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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3sdh | |||||||||
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タイトル | HIGH RESOLUTION CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF A COOPERATIVE DIMERIC HEMOGLOBIN | |||||||||
![]() | HEMOGLOBIN I (CARBONMONOXY) | |||||||||
![]() | OXYGEN TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() oxygen carrier activity / oxygen binding / response to hypoxia / heme binding / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Royerjunior, W.E. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: High-resolution crystallographic analysis of a co-operative dimeric hemoglobin. 著者: Royer Jr., W.E. #1: ![]() タイトル: Structural Transitions Upon Ligand Binding in a Cooperative Dimeric Hemoglobin 著者: Royer Junior, W.E. / Hendrickson, W.A. / Chiancone, E. #2: ![]() タイトル: The 2.4 Angstroms Crystal Structure of Scapharca Dimeric Hemoglobin. Cooperatively Based on Directly Communicating Hemes at a Novel Subunit Interface 著者: Royer Junior, W.E. / Hendrickson, W.A. / Chiancone, E. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 77.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 58.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.3363, -0.2695, -0.9024), ベクター: 詳細 | THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *MTRIX* RECORDS BELOW WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR CHAIN *A* WHEN APPLIED TO CHAIN *B*. | |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15966.319 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P02213 #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.27 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.87 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: batch method | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.4 Å / Num. obs: 46818 / % possible obs: 83 % / Observed criterion σ(I): 1 / Num. measured all: 184670 / Rmerge(I) obs: 0.0492 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.159 / Rfactor obs: 0.159 / 最高解像度: 1.4 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.4 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 42012 / σ(F): 4 / Rfactor obs: 0.159 / Rfactor Rwork: 0.159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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