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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4dxt | ||||||
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タイトル | Human SUN2 (AA 522-717) | ||||||
![]() | SUN domain-containing protein 2 | ||||||
![]() | STRUCTURAL PROTEIN / beta-sandwich / LINC complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() nuclear migration along microfilament / nucleokinesis involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration / nuclear matrix anchoring at nuclear membrane / cytoskeleton-nuclear membrane anchor activity / meiotic nuclear membrane microtubule tethering complex / lamin binding / nuclear migration / nuclear inner membrane / centrosome localization / protein-membrane adaptor activity ...nuclear migration along microfilament / nucleokinesis involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration / nuclear matrix anchoring at nuclear membrane / cytoskeleton-nuclear membrane anchor activity / meiotic nuclear membrane microtubule tethering complex / lamin binding / nuclear migration / nuclear inner membrane / centrosome localization / protein-membrane adaptor activity / Meiotic synapsis / mitotic spindle organization / meiotic cell cycle / condensed nuclear chromosome / nuclear envelope / microtubule binding / nuclear membrane / chromosome, telomeric region / endosome membrane / positive regulation of cell migration / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sosa, B. / Schwartz, T.U. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: LINC Complexes Form by Binding of Three KASH Peptides to Domain Interfaces of Trimeric SUN Proteins. 著者: Sosa, B.A. / Rothballer, A. / Kutay, U. / Schwartz, T.U. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 52 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 422.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 424.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 22136.816 Da / 分子数: 1 / 断片: SUN domain (UNP residues 522-717) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-K / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.74 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.11 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 16% PEG3350, 0.2 M potassium thiocyanate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 8.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2010年10月17日 |
放射 | モノクロメーター: DOUBLE CRYSTAL SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9795 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→56.7 Å / Num. obs: 12305 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): 3.5 / 冗長度: 5.9 % / Rmerge(I) obs: 0.048 / Net I/σ(I): 20 |
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.3 Å / 冗長度: 6.1 % / Rmerge(I) obs: 0.57 / Mean I/σ(I) obs: 3.5 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.86 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 53.87 Å2 / ksol: 0.32 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 51.694 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.22→56.66 Å
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拘束条件 |
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