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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4bct | ||||||
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タイトル | Crystal structure of kiwi-fruit allergen Act d 2 | ||||||
![]() | THAUMATIN-LIKE PROTEIN | ||||||
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機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Pavkov-Keller, T. / Bublin, M. / Jankovic, M. / Breiteneder, H. / Keller, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of Kiwi-Fruit Allergen Act D 2 著者: Pavkov-Keller, T. / Bublin, M. / Jankovic, M. / Breiteneder, H. / Keller, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 103.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 84 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21631.193 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 25-225 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-EPE / ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 38 % / 解説: NONE |
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結晶化![]() | 詳細: 22-30% PEG 6000, PH 6.8-7.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 0.98→50 Å / Num. obs: 97776 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 2.5 / 冗長度: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.04 / Net I/σ(I): 29.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() 開始モデル: NONE 解像度: 0.98→50 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.981 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.976 / SU B: 0.398 / SU ML: 0.01 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.018 / ESU R Free: 0.019 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES - REFINED INDIVIDUALLY
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 10.476 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 0.98→50 Å
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拘束条件 |
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