登録情報 | データベース: PDB / ID: 3gry |
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タイトル | Crystal Structure of the complex between S-Adenosyl Methionine and Methanocaldococcus jannaschi Dim1. |
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要素 | Dimethyladenosine transferase |
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キーワード | TRANSFERASE / DimethylAdenosine Transferase / Rossmann fold / Ribosomal Assembly S-Adenosyl-L-Methionine / RRNA Processing / RNA-Binding / Methyl Transferase / Methyltransferase / S-adenosyl-L-methionine |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity / rRNA methylation / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / RNA binding / cytosol類似検索 - 分子機能 rRNA adenine dimethylase, C-terminal domain / rRNA adenine dimethylase-like, C-terminal / Ribosomal RNA adenine dimethylase / Ribosomal RNA adenine methylase transferase, conserved site / Ribosomal RNA adenine methylase transferase, N-terminal / Ribosomal RNA adenine dimethylases signature. / Ribosomal RNA adenine dimethylases / Ribosomal RNA adenine methyltransferase KsgA/Erm / Ribosomal RNA adenine dimethylase / rRNA adenine N(6)-methyltransferase family profile. ...rRNA adenine dimethylase, C-terminal domain / rRNA adenine dimethylase-like, C-terminal / Ribosomal RNA adenine dimethylase / Ribosomal RNA adenine methylase transferase, conserved site / Ribosomal RNA adenine methylase transferase, N-terminal / Ribosomal RNA adenine dimethylases signature. / Ribosomal RNA adenine dimethylases / Ribosomal RNA adenine methyltransferase KsgA/Erm / Ribosomal RNA adenine dimethylase / rRNA adenine N(6)-methyltransferase family profile. / Helicase, Ruva Protein; domain 3 / Vaccinia Virus protein VP39 / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHATE ION / S-ADENOSYLMETHIONINE / Probable ribosomal RNA small subunit methyltransferase A類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Methanocaldococcus jannaschii (メタン生成菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å |
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データ登録者 | Scarsdale, J.N. / Musayev, F.N. / Rife, J.P. |
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引用 | |
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履歴 | 登録 | 2009年3月26日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年3月31日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2014年11月12日 | Group: Structure summary |
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改定 1.3 | 2021年10月20日 | Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.4 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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