PDB-3aae: Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3aae

タイトル

Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment

要素

32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A
F-actin-capping protein subunit alpha-1
F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

キーワード

PROTEIN BINDING / ACTIN CAPPING PROTEIN / BARBED END REGULATION / CARMIL FAMILY PROTEIN / CONFORMATIONAL CHANGE / CELL MOTILITY / Actin capping / Actin-binding / Cytoskeleton / Isopeptide bond / Leucine-rich repeat

機能・相同性

機能・相同性情報

barbed-end actin filament uncapping / positive regulation of lamellipodium organization / negative regulation of barbed-end actin filament capping / Advanced glycosylation endproduct receptor signaling / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / RHOD GTPase cycle / RHOF GTPase cycle / COPI-mediated anterograde transport / macropinosome ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Gallus gallus (ニワトリ)

Mus musculus (ハツカネズミ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.3 Å

データ登録者

Takeda, S. / Minakata, S. / Narita, A. / Kitazawa, M. / Yamakuni, T. / Maeda, Y. / Nitanai, Y.

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Two distinct mechanisms for the regulation of actin capping protein-competitive or allosteric inhibitions
著者: Takeda, S. / Minakata, S. / Narita, A. / Kitazawa, M. / Yamakuni, T. / Maeda, Y. / Nitanai, Y.

履歴

登録	2009年11月16日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2010年11月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2023年11月1日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3aae.cif.gz	536.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3aae.ent.gz	444.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3aae.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	3aae_validation.pdf.gz	550.3 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3aae_full_validation.pdf.gz	595.8 KB	表示
XML形式データ	3aae_validation.xml.gz	92 KB	表示
CIF形式データ	3aae_validation.cif.gz	124.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aa/3aae ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aa/3aae	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3aa0S 1izn 3aa1 3aa6 3aa7 3aaa S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	2vdu-3 3p1t-2 5clt-3 1k8z-d 1k1x-1 3ws8-d 4lm4-d 4h52-d 4ajf-d 4xy2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#152 - 2012年8月環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase) 類似性 (1) #143 - 2011年11月 Toll様受容体 (Toll-like Receptors) 類似性 (2) #105 - 2008年9月リボヌクレアーゼA (Ribonuclease A) 類似性 (2) #183 - 2015年3月フォトトロピン (Phototropin) 類似性 (1) #87 - 2007年3月ジンクフィンガー (Zinc Fingers) 類似性 (1) #248 - 2020年8月フィトスルホカイン受容体 (Phytosulfokine Receptor) 類似性 (1) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #68 - 2005年8月神経栄養因子 (Neurotrophins) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#152 - 2012年8月
環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase)
類似性 (1)
#143 - 2011年11月
Toll様受容体 (Toll-like Receptors)
類似性 (2)
#105 - 2008年9月
リボヌクレアーゼA (Ribonuclease A)
類似性 (2)
#183 - 2015年3月
フォトトロピン (Phototropin)
類似性 (1)
#87 - 2007年3月
ジンクフィンガー (Zinc Fingers)
類似性 (1)
#248 - 2020年8月
フィトスルホカイン受容体 (Phytosulfokine Receptor)
類似性 (1)
#245 - 2020年5月
スプライソソーム (Spliceosomes)
類似性 (1)
#68 - 2005年8月
神経栄養因子 (Neurotrophins)
類似性 (1)

登録構造単位

A: F-actin-capping protein subunit alpha-1

B: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

C: F-actin-capping protein subunit alpha-1

D: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

E: F-actin-capping protein subunit alpha-1

F: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

G: F-actin-capping protein subunit alpha-1

H: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

I: F-actin-capping protein subunit alpha-1

J: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

X: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

Y: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

Z: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

W: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

V: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

343 kDa, 15 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: F-actin-capping protein subunit alpha-1

B: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

X: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
68.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: F-actin-capping protein subunit alpha-1

D: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

Y: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
68.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

E: F-actin-capping protein subunit alpha-1

F: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

Z: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
68.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

4

G: F-actin-capping protein subunit alpha-1

H: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

W: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
68.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

