登録情報 | データベース: PDB / ID: 3wyj |
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タイトル | Structure of E. coli undecaprenyl diphosphate synthase in complex with BPH-789 |
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要素 | Ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase ((2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific) |
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キーワード | TRANSFERASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / Z-farnesyl diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / polyprenyltransferase activity / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / manganese ion binding ...Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / Z-farnesyl diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / polyprenyltransferase activity / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / manganese ion binding / regulation of cell shape / cell cycle / cell division / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / plasma membrane / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Undecaprenyl pyrophosphate synthetase / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase-like, conserved site / Undecaprenyl pyrophosphate synthase family signature. / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Putative undecaprenyl diphosphate synthase / Decaprenyl diphosphate synthase-like superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-H78 / Ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase ((2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli K-12 (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Gao, J. / Ko, T.P. / Huang, C.H. / Oldfield, E. / Guo, R.T. |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2015 タイトル: Antibacterial drug leads: DNA and enzyme multitargeting. 著者: Zhu, W. / Wang, Y. / Li, K. / Gao, J. / Huang, C.H. / Chen, C.C. / Ko, T.P. / Zhang, Y. / Guo, R.T. / Oldfield, E. |
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履歴 | 登録 | 2014年8月29日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2015年2月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年8月24日 | Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: citation / database_2 / struct_site Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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