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- PDB-3v83: The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 3v83
タイトルThe 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
要素Serotransferrin
キーワードMETAL TRANSPORT / iron binding domain / iron carrier/transporter / transferrin receptor / serum
機能・相同性
機能・相同性情報


iron chaperone activity / transferrin receptor binding / Transferrin endocytosis and recycling / basal part of cell / positive regulation of cell motility / endocytic vesicle / positive regulation of bone resorption / positive regulation of phosphorylation / clathrin-coated pit / ERK1 and ERK2 cascade ...iron chaperone activity / transferrin receptor binding / Transferrin endocytosis and recycling / basal part of cell / positive regulation of cell motility / endocytic vesicle / positive regulation of bone resorption / positive regulation of phosphorylation / clathrin-coated pit / ERK1 and ERK2 cascade / ferric iron binding / osteoclast differentiation / actin filament organization / basal plasma membrane / cellular response to iron ion / Post-translational protein phosphorylation / clathrin-coated endocytic vesicle membrane / Iron uptake and transport / regulation of iron ion transport / HFE-transferrin receptor complex / ferrous iron binding / regulation of protein stability / recycling endosome / positive regulation of receptor-mediated endocytosis / multicellular organismal-level iron ion homeostasis / Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) / antibacterial humoral response / late endosome / positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process / Platelet degranulation / Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / Clathrin-mediated endocytosis / iron ion transport / cytoplasmic vesicle / secretory granule lumen / vesicle / blood microparticle / transmembrane transporter binding / intracellular iron ion homeostasis / early endosome / endosome membrane / apical plasma membrane / endoplasmic reticulum lumen / positive regulation of DNA-templated transcription / perinuclear region of cytoplasm / enzyme binding / cell surface / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / plasma membrane
類似検索 - 分子機能
Serotransferrin, mammalian / Transferrin-like domain signature 2. / Transferrin family, iron binding site / Transferrin-like domain signature 1. / Transferrin-like domain signature 3. / Transferrin / Transferrin-like domain / Transferrin / Transferrin-like domain profile. / Transferrin ...Serotransferrin, mammalian / Transferrin-like domain signature 2. / Transferrin family, iron binding site / Transferrin-like domain signature 1. / Transferrin-like domain signature 3. / Transferrin / Transferrin-like domain / Transferrin / Transferrin-like domain profile. / Transferrin / Periplasmic binding protein-like II / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
BICARBONATE ION / : / Serotransferrin
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.102 Å
データ登録者Noinaj, N. / Steere, A. / Mason, A.B. / Buchanan, S.K.
引用ジャーナル: Nature / 年: 2012
タイトル: Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
著者: Noinaj, N. / Easley, N.C. / Oke, M. / Mizuno, N. / Gumbart, J. / Boura, E. / Steere, A.N. / Zak, O. / Aisen, P. / Tajkhorshid, E. / Evans, R.W. / Gorringe, A.R. / Mason, A.B. / Steven, A.C. / Buchanan, S.K.
履歴
登録2011年12月22日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02012年2月15日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12012年2月29日Group: Database references
改定 1.22012年4月18日Group: Database references
改定 1.32024年11月20日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Serotransferrin
B: Serotransferrin
C: Serotransferrin
D: Serotransferrin
E: Serotransferrin
F: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)472,50588
ポリマ－462,9236
非ポリマー9,58282
水42,0292333
1
A: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,71513
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,56112
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
2
B: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,81716
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,66315
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
3
C: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,90715
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,75314
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
4
D: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,81716
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,66315
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
5
E: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,81716
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,66315
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
6
F: Serotransferrin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)78,43312
ポリマ－77,1541
非ポリマー1,27911
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)254.531, 173.004, 150.151
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 123.26, 90.00
Int Tables number5
Space group name H-MC121
Components on special symmetry positions
IDモデル要素
11E-706-

SO4

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 6分子 ABCDEF

#1: タンパク質
Serotransferrin / Transferrin / Beta-1 metal-binding globulin / Siderophilin


分子量: 77153.906 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P02787

-
非ポリマー , 5種, 2415分子

#2: 化合物
ChemComp-BCT / BICARBONATE ION / オキシラトぎ酸


分子量: 61.017 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: CHO3 / コメント: pH緩衝剤*YM
#3: 化合物
ChemComp-FE / FE (III) ION


分子量: 55.845 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe
#4: 化合物...
ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 44 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO4
#5: 化合物
ChemComp-P6G / HEXAETHYLENE GLYCOL / POLYETHYLENE GLYCOL PEG400 / ヘキサエチレングリコ-ル


