- PDB-4c2z: Human N-myristoyltransferase (NMT1) with Myristoyl-CoA and inhibi... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4c2z
タイトル
Human N-myristoyltransferase (NMT1) with Myristoyl-CoA and inhibitor bound
要素
GLYCYLPEPTIDE N-TETRADECANOYLTRANSFERASE 1
キーワード
TRANSFERASE / MYRISTOYLATION
機能・相同性
機能・相同性情報
myristoyltransferase activity / peptidyl-lysine N6-myristoyltransferase activity / N-terminal peptidyl-glycine N-myristoylation / Late Phase of HIV Life Cycle / cellular ketone metabolic process / regulation of opsin-mediated signaling pathway / Activation, myristolyation of BID and translocation to mitochondria / glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase / glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase activity / protein localization to membrane ...myristoyltransferase activity / peptidyl-lysine N6-myristoyltransferase activity / N-terminal peptidyl-glycine N-myristoylation / Late Phase of HIV Life Cycle / cellular ketone metabolic process / regulation of opsin-mediated signaling pathway / Activation, myristolyation of BID and translocation to mitochondria / glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase / glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase activity / protein localization to membrane / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基以外のアシル基を移すもの / Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade / in utero embryonic development / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9783 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.08→89 Å / Num. obs: 50468 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 7.1 % / Rmerge(I) obs: 0.15 / Net I/σ(I): 12.9
反射 シェル
解像度: 2.08→2.14 Å / 冗長度: 7.1 % / Rmerge(I) obs: 0.69 / Mean I/σ(I) obs: 3.4 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0033
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: OTHER 開始モデル: NONE 解像度: 2.08→89.56 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.959 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.913 / SU B: 5.388 / SU ML: 0.141 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.221 / ESU R Free: 0.196 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.23814
2515
5 %
RANDOM
Rwork
0.16939
-
-
-
obs
0.17273
47889
99.92 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK