PDB-4gbj: Crystal structure of NAD-binding 6-phosphogluconate dehydrogenase...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4gbj

タイトル

Crystal structure of NAD-binding 6-phosphogluconate dehydrogenase from Dyadobacter fermentans

要素

6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Structural Genomics / PSI-Biology / Midwest Center for Structural Genomics / MCSG

機能・相同性

機能・相同性情報

organic acid catabolic process / NAD binding / NADP binding / oxidoreductase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Dyadobacter fermentans (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.05 Å

データ登録者

Michalska, K. / Holowicki, J. / Clancy, S. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG)

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Crystal structure of NAD-binding 6-phosphogluconate dehydrogenase from Dyadobacter fermentans
著者: Michalska, K. / Holowicki, J. / Clancy, S. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG)

履歴

登録	2012年7月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年9月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年11月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4gbj.cif.gz	453.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4gbj.ent.gz	375.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4gbj.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4gbj_validation.pdf.gz	434.9 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4gbj_full_validation.pdf.gz	436.6 KB	表示
XML形式データ	4gbj_validation.xml.gz	49.6 KB	表示
CIF形式データ	4gbj_validation.cif.gz	67 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gb/4gbj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gb/4gbj	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	4dll-d 3o8q-d 1rv8-2 6eod-1 3pgj-2 3ilm-d 6me9-2 1zp2-2 3e0j-4 4o8k-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: MCSG-APC103387

類似構造データ

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その他のデータベース

TargetTrack: MCSG-APC103387

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (2) #111 - 2009年3月ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase) 類似性 (1) #228 - 2018年12月酵素の指向性進化 (Directed Evolution of Enzymes) 類似性 (1)

登録構造単位

A: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

B: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

C: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

D: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

129 kDa, 4 ポリマー
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1

B: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

A: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ソフトウェアが定義した集合体
64.4 kDa, 2 ポリマー
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2

C: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

D: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

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3

A: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

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4

B: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

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32.2 kDa, 1 ポリマー
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5

C: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

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32.2 kDa, 1 ポリマー
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6

D: 6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding

ヘテロ分子

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32.2 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	79.633, 89.645, 151.506
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

詳細

THE AUTHOR STATES THAT THE BIOLOGICAL UNIT OF THIS PROTEIN IS UNKNOWN.

#1: タンパク質	6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding 分子量: 32170.340 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Dyadobacter fermentans (バクテリア) 株: DSM 18053 / 遺伝子: Dfer_3638 / プラスミド: pMCSG57 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) Magic / 参照: UniProt: C6VV20
#2: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 436 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.1 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.46 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97931 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2012年7月14日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97931 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.05→50 Å / Num. all: 68406 / Num. obs: 68343 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 6.4 % / B_iso Wilson estimate: 29.45 Å² / R_merge(I) obs: 0.107 / Net I/σ(I): 18.4
反射シェル	解像度: 2.05→2.09 Å / 冗長度: 6.3 % / R_merge(I) obs: 0.75 / Mean I/σ(I) obs: 2.3 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SBC-Collect		データ収集
SHELX		モデル構築
MLPHARE		位相決定
直接法		モデル構築
BUCCANEER		モデル構築
Coot		モデル構築
BUSTER	2.10.0	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
SHELX		位相決定
直接法		位相決定
BUCCANEER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 2.05→30.01 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.946 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.9341 / Isotropic thermal model: isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
詳細: HYDROGEN ATOMS HAVE BEEN ADDED AT THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1973	1380	2.02 %	thin resolution shells
R_work	0.1601	-	-	-
obs	0.1609	68270	99.32 %	-
all	-	68270	-	-

原子変位パラメータ

B_iso mean: 41.47 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	3.7956 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-9.0994 Å²	0 Å²
3-	-	-	5.3038 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.241 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.05→30.01 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8706	0	4	436	9146

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数	Restraint function	Weight
X-RAY DIFFRACTION	t_bond_d	0.012	17629	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_angle_deg	1.11	31976	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_dihedral_angle_d		4900	SINUSOIDAL	2
X-RAY DIFFRACTION	t_incorr_chiral_ct
X-RAY DIFFRACTION	t_pseud_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_trig_c_planes		213	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_gen_planes		2562	HARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_it		17629	HARMONIC	20
X-RAY DIFFRACTION	t_nbd		6	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_omega_torsion	3.84
X-RAY DIFFRACTION	t_other_torsion	2.96
X-RAY DIFFRACTION	t_improper_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_chiral_improper_torsion		1187	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_sum_occupancies
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_distance
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_ideal_dist_contact		19578	SEMIHARMONIC	4

