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- PDB-3oj4: Crystal structure of the A20 ZnF4, ubiquitin and UbcH5A complex -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 3oj4
タイトルCrystal structure of the A20 ZnF4, ubiquitin and UbcH5A complex
要素
  • Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3
  • Ubiquitin
  • Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
キーワードLIGASE/PROTEIN BINDING / ubiquitin / zinc finger / ubiquitin conjugating enzyme / zinc ion / LIGASE-PROTEIN BINDING complex
機能・相同性
機能・相同性情報


regulation of vascular wound healing / negative regulation of toll-like receptor 5 signaling pathway / negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 signaling pathway / establishment of protein localization to vacuole / tolerance induction to lipopolysaccharide / negative regulation of osteoclast proliferation / negative regulation of CD40 signaling pathway / negative regulation of B cell activation / negative regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway / negative regulation of chronic inflammatory response ...regulation of vascular wound healing / negative regulation of toll-like receptor 5 signaling pathway / negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 signaling pathway / establishment of protein localization to vacuole / tolerance induction to lipopolysaccharide / negative regulation of osteoclast proliferation / negative regulation of CD40 signaling pathway / negative regulation of B cell activation / negative regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway / negative regulation of chronic inflammatory response / negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway / protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process / negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway / positive regulation of protein polyubiquitination / protein K11-linked deubiquitination / nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor signaling pathway / Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase / negative regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway / Inactivation of APC/C via direct inhibition of the APC/C complex / APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins / Aberrant regulation of mitotic exit in cancer due to RB1 defects / B-1 B cell homeostasis / Phosphorylation of the APC/C / protein K48-linked deubiquitination / regulation of defense response to virus by host / Signaling by BMP / (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme / regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway / regulation of germinal center formation / positive regulation of hepatocyte proliferation / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / hypothalamus gonadotrophin-releasing hormone neuron development / negative regulation of bone resorption / protein K63-linked deubiquitination / TNFR1-induced proapoptotic signaling / female meiosis I / positive regulation of protein monoubiquitination / fat pad development / negative regulation of interleukin-1 beta production / mitochondrion transport along microtubule / negative regulation of interleukin-2 production / E2 ubiquitin-conjugating enzyme / K63-linked deubiquitinase activity / K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding / female gonad development / seminiferous tubule development / negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity / male meiosis I / response to muramyl dipeptide / ubiquitin conjugating enzyme activity / Regulation of APC/C activators between G1/S and early anaphase / negative regulation of interleukin-6 production / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator / Transcriptional Regulation by VENTX / negative regulation of tumor necrosis factor production / negative regulation of BMP signaling pathway / positive regulation of Wnt signaling pathway / protein deubiquitination / negative regulation of endothelial cell apoptotic process / protein K48-linked ubiquitination / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors / energy homeostasis / regulation of neuron apoptotic process / negative regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / negative regulation of TORC1 signaling / regulation of proteasomal protein catabolic process / Maturation of protein E / Maturation of protein E / ER Quality Control Compartment (ERQC) / cytoskeleton organization / Myoclonic epilepsy of Lafora / FLT3 signaling by CBL mutants / negative regulation of protein ubiquitination / Prevention of phagosomal-lysosomal fusion / IRAK2 mediated activation of TAK1 complex / Alpha-protein kinase 1 signaling pathway / Glycogen synthesis / IRAK1 recruits IKK complex / IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation / Membrane binding and targetting of GAG proteins / Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) / Regulation of TBK1, IKKε (IKBKE)-mediated activation of IRF3, IRF7 / Negative regulation of FLT3 / PTK6 Regulates RTKs and Their Effectors AKT1 and DOK1 / Regulation of TBK1, IKKε-mediated activation of IRF3, IRF7 upon TLR3 ligation / IRAK2 mediated activation of TAK1 complex upon TLR7/8 or 9 stimulation / Constitutive Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants / NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus / TICAM1,TRAF6-dependent induction of TAK1 complex / TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7 / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B / Regulation of FZD by ubiquitination / Downregulation of ERBB4 signaling / p75NTR recruits signalling complexes / APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A / InlA-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cells / TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling / TRAF6-mediated induction of TAK1 complex within TLR4 complex / Regulation of pyruvate metabolism / Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA
類似検索 - 分子機能
: / Zinc finger, A20-type / A20-like zinc finger / Zinc finger A20-type profile. / A20-like zinc fingers / OTU-like cysteine protease / OTU domain / OTU domain profile. / Ubiquitin Conjugating Enzyme / Ubiquitin Conjugating Enzyme ...: / Zinc finger, A20-type / A20-like zinc finger / Zinc finger A20-type profile. / A20-like zinc fingers / OTU-like cysteine protease / OTU domain / OTU domain profile. / Ubiquitin Conjugating Enzyme / Ubiquitin Conjugating Enzyme / Ubiquitin-conjugating enzyme, active site / Ubiquitin-conjugating (UBC) active site signature. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2 / Ubiquitin-conjugating enzyme / Ubiquitin-conjugating (UBC) core domain profile. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2, catalytic domain homologues / Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / : / Ubiquitin domain signature. / Ubiquitin conserved site / Ubiquitin domain / Ubiquitin-like (UB roll) / Ubiquitin family / Ubiquitin homologues / Ubiquitin domain profile. / Ubiquitin-like domain / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Polyubiquitin-B / Polyubiquitin-C / Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3 / Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.4 Å
データ登録者Bosanac, I. / Hymowitz, S.G.
引用ジャーナル: Mol.Cell / 年: 2010
タイトル: Ubiquitin Binding to A20 ZnF4 Is Required for Modulation of NF-κB Signaling
著者: Bosanac, I. / Wertz, I.E. / Pan, B. / Yu, C. / Kusam, S. / Lam, C. / Phu, L. / Phung, Q. / Maurer, B. / Arnott, D. / Kirkpatrick, D.S. / Dixit, V.M. / Hymowitz, S.G.
履歴
登録2010年8月20日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02010年12月8日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年7月13日Group: Version format compliance
改定 1.22018年1月24日Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name
改定 1.32023年9月6日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
B: Ubiquitin
C: Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3
D: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
E: Ubiquitin
F: Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)63,2418
ポリマ－63,1106
非ポリマー1312
水00
1
A: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
B: Ubiquitin
C: Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,6204
ポリマ－31,5553
非ポリマー651
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
2
D: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1
E: Ubiquitin
F: Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,6204
ポリマ－31,5553
非ポリマー651
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)102.646, 102.646, 112.686
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number150
Space group name H-MP321
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID詳細
11A
21D
12B
22E
13C
23F

