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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3oov | ||||||
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タイトル | Crystal structure of a methyl-accepting chemotaxis protein, residues 122 to 287 | ||||||
![]() | Methyl-accepting chemotaxis protein, putative | ||||||
![]() | SIGNALING PROTEIN / Structural Genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Midwest Center for Structural Genomics / MCSG | ||||||
機能・相同性 | ![]() plasma membrane => GO:0005886 / transmembrane signaling receptor activity / chemotaxis / signal transduction 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Joachimiak, A. / Duke, N.E.C. / Hatzos-Skintges, C. / Mulligan, R. / Clancy, S. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of a methyl-accepting chemotaxis protein, residues 122 to 287 著者: Joachimiak, A. / Duke, N.E.C. / Hatzos-Skintges, C. / Mulligan, R. / Clancy, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 74.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 60.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 446.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 450.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18637.951 Da / 分子数: 2 / 断片: residues 122-287 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: PCA / 遺伝子: GSU1704 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-GOL / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.61 % |
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結晶化 | 温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4.2 詳細: 10% w/v PEG 3000, 0.10M phosphate-citrate, pH4.2, 0.20M NaCl. (Wizard II, #36) cryoprotectant: included all of above, in addition to 25% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2009年11月9日 |
放射 | モノクロメーター: double crystal Si(111) monochromator, focussing mirror プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97911 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→60.52 Å / Num. all: 21188 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 4.1 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 28.315 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→60.52 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.2→2.257 Å / Total num. of bins used: 20
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