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Yorodumi- PDB-3cos: Crystal structure of human class II alcohol dehydrogenase (ADH4) ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3cos | ||||||
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Title | Crystal structure of human class II alcohol dehydrogenase (ADH4) in complex with NAD and Zn | ||||||
Components | Alcohol dehydrogenase 4 | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / medium chain dehydrogenase / alcohol dehydrogenase / Zinc-dependent / Metal-binding / NAD / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC | ||||||
Function / homology | Function and homology information benzaldehyde dehydrogenase [NAD(P)+] activity / alcohol catabolic process / quinone metabolic process / ethanol binding / all-trans-retinol dehydrogenase (NAD+) / all-trans retinal binding / S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (NAD(P)+) activity / fatty acid omega-oxidation / NADPH:quinone reductase activity / alcohol metabolic process ...benzaldehyde dehydrogenase [NAD(P)+] activity / alcohol catabolic process / quinone metabolic process / ethanol binding / all-trans-retinol dehydrogenase (NAD+) / all-trans retinal binding / S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (NAD(P)+) activity / fatty acid omega-oxidation / NADPH:quinone reductase activity / alcohol metabolic process / formaldehyde catabolic process / cellular aldehyde metabolic process / Ethanol oxidation / alcohol dehydrogenase (NAD+) activity / RA biosynthesis pathway / alcohol dehydrogenase (NAD+) activity, zinc-dependent / : / oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor / all-trans-retinol dehydrogenase (NAD+) activity / aldose reductase (NADPH) activity / retinol metabolic process / retinoid metabolic process / retinol binding / NAD binding / zinc ion binding / nucleoplasm / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.1 Å | ||||||
Authors | Kavanagh, K.L. / Shafqat, N. / Yue, W. / von Delft, F. / Bishop, S. / Roos, A. / Murray, J. / Edwards, A.M. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. ...Kavanagh, K.L. / Shafqat, N. / Yue, W. / von Delft, F. / Bishop, S. / Roos, A. / Murray, J. / Edwards, A.M. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. / Oppermann, U. / Structural Genomics Consortium (SGC) | ||||||
Citation | Journal: To be Published Title: Crystal structure of human class II alcohol dehydrogenase (ADH4) in complex with NAD and Zn. Authors: Kavanagh, K.L. / Shafqat, N. / Yue, W. / von Delft, F. / Bishop, S. / Roos, A. / Murray, J. / Edwards, A.M. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. / Oppermann, U. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3cos.cif.gz | 309.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3cos.ent.gz | 248.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3cos.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/co/3cos ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/co/3cos | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 1ee2S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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