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Refine code: 2

Dom-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
11METMETMETMETAA1 - 1477 - 153
21METMETMETMETDD1 - 1477 - 153
12METMETARGARGBB1 - 724 - 75
22METMETARGARGEE1 - 724 - 75
13SERSERLYSLYSCC605 - 63519 - 49
23SERSERLYSLYSFF605 - 63519 - 49

NCSアンサンブル:
ID
1
2
3

-
要素

#1: タンパク質 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 / Ubiquitin-protein ligase D1 / Ubiquitin carrier protein D1 / UbcH5 / Ubiquitin-conjugating enzyme ...Ubiquitin-protein ligase D1 / Ubiquitin carrier protein D1 / UbcH5 / Ubiquitin-conjugating enzyme E2-17 kDa 1 / Ubiquitin-conjugating enzyme E2(17)KB 1 / UBC4/5 homolog / Stimulator of Fe transport / SFT


分子量: 17277.756 Da / 分子数: 2 / 断片: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: UBE2D1, SFT, UBC5A, UBCH5, UBCH5A / プラスミド: pET-15b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) codon + RIL / 参照: UniProt: P51668, ubiquitin-protein ligase
#2: タンパク質 Ubiquitin


分子量: 8859.106 Da / 分子数: 2 / 断片: Ubiquitin, UNP residues 1-76 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: UBB / プラスミド: pET-15b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) codon + RIL / 参照: UniProt: P0CG47, UniProt: P0CG48*PLUS
#3: タンパク質・ペプチド Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3 / TNF alpha-induced protein 3 / OTU domain-containing protein 7C / Putative DNA-binding protein A20 / ...TNF alpha-induced protein 3 / OTU domain-containing protein 7C / Putative DNA-binding protein A20 / Zinc finger protein A20