分子量: 282.331 Da / 分子数: 14 / 由来タイプ: 合成 / 式: C12H26O7 / コメント: 沈殿剤*YM
#6: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 2333 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

Has protein modificationY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.8 %
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5
詳細: 100mM HEPES, pH 7.5, 1.6 M ammonium sulfate, and 2% PEG 1000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2011年11月4日
放射モノクロメーター: double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.1→50 Å / Num. all: 297056 / Num. obs: 297056 / % possible obs: 94.2 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 2.5 % / Rsym value: 0.08 / Net I/σ(I): 12.3
反射 シェル解像度: 2.1→2.18 Å / 冗長度: 2.1 % / Mean I/σ(I) obs: 1.7 / Rsym value: 0.46 / % possible all: 91.5

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
SERGUIデータ収集
PHASER位相決定
PHENIX(phenix.refine: 1.7.3_928)精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.102→29.947 Å / SU ML: 0.27 / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.23 --random
Rwork0.18 ---
obs-297056 94.41 %-
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 42.368 Å2 / ksol: 0.363 e/Å3
原子変位パラメータ
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--1.8422 Å2-0 Å2-3.925 Å2
2--3.2319 Å2-0 Å2
3----1.3898 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.102→29.947 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数31049 0 546 2333 33928
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.00832343
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.14543511
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d15.35611781
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0854628
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0055632
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.1015-2.12540.30374600.26778667X-RAY DIFFRACTION87
2.1254-2.15040.30264580.26129066X-RAY DIFFRACTION91
2.1504-2.17660.31345150.25339173X-RAY DIFFRACTION92
2.1766-2.20420.29294770.24529072X-RAY DIFFRACTION92
2.2042-2.23320.28784900.23519105X-RAY DIFFRACTION92
2.2332-2.26380.29715150.23639131X-RAY DIFFRACTION92
2.2638-2.29610.30044680.22649194X-RAY DIFFRACTION92
2.2961-2.33030.2694740.21539143X-RAY DIFFRACTION92
2.3303-2.36670.26875070.21319171X-RAY DIFFRACTION92
2.3667-2.40550.28755020.21929205X-RAY DIFFRACTION93
2.4055-2.4470.27154960.2129278X-RAY DIFFRACTION93
2.447-2.49150.2514990.20159231X-RAY DIFFRACTION93
2.4915-2.53940.24124760.19669281X-RAY DIFFRACTION93
2.5394-2.59120.2454660.20439291X-RAY DIFFRACTION94
2.5912-2.64750.26794910.20289429X-RAY DIFFRACTION94
2.6475-2.7090.26244950.19029406X-RAY DIFFRACTION95
2.709-2.77670.23894810.19179418X-RAY DIFFRACTION95
2.7767-2.85170.25775030.19369552X-RAY DIFFRACTION96
2.8517-2.93560.25795240.20219530X-RAY DIFFRACTION96
2.9356-3.03020.23465160.18679626X-RAY DIFFRACTION97
3.0302-3.13840.22015080.18299744X-RAY DIFFRACTION97
3.1384-3.2640.2295350.18439692X-RAY DIFFRACTION97
3.264-3.41230.21375000.17299669X-RAY DIFFRACTION97
3.4123-3.59190.19994940.16359737X-RAY DIFFRACTION97
3.5919-3.81660.1975160.15479674X-RAY DIFFRACTION97
3.8166-4.11060.1925330.14639694X-RAY DIFFRACTION97
4.1106-4.52290.17245570.13979711X-RAY DIFFRACTION97
4.5229-5.17450.18365550.14769710X-RAY DIFFRACTION97
5.1745-6.50830.21294980.17869753X-RAY DIFFRACTION97
6.5083-29.94990.18265170.17369717X-RAY DIFFRACTION96
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
12.6118-0.194-0.70941.64440.06541.6687-0.0309-0.1844-0.2123-0.0062-0.0464-0.01580.07160.09640.06930.13960.01210.0450.160.04980.1542-57.198636.3542-20.6969
21.83091.19711.21055.52962.38382.9975-0.10670.1501-0.0202-0.4185-0.0440.34960.0177-0.31120.23940.31180.02640.0980.322-0.00570.2927-60.64349.0125-46.4431
31.8941-0.833-0.5342.73030.47351.9943-0.3942-0.1351-0.51420.1630.1181-0.23980.46810.17820.2360.38370.11940.2530.29330.06060.5406-46.7469-2.4608-38.1638
41.3773-0.04150.43830.74-0.01810.9467-0.00710.03540.1045-0.0873-0.0067-0.0554-0.05570.05730.0330.1482-0.00910.07950.1677-0.01040.147412.2643-14.6125-20.298
52.8691.083-0.42634.181-2.02842.874-0.10930.4304-0.0525-0.7422-0.0025-0.25930.21010.30050.15020.3757-0.02090.04490.3611-0.00580.260713.039812.8236-46.8038
