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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 345d | ||||||||||||||||||
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タイトル | STRUCTURAL PARAMETERS FROM SINGLE-CRYSTAL STRUCTURES FOR ACCURATE MODELS OF A-DNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / A-DNA / DOUBLE HELIX / MODIFIED | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() ![]() Mooers, B.H.M. / Eichman, B.F. / Ho, P.S. | ![]() ![]() タイトル: Structural Parameters from Single-Crystal Structures for Accurate Models of A-DNA 著者: Mooers, B.H.M. / Eichman, B.F. / Ho, P.S. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 12 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 356.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 356.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2442.620 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.41 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.91 % |
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結晶化 | pH: 7 / 詳細: pH 7.00 |
溶液の組成 | 名称: WATER |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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検出器 | タイプ: SIEMENS HI-STAR / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1996年5月25日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.68→15.3 Å / Num. obs: 2847 / % possible obs: 86.03 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.03 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 24.91 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file | Serial no: 1 / Param file: PAR.DNA / Topol file: TOP.DNA |