登録情報 | データベース: PDB / ID: 3hj7 |
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タイトル | Crystal structure of TILS C-terminal domain |
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要素 | tRNA(Ile)-lysidine synthase |
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キーワード | LIGASE / helix-turn-helix / pseudo-knot / ATP-binding / Nucleotide-binding / tRNA processing |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNAIle-lysidine synthase / ligase activity, forming carbon-nitrogen bonds / tRNA modification / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Lysidine-tRNA(Ile) synthetase, C-terminal / tRNA(Ile)-lysidine synthase , substrate-binding domain / TilS substrate binding domain / TilS substrate C-terminal domain / TilS substrate C-terminal domain / tRNA(Ile)-lysidine synthase / tRNA(Ile)-lysidine synthase, N-terminal / tRNA(Ile)-lysidine/2-thiocytidine synthase, N-terminal / PP-loop family / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Geobacillus kaustophilus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å |
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データ登録者 | Nakanishi, K. / Bonnefond, L. / Kimura, S. / Suzuki, T. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2009 タイトル: Structural basis for translational fidelity ensured by transfer RNA lysidine synthetase. 著者: Nakanishi, K. / Bonnefond, L. / Kimura, S. / Suzuki, T. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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履歴 | 登録 | 2009年5月21日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2009年10月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月1日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.3 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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