5

I: F-actin-capping protein subunit alpha-1

J: F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

V: 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
68.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	231.153, 104.358, 186.633
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 119.09, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	2	A	8 - 276
2	1	1	2	C	8 - 276
3	1	1	2	E	8 - 276
4	1	1	2	G	8 - 276
5	1	1	2	I	8 - 276
1	1	2	2	B	4 - 249
2	1	2	2	D	4 - 249
3	1	2	2	F	4 - 249
4	1	2	2	H	4 - 249
5	1	2	2	J	4 - 249
1	1	3	3	X	986 - 999
2	1	3	3	Y	986 - 999
3	1	3	3	Z	986 - 999
4	1	3	3	W	986 - 999
5	1	3	3	V	986 - 999
1	1	4	5	B	252 - 264
2	1	4	5	D	252 - 264
1	1	5	5	X	974 - 985
2	1	5	5	Y	974 - 985
3	1	5	5	Z	974 - 985
4	1	5	5	W	974 - 985
5	1	5	5	V	974 - 985

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5

詳細

THE ORIGOMETRIC STATE OF THE ACTIN CAPPING PROTEIN IS A HETERO DIMER COMPOSE OF SUBUNIT A (CHAIN A) AND SUBUNIT B (CHAIN B) IN VIVO AND IN VITRO.

#1: タンパク質	F-actin-capping protein subunit alpha-1 / CapZ 36/32 / Beta-actinin subunit I 分子量: 33001.789 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: CAPZA1 / プラスミド: PETDUET1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): ROSETTA2 (DE3) / 参照: UniProt: P13127
#2: タンパク質	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 / CapZ B1 and B2 / CapZ 36/32 / Beta-actinin subunit II 分子量: 31403.449 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: CAPZB / プラスミド: PETDUET1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): ROSETTA2 (DE3) / 参照: UniProt: P14315
#3: タンパク質・ペプチド	32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A / CARMIL / CAPPING PROTEIN ARP2/3 MYOSIN I LINKER / CARMIL homolog 分子量: 4167.751 Da / 分子数: 5 / Fragment: CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Lrrc16a / プラスミド: PGEX6P1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): ROSETTA2 (DE3) / 参照: UniProt: Q6EDY6

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.87 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.12 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SPring-8 / ビームライン: BL44B2 / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 4r / 検出器: CCD / 日付: 2008年4月23日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: SI / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.3→49.7 Å / Num. obs: 58413 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 7.6 % / B_iso Wilson estimate: 38.1 Å² / R_merge(I) obs: 0.126 / Net I/σ(I): 16.4
反射シェル	解像度: 3.3→3.42 Å / 冗長度: 7.7 % / R_merge(I) obs: 0.382 / Mean I/σ(I) obs: 5.56 / Num. unique all: 5823 / % possible all: 99.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
MOLREP		位相決定
REFMAC	5.5.0072	精密化
DPS		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3AA0

3aa0

解像度: 3.3→49.7 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.869 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.843 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU B: 27.301 / SU ML: 0.45 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.576 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.27092	2955	5.1 %	RANDOM
R_work	0.24333	-	-	-
obs	0.24472	55462	99.54 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 99.82 Å² / B_iso mean: 50.947 Å² / B_iso min: 27.63 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.48 Å²	0 Å²	1.07 Å²
2-	-	0.51 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.02 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.67 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.3→49.7 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	22177	0	0	0	22177

