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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3kar | ||||||
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タイトル | THE MOTOR DOMAIN OF KINESIN-LIKE PROTEIN KAR3, A SACCHAROMYCES CEREVISIAE KINESIN-RELATED PROTEIN | ||||||
![]() | KINESIN-LIKE PROTEIN KAR3 | ||||||
![]() | CONTRACTILE PROTEIN / KAR3 / KINESIN-RELATED PROTEIN / MOTOR PROTEIN / ATPASE / P-LOOP / MICROTUBULE BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() minus-end-directed kinesin ATPase / microtubule bundle formation involved in mitotic spindle midzone assembly / nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion / protein transport along microtubule to mitotic spindle pole body / karyogamy involved in conjugation with cellular fusion / minus-end-directed microtubule motor activity / spindle pole body / mitotic sister chromatid cohesion / cytoplasmic microtubule / regulation of mitotic spindle organization ...minus-end-directed kinesin ATPase / microtubule bundle formation involved in mitotic spindle midzone assembly / nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion / protein transport along microtubule to mitotic spindle pole body / karyogamy involved in conjugation with cellular fusion / minus-end-directed microtubule motor activity / spindle pole body / mitotic sister chromatid cohesion / cytoplasmic microtubule / regulation of mitotic spindle organization / isomerase activity / meiotic cell cycle / spindle pole / chromosome / mitotic cell cycle / microtubule binding / microtubule / cell division / ATP hydrolysis activity / ATP binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Gulick, A.M. / Song, H. / Endow, S. / Rayment, I. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray crystal structure of the yeast Kar3 motor domain complexed with Mg.ADP to 2.3 A resolution. 著者: Gulick, A.M. / Song, H. / Endow, S.A. / Rayment, I. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 81 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 57.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 779 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 796.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38806.539 Da / 分子数: 1 / 断片: MOTOR DOMAIN, RESIDUES 383 - 722 / 変異: L383M / 由来タイプ: 組換発現 詳細: GENETICALLY TRUNCATED MOTOR DOMAIN OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE MOTOR PROTEIN KAR3 LIGANDS MG2 AND ADP 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: KAR3 / プラスミド: PMW-KAR3 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-ADP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.14 Å3/Da / 溶媒含有率: 42 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7 詳細: 11 % MEPEG 2000, 50 MM NACL, 1% ETHYLENE GLYCOL, 1 MM MG ADP, pH 7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: batch method | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 269 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS HI-STAR / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1997年4月9日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→30 Å / Num. obs: 22220 / % possible obs: 93 % / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.034 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.4 Å / Rmerge(I) obs: 0.074 / % possible all: 85 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 43898 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 84.7 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→30 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor all: 0.175 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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