LS精密化シェル

解像度: 2.05→2.1 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2632	69	1.5 %
R_work	0.1905	4538	-
all	0.1915	4607	-
obs	-	-	99.32 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0	2.839	-2.8138	6.9481	-1.5706	1.2114	0.0171	-0.3399	-0.4454	-0.0297	-0.0965	-0.0641	0.2876	-0.3969	0.0794	-0.2631	-0.0993	0.152	-0.1755	0.142	0.2666	40.8574	26.4954	68.2435
2	6.3576	0.9872	-0.8235	1.9678	0.3907	2.7393	-0.1952	0.5247	-0.5442	0.059	-0.0825	0.1015	0.2237	-0.5442	0.2778	-0.2552	-0.0506	0.0828	-0.0063	-0.1136	-0.0598	43.5785	38.0273	60.4906
3	2.5187	-0.0394	-0.5013	0.3455	0.2309	1.2908	0.0085	-0.1313	-0.1468	0.0518	-0.046	0.0417	0.0967	-0.0702	0.0376	-0.0364	-0.0065	0.015	-0.0851	0.0061	-0.0376	71.3403	40.2658	64.3835
4	5.5495	2.812	-0.5679	1.3857	-0.4882	2.9924	-0.0551	-0.4911	-0.2081	0.1834	0.0707	0.093	0.3806	-0.4121	-0.0156	0.0245	-0.0416	-0.0128	-0.0365	0.1003	-0.0074	71.3298	31.1652	66.8302
5	1.6806	-0.4609	0.876	3.1517	-0.33	2.2117	-0.0448	0.0989	-0.3428	0.1387	0.0644	0.2328	0.3523	-0.2234	-0.0195	-0.0403	-0.0122	0.0268	-0.0723	-0.0113	-0.0428	67.2991	36.9979	50.2687
6	1.9289	-1.2664	2.5161	2.3848	-1.532	1.774	0.0505	-0.0753	-0.1616	0.0556	0.038	-0.0273	0.5376	0.0057	-0.0885	0.1282	0.0213	0.0179	-0.0932	-0.0162	-0.0093	76.4582	28.4773	56.5991
7	0.5483	0.1112	1.1587	1.4077	2.8393	1.8406	0.0239	0.0257	-0.1165	-0.1509	0.0091	0.0714	0.0842	-0.0754	-0.033	-0.0298	-0.042	0.0496	0.0056	-0.0652	0.0086	55.3047	-14.8867	70.7759
8	1.1681	-1.3361	0.8878	5.6565	2.6191	0	-0.0145	0.2688	-0.5012	-0.0589	0.0156	0.0756	0.2613	-0.0933	-0.0011	-0.1127	-0.1026	0.0502	0.1308	-0.152	-0.0534	55.684	-19.3358	67.0604
9	5.1458	-1.6207	-1.251	2.2589	0.4512	2.7375	0.0558	0.5119	-0.158	-0.1432	-0.0954	-0.0428	0.0215	0.0825	0.0396	-0.1559	-0.0313	0.0138	0.0353	-0.006	-0.1752	58.6125	-5.9662	74.6362
10	2.1494	0.0091	0.0941	0.6394	-0.0112	1.0994	0.0036	0.1926	-0.0721	-0.0822	-0.0193	0.0632	0.1115	-0.0333	0.0156	-0.0318	-0.0202	-0.013	-0.0625	-0.015	-0.0353	31.8203	-3.7385	87.744
11	1.9247	-1.2412	-0.1326	0.016	-0.7681	0.8183	0.1578	0.319	-0.2935	-0.0787	-0.0942	0.0393	0.1333	0.1325	-0.0636	0.0086	0.0186	0.0022	-0.0083	-0.0558	-0.0276	40.5882	-8.7159	88.9536
12	0.5495	-0.2588	0.1578	2.0118	0.0829	1.4721	0.0591	-0.025	-0.1229	0.033	-0.0211	0.0521	0.1458	0.0867	-0.038	-0.0041	-0.0011	-0.0063	-0.0399	0.0028	0.0064	37.2088	-11.4245	97.4308
13	6.3918	2.9104	2.9104	3.5089	2.9104	3.4552	0.1294	-0.4571	0.3849	0.4468	-0.2083	0.0446	-0.2162	0.436	0.0789	-0.1563	-0.152	0.0297	0.1807	-0.0911	-0.186	25.2884	-2.97	64.1574
14	5.2494	2.1144	-1.2861	3.2038	-0.6095	0.9246	0.107	-0.5442	-0.0494	0.0104	-0.3139	-0.3661	0.0306	0.5442	0.2069	-0.2186	0.0613	-0.013	0.1891	0.0469	-0.1842	28.1719	-11.363	56.8659
15	5.7558	0.35	-0.1461	2.8866	-0.5532	5.325	0.2331	-0.4514	0.228	-0.0556	-0.2754	0.2196	0.1895	0.5442	0.0423	-0.1405	0.0084	0.0041	-0.0833	-0.0264	-0.1483	16.1202	-13.2881	58.9274
16	1.086	-0.5007	1.0274	0.9949	-0.9514	1.4873	-0.1654	-0.2235	0.0838	0.2392	0.1547	-0.0716	-0.1065	-0.1386	0.0106	-0.0126	0.0226	0.0147	-0.0448	-0.0041	-0.0682	-0.2851	1.7696	46.6649
17	2.4257	-0.7896	0.0423	0.7196	-0.3848	1.2796	-0.2266	-0.5324	0.0398	0.1137	0.177	-0.1081	-0.0501	0.1336	0.0496	-0.0494	0.0126	-0.0273	0.0506	-0.0082	-0.0972	9.4375	2.7271	41.9099
18	0.6492	-1.354	-2.1665	2.7264	-0.0864	3.5721	0.0737	-0.3539	0.2643	0.0598	0.0167	-0.1319	-0.3316	0.3369	-0.0905	0.0172	-0.0347	-0.0238	-0.0196	-0.0466	-0.0334	7.8891	12.8694	39.3876
19	2.9215	1.8353	-0.4577	1.5589	0.2223	2.1773	-0.0088	-0.1002	0.2769	-0.1273	-0.1023	0.2377	0.0072	-0.5442	0.1111	-0.2268	0.0037	0.0345	0.1732	-0.0122	-0.1257	44.6011	6.0198	41.1807
20	4.207	0.684	-1.3739	1.2049	2.2137	1.9949	0.0071	-0.1276	0.0874	-0.0288	-0.1762	0.1474	-0.196	-0.314	0.1691	-0.1124	0.0237	0.0313	0.0643	-0.0222	-0.0891	53.0095	10.3134	42.2105
21	2.52	0.9326	-0.1454	1.3763	0.2902	3.0359	0.0891	-0.4076	0.2797	0.2069	-0.0818	0.0975	-0.1722	-0.5442	-0.0072	-0.0967	0.0572	0.0601	0.084	-0.0166	-0.0899	56.2994	10.4441	49.7951
22	0.0006	-0.0382	0.9835	0.2061	-0.4929	1.1095	-0.0641	-0.2051	-0.0317	0.0989	0.2116	0.0153	0.0374	-0.3931	-0.1475	-0.0064	0.0137	0.0262	0.0146	0.0503	-0.0213	76.6219	-8.4094	46.2733
23	2.9638	-0.3029	-1.1908	0	1.0532	0.1729	0.042	-0.1895	-0.1064	0.2671	-0.0211	0.0962	0.0992	-0.2554	-0.0209	-0.0686	-0.0617	0.0249	0.0594	0.1186	0.0337	65.3406	-13.3429	42.4966
24	1.1199	0.315	-0.0917	0.9304	-0.3561	1.341	-0.0069	-0.0738	-0.089	0.0406	0.0818	0.0633	0.0891	-0.2233	-0.0749	-0.0319	-0.0231	0.0094	0.0018	0.034	-0.0264	69.6964	-4.2799	32.0432

