プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.75→68.9 Å / Num. obs: 91637 / % possible obs: 71.5 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.27 % / Biso Wilson estimate: 16.596 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.06 / Net I/σ(I): 11.7
反射 シェル
解像度: 1.75→1.82 Å / 冗長度: 1.39 % / Rmerge(I) obs: 0.21 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / % possible all: 9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0117
精密化
d*TREK
データ削減
d*TREK
データスケーリング
AMoRE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: INTERNAL RAT LDHA STRUCTURE 解像度: 1.75→49.21 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.964 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.948 / SU B: 4.491 / SU ML: 0.076 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.166 / ESU R Free: 0.14 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. DISORDERED SIDE-CHAINS HAVE BEEN TRUNCATED. DIFFERENCE DENSITY CONSISTENT WITH AN ADDITIONAL BINDING SITE FOR TETRAZOLE LIGAND VISIBLE AT ...詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. DISORDERED SIDE-CHAINS HAVE BEEN TRUNCATED. DIFFERENCE DENSITY CONSISTENT WITH AN ADDITIONAL BINDING SITE FOR TETRAZOLE LIGAND VISIBLE AT SYMMETRY CONTACT, HOWEVER, NOT CLEAR ENOUGH TO BE MODELLED.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1935
4534
5 %
RANDOM
Rwork
0.15792
-
-
-
obs
0.15969
86532
71.06 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK