登録情報 | データベース: PDB / ID: 3iv5 |
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タイトル | Crystal structure of Fis bound to 27 bp optimal binding sequence F1 |
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要素 | - (DNA (27-MER)) x 2
- DNA-binding protein fis
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN/DNA / HTH domain / Protein-DNA complex / minor groove compression / DNA bending / indirect recognition / Activator / DNA-binding / Transcription / Transcription regulation / DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
invertasome / positive regulation of DNA recombination / sequence-specific DNA binding, bending / provirus excision / nucleoid / DNA-binding transcription repressor activity / DNA-binding transcription activator activity / chromosome organization / core promoter sequence-specific DNA binding / protein-DNA complex ...invertasome / positive regulation of DNA recombination / sequence-specific DNA binding, bending / provirus excision / nucleoid / DNA-binding transcription repressor activity / DNA-binding transcription activator activity / chromosome organization / core promoter sequence-specific DNA binding / protein-DNA complex / response to radiation / nucleosome / sequence-specific DNA binding / transcription cis-regulatory region binding / DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / protein homodimerization activity / DNA binding / cytosol類似検索 - 分子機能 : / DNA-binding protein Fis / DNA binding HTH domain, Fis-type / Bacterial regulatory protein, Fis family / Homeodomain-like / Homeobox-like domain superfamily / Arc Repressor Mutant, subunit A / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.9 Å |
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データ登録者 | Stella, S. / Cascio, D. / Johnson, R.C. |
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引用 | ジャーナル: Genes Dev. / 年: 2010 タイトル: The shape of the DNA minor groove directs binding by the DNA-bending protein Fis. 著者: Stella, S. / Cascio, D. / Johnson, R.C. |
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履歴 | 登録 | 2009年8月31日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年4月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月1日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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