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	{A\|1 - A\|52}	A	1 - 52
2	X-RAY DIFFRACTION	2	{A\|53 - A\|155}	A	53 - 155
3	X-RAY DIFFRACTION	3	{A\|156 - A\|210}	A	156 - 210
4	X-RAY DIFFRACTION	4	{A\|211 - A\|234}	A	211 - 234
5	X-RAY DIFFRACTION	5	{A\|235 - A\|274}	A	235 - 274
6	X-RAY DIFFRACTION	6	{A\|275 - A\|293}	A	275 - 293
7	X-RAY DIFFRACTION	7	{B\|4 - B\|16}	B	4 - 16
8	X-RAY DIFFRACTION	8	{B\|17 - B\|47}	B	17 - 47
9	X-RAY DIFFRACTION	9	{B\|48 - B\|161}	B	48 - 161
10	X-RAY DIFFRACTION	10	{B\|162 - B\|212}	B	162 - 212
11	X-RAY DIFFRACTION	11	{B\|213 - B\|255}	B	213 - 255
12	X-RAY DIFFRACTION	12	{B\|256 - B\|293}	B	256 - 293
13	X-RAY DIFFRACTION	13	{C\|3 - C\|41}	C	3 - 41
14	X-RAY DIFFRACTION	14	{C\|42 - C\|101}	C	42 - 101
15	X-RAY DIFFRACTION	15	{C\|102 - C\|157}	C	102 - 157
16	X-RAY DIFFRACTION	16	{C\|158 - C\|212}	C	158 - 212
17	X-RAY DIFFRACTION	17	{C\|213 - C\|274}	C	213 - 274
18	X-RAY DIFFRACTION	18	{C\|275 - C\|294}	C	275 - 294
19	X-RAY DIFFRACTION	19	{D\|4 - D\|108}	D	4 - 108
20	X-RAY DIFFRACTION	20	{D\|109 - D\|125}	D	109 - 125
21	X-RAY DIFFRACTION	21	{D\|126 - D\|171}	D	126 - 171
22	X-RAY DIFFRACTION	22	{D\|172 - D\|220}	D	172 - 220
23	X-RAY DIFFRACTION	23	{D\|221 - D\|234}	D	221 - 234
24	X-RAY DIFFRACTION	24	{D\|235 - D\|293}	D	235 - 293

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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