62.4264-1.04370.63933.0569-0.34292.7702-0.3361-0.17610.3691-0.00530.08080.378-0.5427-0.49110.16640.26380.0847-0.09480.2685-0.03560.3786-3.119324.8309-37.5851
74.5323-0.37610.03914.20460.51112.8962-0.2495-0.00040.45490.00780.1715-0.1294-0.44660.1320.12750.25640.055-0.12440.2250.01440.260211.140220.7412-35.0378
80.6877-0.1380.07571.42920.12722.80630.0140.0148-0.0668-0.0791-0.0156-0.10590.12310.0745-0.00080.10240.01590.05080.10060.00240.187-34.550336.8862-67.3963
92.60772.91021.1273.42451.15760.36210.5029-0.5758-0.11850.5657-0.6940.17590.2865-0.6582-0.03960.4145-0.16250.03330.4438-0.02830.3952-57.064513.9014-72.86
101.2339-0.01730.73562.37220.95850.99780.78690.2879-1.4023-0.22060.1582-2.2405-0.01460.1724-0.39520.4335-0.18210.0092-0.025-0.53221.8391-44.0785-4.3421-88.6749
110.8762-0.67970.17583.46340.9082.14880.5273-0.4172-0.88530.7956-0.2098-0.95230.6762-0.2066-0.28350.6591-0.1882-0.25330.4710.08680.847-49.48480.4671-74.4867
121.79580.451-0.57131.4573-0.19540.86970.08090.12810.11680.0337-0.03750.0037-0.1026-0.0742-0.02510.15590.04180.04620.20370.04720.1448-62.6829-14.400217.2801
132.08230.41370.10482.2331-0.81522.6196-0.01380.1490.4413-0.0776-0.1478-0.0472-0.19110.18360.12230.14820.02050.02640.23110.11390.3497-42.243722.712517.4107
142.1069-0.13641.02791.1340.05991.42190.085-0.0941-0.13340.0053-0.0232-0.03880.1222-0.0082-0.04660.1512-0.010.06680.1460.03040.1291-108.253436.0527-15.8051
152.5269-0.41-1.08254.04351.38123.28490.02880.4642-0.0352-0.4329-0.0006-0.3219-0.0370.21150.08910.24170.0530.06240.33980.06120.3271-88.02749.3089-32.6209
162.438-0.8713-0.29341.9238-0.97882.0531-0.2231-0.2922-0.56020.082-0.1582-0.1220.42230.64490.26090.31570.16260.10720.43670.20750.391-85.1879-3.8274-16.3526
172.06940.018-0.12433.19890.42.9809-0.105-0.3947-0.37620.36650.03940.56590.393-0.09270.09450.25620.04380.06280.29660.11340.3564-97.07272.8618-16.0838
180.9022-0.04530.17441.4389-0.1362.99550.01850.03130.0712-0.04490.02210.0452-0.2156-0.0231-0.0010.13370.0210.06770.11370.02020.1683-9.0676-15.4629-66.3398
193.36391.6608-0.90733.1689-0.19621.610.2703-0.3371-0.01530.1024-0.2134-0.3473-0.18350.349-0.01170.2934-0.02830.11460.25540.0340.265410.852411.9952-75.0077
201.9922-0.7786-0.18351.7941-0.59291.53440.44240.28110.5382-0.0628-0.1595-0.0989-0.1730.0256-0.18450.35790.05880.25970.29040.0610.4791.379426.9011-86.3477
212.2668-0.33640.13292.72920.27182.20970.3268-0.25010.63470.294-0.12870.0761-0.55740.0561-0.1640.46090.0030.24530.2652-0.02890.36733.703520.0474-74.9355
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resseq 23:335)
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resseq 336:380)
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resseq 381:677)
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'B' and (resseq 20:347)
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'B' and (resseq 348:380)
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'B' and (resseq 381:595)
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resseq 596:677)
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'C' and (resseq 23:317)
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'C' and (resseq 318:380)
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'C' and (resseq 381:592)
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'C' and (resseq 593:677)
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'D' and (resseq 22:347)
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'D' and (resseq 348:677)
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'E' and (resseq 23:335)
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'E' and (resseq 336:380)
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'E' and (resseq 381:627)
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'E' and (resseq 628:677)
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'F' and (resseq 21:335)
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'F' and (resseq 336:411)
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'F' and (resseq 412:609)
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'F' and (resseq 610:677)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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