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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3azu | ||||||
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タイトル | X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE TWO SITE-SPECIFIC MUTANTS HIS35GLN AND HIS35LEU OF AZURIN FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA | ||||||
要素 | AZURIN | ||||||
キーワード | ELECTRON TRANSFER(CUPROPROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 transition metal ion binding / periplasmic space / electron transfer activity / copper ion binding / zinc ion binding / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.1 Å | ||||||
データ登録者 | Messerschmidt, A. / Nar, H. / Huber, R. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1991 タイトル: X-ray crystal structure of the two site-specific mutants His35Gln and His35Leu of azurin from Pseudomonas aeruginosa. 著者: Nar, H. / Messerschmidt, A. / Huber, R. / van de Kamp, M. / Canters, G.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3azu.cif.gz | 113.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb3azu.ent.gz | 88.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3azu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 3azu_validation.pdf.gz | 383.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 3azu_full_validation.pdf.gz | 389.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 3azu_validation.xml.gz | 10.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 3azu_validation.cif.gz | 18.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/az/3azu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/az/3azu | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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詳細 | THERE ARE FOUR MOLECULES IN THE ASYMMETRIC UNIT WHICH ARE ARRANGED AS A DIMER OF DIMERS. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13950.796 Da / 分子数: 4 / 変異: H35Q / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) / 参照: UniProt: P00282 #2: 化合物 | ChemComp-CU / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.33 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.22 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 / PH range low: 5.7 / PH range high: 5.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.09 Å / 最低解像度: 9999 Å / Num. obs: 22537 / % possible obs: 66.6 % / Num. measured all: 99146 / Rmerge(I) obs: 0.097 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.09 Å / 最低解像度: 2.14 Å / % possible obs: 21.6 % |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.163 / 最高解像度: 2.1 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.1 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / Num. reflection obs: 20747 / Rfactor obs: 0.163 / 最低解像度: 8 Å | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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