登録情報 | データベース: PDB / ID: 3kt3 |
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タイトル | Crystal structure of S. cerevisiae tryptophanyl-tRNA synthetase in complex with TrpAMP |
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要素 | Tryptophanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic |
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キーワード | LIGASE / tryptophanyl-tRNA synthetase / S. cerevisiae / sulfate ion / amino acid activation / catalytic mechanism / Aminoacyl-tRNA synthetase / ATP-binding / Cytoplasm / Nucleotide-binding / Protein biosynthesis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tryptophan-tRNA ligase / tryptophan-tRNA ligase activity / tryptophanyl-tRNA aminoacylation / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Tryptophan-tRNA ligase / Tyrosyl-Transfer RNA Synthetase / Tyrosyl-Transfer RNA Synthetase / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ic / tRNA synthetases class I (W and Y) / Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-I signature. / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Rossmann fold ...Tryptophan-tRNA ligase / Tyrosyl-Transfer RNA Synthetase / Tyrosyl-Transfer RNA Synthetase / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ic / tRNA synthetases class I (W and Y) / Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-I signature. / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 TRYPTOPHANYL-5'AMP / Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_yeast.gif) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Zhou, M. / Dong, X. / Zhong, C. / Shen, N. / Ding, J. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2010 タイトル: Crystal structures of Saccharomyces cerevisiae tryptophanyl-tRNA synthetase: new insights into the mechanism of tryptophan activation and implications for anti-fungal drug design 著者: Zhou, M. / Dong, X. / Shen, N. / Zhong, C. / Ding, J. |
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履歴 | 登録 | 2009年11月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2010年2月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月1日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.3 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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