分子量: 5418.088 Da / 分子数: 2 / 断片: Zinc finger A20-type 4, UNP residues 592-635 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TNFAIP3, OTUD7C / プラスミド: pET-15b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) codon + RIL / 参照: UniProt: P21580
#4: 化合物 ChemComp-ZN / ZINC ION


分子量: 65.409 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.72 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.7 %
結晶化温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 7.1
詳細: 0.1 M HEPES pH 7.1 and 1.85 M Na Malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.1 / 波長: 1 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2006年10月13日
放射モノクロメーター: Asymmetric curved crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 3.4→25 Å / Num. all: 9814 / Num. obs: 9637 / % possible obs: 98.2 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 6.1 % / Rsym value: 0.115 / Net I/σ(I): 16.8
反射 シェル解像度: 3.4→3.52 Å / 冗長度: 3.9 % / Mean I/σ(I) obs: 3.3 / Num. unique all: 955 / Rsym value: 0.75 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
BOSデータ収集
PHASER位相決定
REFMAC5.2.0019精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB ENTRY: 1UBQ, 1X23

1ubq

1x23


解像度: 3.4→25 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.876 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.842 / SU B: 102.112 / SU ML: 0.724 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.767 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.31882 962 10 %RANDOM
Rwork0.27984 ---
all0.284 9612 --
obs0.28381 8650 98.09 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 94.095 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--3.19 Å2-1.6 Å20 Å2
2---3.19 Å20 Å2
3---4.79 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 3.4→25 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3986 0 2 0 3988
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0090.0224090
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.0131.9755538
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg5.3135494
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg37.84824.556180
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg18.90915722
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg12.3951520
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.070.2608
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0030.023074
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined0.1940.21669
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined0.3020.22715
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined0.1250.2127
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined0.3230.2127
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined0.2080.25
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it0.8342.52587
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it1.28154086
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it1.2532.51707
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it1.82351452
Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-IDAuth asym-ID数タイプRms dev position (Å)Weight position
1A588tight positional0.010.05
2B288tight positional0.020.05
3C124tight positional0.010.05
1A582medium positional0.150.5
2B286medium positional0.180.5
3C125medium positional0.090.5
1A588tight thermal0.020.5
2B288tight thermal0.020.5
3C124tight thermal0.020.5
1A582medium thermal0.162
2B286medium thermal0.152
3C125medium thermal0.142
LS精密化 シェル解像度: 3.4→3.469 Å / Rfactor Rfree error: 43.6 / Total num. of bins used: 25
Rfactor反射数%反射
Rfree0.436 61 -
Rwork0.43 502 -
obs-563 100 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
113.26093.45892.42286.15513.63810.1513-0.2905-0.43070.3014-0.41240.3140.4103-1.03571.1709-0.0234-0.5801-0.0904-0.0359-0.48410.0597-0.4289-36.746120.302664.2197
26.33641.94091.777415.37054.606510.6419-0.78081.04660.3943-2.19311.3058-0.2936-2.32311.9386-0.5250.5577-0.90760.03980.1725-0.141-0.4883-25.919517.78943.6012
350.84428.46463.222342.261114.996344.9484-0.36651.3702-4.13350.11521.5811-1.95161.82132.8831-1.2146-0.7426-0.0592-0.1028-0.2453-0.2041-0.2868-27.7701-4.393844.3441
45.417-1.70571.184414.22524.487210.34870.60.03230.23120.0111-0.64260.49081.6588-0.25490.0426-0.38850.01550.0786-0.6307-0.0109-0.4151-35.94721.6829-7.8757
510.83254.62864.00299.832.473110.34151.1882-0.843-0.56922.1166-0.46780.20282.3933-0.7979-0.72041.0243-0.5801-0.1239-0.2837-0.037-0.4339-28.349313.53512.7369
638.92950.04227.175852.13968.345538.17170.64730.16770.47371.64470.5544-4.14331.2432.7195-1.2016-0.28060.2274-0.0646-0.6408-0.1888-0.318-10.087126.250212.0151
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A1 - 147
2X-RAY DIFFRACTION2B1 - 73
3X-RAY DIFFRACTION3C605 - 635
4X-RAY DIFFRACTION4D1 - 147
5X-RAY DIFFRACTION5E1 - 73
6X-RAY DIFFRACTION6F605 - 635

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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