登録情報 データベース : PDB / ID : 3f06 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure Analysis of Human HDAC8 D101A Variant. 要素Histone deacetylase 8 詳細 キーワード HYDROLASE / HDAC / metalloenzyme / arginase fold / HDAC8 / histone deacetylase 8 / hydroxamate inhibitor / mutant / Chromatin regulator / Nucleus / Repressor / Transcription / Transcription regulation機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
histone decrotonylase activity / histone deacetylase / protein lysine deacetylase activity / 加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / regulation of telomere maintenance / mitotic sister chromatid cohesion / histone deacetylase activity / nuclear chromosome / Notch-HLH transcription pathway / histone deacetylase complex ... histone decrotonylase activity / histone deacetylase / protein lysine deacetylase activity / 加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / regulation of telomere maintenance / mitotic sister chromatid cohesion / histone deacetylase activity / nuclear chromosome / Notch-HLH transcription pathway / histone deacetylase complex / negative regulation of protein ubiquitination / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / Hsp70 protein binding / epigenetic regulation of gene expression / HDACs deacetylate histones / Hsp90 protein binding / regulation of protein stability / NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription / Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants / Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants / Separation of Sister Chromatids / chromatin organization / DNA-binding transcription factor binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm / nucleus / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Histone deacetylase / Histone deacetylase domain / Arginase; Chain A / : / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-B3N / BETA-MERCAPTOETHANOL / : / Histone deacetylase 8 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.55 Å 詳細データ登録者 Dowling, D.P. / Gantt, S.L. / Gattis, S.G. / Fierke, C.A. / Christianson, D.W. 引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2008タイトル : Structural studies of human histone deacetylase 8 and its site-specific variants complexed with substrate and inhibitors.著者 : Dowling, D.P. / Gantt, S.L. / Gattis, S.G. / Fierke, C.A. / Christianson, D.W. 履歴 登録 2008年10月24日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2008年12月30日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.2 2021年10月20日 Group : Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / pdbx_struct_conn_angle ... database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.3 2023年9月6日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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