cells of another organism / positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process / Interleukin-10 signaling ...low-affinity IgE receptor activity / B cell antigen processing and presentation / Fc receptor-mediated immune complex endocytosis / positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin / NOTCH2 intracellular domain regulates transcription / macrophage activation / IgE binding / positive regulation of killing of cells of another organism / positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process / Interleukin-10 signaling / positive regulation of nitric-oxide synthase activity / integrin binding / carbohydrate binding / protease binding / Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling / immune response / external side of plasma membrane / extracellular exosome / metal ion binding / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.8 Å | ||||||
Authors | Yuan, D. / Sutton, B.J. / Dhaliwal, B. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2013 Title: Ca2+-dependent Structural Changes in the B-cell Receptor CD23 Increase Its Affinity for Human Immunoglobulin E. Authors: Yuan, D. / Keeble, A.H. / Hibbert, R.G. / Fabiane, S. / Gould, H.J. / McDonnell, J.M. / Beavil, A.J. / Sutton, B.J. / Dhaliwal, B. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4gjx.cif.gz | 437.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4gjx.ent.gz | 363.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4gjx.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 4gjx_validation.pdf.gz | 491.8 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 4gjx_full_validation.pdf.gz | 500.2 KB | Display | |
Data in XML | 4gjx_validation.xml.gz | 39.4 KB | Display | |
Data in CIF | 4gjx_validation.cif.gz | 53.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gj/4gjx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gj/4gjx | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 4g96C 4g9aC 4gi0C 4gj0C 4gk1C 4gkoC 2h2rS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1 / Refine code: 4
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