登録情報 データベース : PDB / ID : 3l7z 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the S. solfataricus archaeal exosome 要素Probable exosome complex RNA-binding protein 1 Probable exosome complex exonuclease 1 Probable exosome complex exonuclease 2 詳細キーワード hydrolase/RNA binding protein / Exosome / asymmetry / RNA processing / RNA degradation / conformation flexibility / thermal motion / hydrolase-RNA binding protein complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
CUT catabolic process / exosome (RNase complex) / U4 snRNA 3'-end processing / cytoplasmic exosome (RNase complex) / poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing / exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rRNA catabolic process / poly(A) binding / mRNA 3'-UTR AU-rich region binding / RNA catabolic process ... CUT catabolic process / exosome (RNase complex) / U4 snRNA 3'-end processing / cytoplasmic exosome (RNase complex) / poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing / exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rRNA catabolic process / poly(A) binding / mRNA 3'-UTR AU-rich region binding / RNA catabolic process / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エキソリボヌクレアーゼ / 3'-5'-RNA exonuclease activity / gene expression / RNA binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 : / Exosome RNA binding protein RRP4 N-terminal domain / Exosome complex component Rrp4 / Exosome complex component Rrp41 / Exosome complex component Rrp42, archaea / : / KH domain / Exosome complex RNA-binding protein 1/RRP40/RRP4 / GHMP Kinase, N-terminal domain / : ... : / Exosome RNA binding protein RRP4 N-terminal domain / Exosome complex component Rrp4 / Exosome complex component Rrp41 / Exosome complex component Rrp42, archaea / : / KH domain / Exosome complex RNA-binding protein 1/RRP40/RRP4 / GHMP Kinase, N-terminal domain / : / : / K Homology domain, type 1 / Exoribonuclease, phosphorolytic domain 2 / 3' exoribonuclease family, domain 2 / Exoribonuclease, phosphorolytic domain 1 / PNPase/RNase PH domain superfamily / Exoribonuclease, PH domain 2 superfamily / 3' exoribonuclease family, domain 1 / K Homology domain, type 1 / Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1 / RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain / K Homology domain, type 1 superfamily / Ribosomal Protein S5; domain 2 / S1 domain profile. / Ribosomal protein S1-like RNA-binding domain / S1 domain / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Exosome complex component Rrp42 / Exosome complex component Rrp41 / Exosome complex component Rrp4 類似検索 - 構成要素生物種 Sulfolobus solfataricus (古細菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.41 Å 詳細データ登録者 Lu, C. / Ding, F. / Ke, A. 引用ジャーナル : Plos One / 年 : 2010タイトル : Crystal structure of the S. solfataricus archaeal exosome reveals conformational flexibility in the RNA-binding ring.著者 : Lu, C. / Ding, F. / Ke, A. 履歴 登録 2009年12月29日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2010年6月23日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Advisory / Refinement description / Version format compliance改定 1.2 2017年11月1日 Group : Refinement description / カテゴリ : softwareItem : _software.classification / _software.contact_author ... _software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version 改定 1.3 2021年10月13日 Group : Database references / Derived calculations / カテゴリ : database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_siteItem : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.4 2024年11月6日 Group : Data collection / Structure summaryカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
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