[English] 日本語
![](img/lk-miru.gif)
- PDB-3my0: Crystal structure of the ACVRL1 (ALK1) kinase domain bound to LDN... -
+
Open data
-
Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3my0 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of the ACVRL1 (ALK1) kinase domain bound to LDN-193189 | ||||||
![]() | Serine/threonine-protein kinase receptor R3 | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Protein Kinase / Serine/threonine-protein kinase receptor / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC | ||||||
Function / homology | ![]() lymphatic endothelial cell differentiation / regulation of endothelial cell proliferation / negative regulation of endothelial cell differentiation / dorsal aorta morphogenesis / positive regulation of epithelial cell differentiation / blood vessel maturation / venous blood vessel development / transforming growth factor beta receptor activity / lymphangiogenesis / positive regulation of chondrocyte differentiation ...lymphatic endothelial cell differentiation / regulation of endothelial cell proliferation / negative regulation of endothelial cell differentiation / dorsal aorta morphogenesis / positive regulation of epithelial cell differentiation / blood vessel maturation / venous blood vessel development / transforming growth factor beta receptor activity / lymphangiogenesis / positive regulation of chondrocyte differentiation / BMP receptor complex / retina vasculature development in camera-type eye / BMP receptor activity / blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis / positive regulation of endothelial cell differentiation / activin receptor activity, type I / transforming growth factor beta receptor activity, type I / negative regulation of focal adhesion assembly / endothelial tube morphogenesis / positive regulation of bicellular tight junction assembly / regulation of blood vessel endothelial cell migration / artery development / receptor protein serine/threonine kinase / transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity / Signaling by BMP / activin binding / cellular response to BMP stimulus / positive regulation of BMP signaling pathway / negative regulation of cell adhesion / transforming growth factor beta binding / dorsal/ventral pattern formation / blood circulation / wound healing, spreading of epidermal cells / negative regulation of endothelial cell migration / endocardial cushion morphogenesis / positive regulation of Notch signaling pathway / regulation of DNA replication / SMAD binding / negative regulation of endothelial cell proliferation / positive regulation of SMAD protein signal transduction / negative regulation of blood vessel endothelial cell migration / blood vessel remodeling / BMP signaling pathway / cellular response to transforming growth factor beta stimulus / positive regulation of endothelial cell proliferation / negative regulation of cell migration / transforming growth factor beta receptor signaling pathway / negative regulation of cell growth / cellular response to growth factor stimulus / regulation of blood pressure / positive regulation of angiogenesis / heart development / angiogenesis / in utero embryonic development / response to hypoxia / negative regulation of cell population proliferation / phosphorylation / negative regulation of gene expression / protein serine/threonine kinase activity / neuronal cell body / dendrite / regulation of DNA-templated transcription / protein kinase binding / positive regulation of DNA-templated transcription / cell surface / signal transduction / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP binding / metal ion binding / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Chaikuad, A. / Alfano, I. / Cooper, C. / Mahajan, P. / Daga, N. / Sanvitale, C. / Fedorov, O. / Petrie, K. / Savitsky, P. / Gileadi, O. ...Chaikuad, A. / Alfano, I. / Cooper, C. / Mahajan, P. / Daga, N. / Sanvitale, C. / Fedorov, O. / Petrie, K. / Savitsky, P. / Gileadi, O. / Sethi, R. / Krojer, T. / Muniz, J.R.C. / Pike, A.C.W. / Vollmar, M. / Carpenter, C.P. / Ugochukwu, E. / Knapp, S. / von Delft, F. / Weigelt, J. / Arrowsmith, C.H. / Edwards, A.M. / Bountra, C. / Bullock, A. / Structural Genomics Consortium (SGC) | ||||||
![]() | ![]() Title: A small molecule targeting ALK1 prevents Notch cooperativity and inhibits functional angiogenesis. Authors: Kerr, G. / Sheldon, H. / Chaikuad, A. / Alfano, I. / von Delft, F. / Bullock, A.N. / Harris, A.L. | ||||||
History |
|
-
Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
---|
-
Downloads & links
-
Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 2.5 MB | Display | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB format | ![]() | 2.1 MB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 5.4 MB | Display | ![]() |
---|---|---|---|---|
Full document | ![]() | 5.5 MB | Display | |
Data in XML | ![]() | 239.3 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 315.2 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 3h9rS S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-
Links
-
Assembly
Deposited unit | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|