登録情報 データベース : PDB / ID : 3qmh 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structural Basis of Selective Binding of Non-Methylated CpG islands (DNA-TCGA) by the CXXC Domain of CFP1 要素5'-D(*GP*CP*CP*AP*TP*CP*GP*AP*TP*GP*GP*C)-3'CpG-binding protein 詳細キーワード DNA BINDING PROTEIN/DNA / Structural Genomics Consortium / SGC / DNA BINDING / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
unmethylated CpG binding / XBP1(S) activates chaperone genes / Set1C/COMPASS complex / histone methyltransferase complex / Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes / cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / methylated histone binding / nuclear matrix / nuclear speck / regulation of DNA-templated transcription ... unmethylated CpG binding / XBP1(S) activates chaperone genes / Set1C/COMPASS complex / histone methyltransferase complex / Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes / cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / methylated histone binding / nuclear matrix / nuclear speck / regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of DNA-templated transcription / zinc ion binding / nucleoplasm / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 CpG binding protein, C-terminal / CpG binding protein C-terminal domain / Spp1/CFP1 / CXXC zinc finger domain / Zinc finger, CXXC-type / Zinc finger CXXC-type profile. / Zinc finger, PHD-type, conserved site / PHD-finger / Zinc finger PHD-type signature. / Zinc finger PHD-type profile. ... CpG binding protein, C-terminal / CpG binding protein C-terminal domain / Spp1/CFP1 / CXXC zinc finger domain / Zinc finger, CXXC-type / Zinc finger CXXC-type profile. / Zinc finger, PHD-type, conserved site / PHD-finger / Zinc finger PHD-type signature. / Zinc finger PHD-type profile. / Zinc finger, PHD-finger / Zinc finger, PHD-type / PHD zinc finger / Zinc finger, FYVE/PHD-type / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type 類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / CXXC-type zinc finger protein 1 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.5 Å 詳細データ登録者 Xu, C. / Bian, C. / MacKenzie, F. / Bountra, C. / Weigelt, J. / Arrowsmith, C.H. / Edwards, A.M. / Min, J. / Structural Genomics Consortium (SGC) 引用ジャーナル : Nat Commun / 年 : 2011タイトル : The structural basis for selective binding of non-methylated CpG islands by the CFP1 CXXC domain.著者 : Xu, C. / Bian, C. / Lam, R. / Dong, A. / Min, J. 履歴 登録 2011年2月4日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2011年2月23日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2023年9月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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