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.01	0.022	22623
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.156	1.953	30582
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.361	5	2743
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	37.387	24.728	1159
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	18.693	15	4069
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.586	15	157
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.08	0.2	3310
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.021	17294
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.612	1.5	13744
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.144	2	22231
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.018	3	8879
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.894	4.5	8351
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	1076	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
1	C	1076	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
1	E	1076	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
1	G	1076	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
1	I	1076	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
1	A	1109	MEDIUM POSITIONAL	0.06	0.5
1	C	1109	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
1	E	1109	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
1	G	1109	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
1	I	1109	MEDIUM POSITIONAL	0.05	0.5
1	A	1076	TIGHT THERMAL	0.06	0.5
1	C	1076	TIGHT THERMAL	0.06	0.5
1	E	1076	TIGHT THERMAL	0.04	0.5
1	G	1076	TIGHT THERMAL	0.05	0.5
1	I	1076	TIGHT THERMAL	0.05	0.5
1	A	1109	MEDIUM THERMAL	0.07	2
1	C	1109	MEDIUM THERMAL	0.06	2
1	E	1109	MEDIUM THERMAL	0.05	2
1	G	1109	MEDIUM THERMAL	0.05	2
1	I	1109	MEDIUM THERMAL	0.06	2
2	B	984	TIGHT POSITIONAL	0.04	0.05
2	D	984	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
2	F	984	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
2	H	984	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
2	J	984	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
2	B	952	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
2	D	952	MEDIUM POSITIONAL	0.05	0.5
2	F	952	MEDIUM POSITIONAL	0.05	0.5
2	H	952	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
2	J	952	MEDIUM POSITIONAL	0.04	0.5
2	B	984	TIGHT THERMAL	0.08	0.5
2	D	984	TIGHT THERMAL	0.05	0.5
2	F	984	TIGHT THERMAL	0.05	0.5
2	H	984	TIGHT THERMAL	0.06	0.5
2	J	984	TIGHT THERMAL	0.06	0.5
2	B	952	MEDIUM THERMAL	0.09	2
2	D	952	MEDIUM THERMAL	0.06	2
2	F	952	MEDIUM THERMAL	0.05	2
2	H	952	MEDIUM THERMAL	0.07	2
2	J	952	MEDIUM THERMAL	0.07	2
3	X	52	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
3	Y	52	TIGHT POSITIONAL	0.02	0.05
3	Z	52	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
3	W	52	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
3	V	52	TIGHT POSITIONAL	0.03	0.05
3	X	65	LOOSE POSITIONAL	0.03	5
3	Y	65	LOOSE POSITIONAL	0.03	5
3	Z	65	LOOSE POSITIONAL	0.03	5
3	W	65	LOOSE POSITIONAL	0.03	5
3	V	65	LOOSE POSITIONAL	0.03	5
3	X	52	TIGHT THERMAL	0.06	0.5
3	Y	52	TIGHT THERMAL	0.03	0.5
3	Z	52	TIGHT THERMAL	0.04	0.5
3	W	52	TIGHT THERMAL	0.05	0.5
3	V	52	TIGHT THERMAL	0.07	0.5
3	X	65	LOOSE THERMAL	0.08	10
3	Y	65	LOOSE THERMAL	0.04	10
3	Z	65	LOOSE THERMAL	0.04	10
3	W	65	LOOSE THERMAL	0.05	10
3	V	65	LOOSE THERMAL	0.05	10
4	B	52	MEDIUM POSITIONAL	0.3	0.5
4	D	64	LOOSE POSITIONAL	1.11	5
4	B	52	MEDIUM THERMAL	0.51	2
4	D	64	LOOSE THERMAL	0.53	10
5	X	32	MEDIUM POSITIONAL	0.45	0.5
5	Y	32	MEDIUM POSITIONAL	0.36	0.5
5	Z	32	MEDIUM POSITIONAL	0.3	0.5
5	W	32	MEDIUM POSITIONAL	0.52	0.5
5	V	32	MEDIUM POSITIONAL	0.46	0.5
5	X	33	LOOSE POSITIONAL	1.51	5
5	Y	33	LOOSE POSITIONAL	1.23	5
5	Z	33	LOOSE POSITIONAL	1.29	5
5	W	33	LOOSE POSITIONAL	1.37	5
5	V	33	LOOSE POSITIONAL	1.45	5
5	X	32	MEDIUM THERMAL	1.3	2
5	Y	32	MEDIUM THERMAL	0.53	2
5	Z	32	MEDIUM THERMAL	0.22	2
5	W	32	MEDIUM THERMAL	0.44	2
5	V	32	MEDIUM THERMAL	0.33	2
5	X	33	LOOSE THERMAL	0.95	10
5	Y	33	LOOSE THERMAL	0.34	10
5	Z	33	LOOSE THERMAL	0.33	10
5	W	33	LOOSE THERMAL	0.38	10
5	V	33	LOOSE THERMAL	0.31	10

LS精密化シェル

解像度: 3.3→3.385 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.351	217	-
R_work	0.312	4072	-
all	-	4289	-
obs	-	-	99.26 %

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)