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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3tq2 | ||||||
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タイトル | Merohedral twinning in protein crystals revealed a new synthetic three helix bundle motif | ||||||
![]() | KE1 | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / Parallel three helix bundle | ||||||
生物種 | Synthetic (人工物) | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Geremia, S. / De March, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Analysis of the crystal structure of a parallel three-stranded coiled coil. 著者: de March, M. / Hickey, N. / Geremia, S. #1: ![]() タイトル: A coiled-coil motif that sequesters ions to the hydrophobic core. 著者: Hartmann, M.D. / Ridderbusch, O. / Zeth, K. / Albrecht, R. / Testa, O. / Woolfson, D.N. / Sauer, G. / Dunin-Horkawicz, S. / Lupas, A.N. / Alvarez, B.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 17.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 11.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 443.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 444.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3986.906 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Solid Phase Chemistry / 由来: (合成) Synthetic (人工物) |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 33.42 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.1M Hepes pH 7.5, 1.8-2.5M ammonium sulfate, 1.5-3% w/v PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 1.1→50 Å / Num. all: 10855 / Num. obs: 30622 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / Rmerge(I) obs: 0.081 | ||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 1.1→1.14 Å / Rmerge(I) obs: 0.353 / Mean I/σ(I) obs: 1.74 / % possible all: 85.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: a 35 Poly-Ala model 解像度: 1.1→50 Å / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.1→50 Å
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拘束条件 |
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