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- PDB-2xwt: CRYSTAL STRUCTURE OF THE TSH RECEPTOR IN COMPLEX WITH A BLOCKING ... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 2xwt
タイトルCRYSTAL STRUCTURE OF THE TSH RECEPTOR IN COMPLEX WITH A BLOCKING TYPE TSHR AUTOANTIBODY
要素
  • (THYROID BLOCKING HUMAN AUTOANTIBODY K1-70 ...) x 2
  • THYROTROPIN RECEPTOR
キーワードSIGNALING PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM COMPLEX / GPCR / GRAVES' DISEASE / AUTOIMMUNITY / RECEPTOR-AUTOANTIBODY COMPLEX
機能・相同性
機能・相同性情報


thyroid-stimulating hormone signaling pathway / cellular response to thyrotropin-releasing hormone / thyroid-stimulating hormone receptor activity / cellular response to glycoprotein / Hormone ligand-binding receptors / G protein-coupled peptide receptor activity / G protein-coupled receptor signaling pathway, coupled to cyclic nucleotide second messenger / hormone-mediated signaling pathway / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / cell-cell signaling ...thyroid-stimulating hormone signaling pathway / cellular response to thyrotropin-releasing hormone / thyroid-stimulating hormone receptor activity / cellular response to glycoprotein / Hormone ligand-binding receptors / G protein-coupled peptide receptor activity / G protein-coupled receptor signaling pathway, coupled to cyclic nucleotide second messenger / hormone-mediated signaling pathway / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / cell-cell signaling / positive regulation of cold-induced thermogenesis / signaling receptor activity / G alpha (s) signalling events / basolateral plasma membrane / receptor complex / cell surface receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor signaling pathway / positive regulation of cell population proliferation / protein-containing complex binding / cell surface / plasma membrane
類似検索 - 分子機能
Thyrotropin receptor / BspA type Leucine rich repeat region / Glycoprotein hormone receptor family / BspA type Leucine rich repeat region (6 copies) / Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix) / Ribonuclease Inhibitor / Alpha-Beta Horseshoe / Leucine-rich repeat domain superfamily / G-protein coupled receptors family 1 signature. / G protein-coupled receptor, rhodopsin-like ...Thyrotropin receptor / BspA type Leucine rich repeat region / Glycoprotein hormone receptor family / BspA type Leucine rich repeat region (6 copies) / Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix) / Ribonuclease Inhibitor / Alpha-Beta Horseshoe / Leucine-rich repeat domain superfamily / G-protein coupled receptors family 1 signature. / G protein-coupled receptor, rhodopsin-like / GPCR, rhodopsin-like, 7TM / G-protein coupled receptors family 1 profile. / 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Thyrotropin receptor
類似検索 - 構成要素
生物種HOMO SAPIENS (ヒト)
手法X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å
データ登録者Sanders, J. / Sanders, P. / Young, S. / Kabelis, K. / Baker, S. / Sullivan, A. / Evans, M. / Clark, J. / Wilmot, J. / Hu, X. ...Sanders, J. / Sanders, P. / Young, S. / Kabelis, K. / Baker, S. / Sullivan, A. / Evans, M. / Clark, J. / Wilmot, J. / Hu, X. / Roberts, E. / Powell, M. / Nunez Miguel, R. / Furmaniak, J. / Rees Smith, B.
引用
ジャーナル: J.Mol.Endocrinol. / 年: 2011
タイトル: Crystal Structure of the Tsh Receptor (Tshr) Bound to a Blocking-Type Tshr Autoantibody.
著者: Sanders, P. / Young, S. / Sanders, J. / Kabelis, K. / Baker, S. / Sullivan, A. / Evans, M. / Clark, J. / Wilmot, J. / Hu, X. / Roberts, E. / Powell, M. / Nunez Miguel, R. / Furmaniak, J. / Rees Smith, B.
#1: ジャーナル: Thyroid / 年: 2007
タイトル: Crystal Structure of the Tsh Receptor in Complex with a Thyroid-Stimulating Autoantibody
著者: Sanders, J. / Chirgadze, D.Y. / Sanders, P. / Baker, S. / Sullivan, A. / Bhardwaja, A. / Bolton, J. / Reeve, M. / Nakatake, N. / Evans, M. / Richards, T. / Powell, M. / Miguel, R.N. / ...著者: Sanders, J. / Chirgadze, D.Y. / Sanders, P. / Baker, S. / Sullivan, A. / Bhardwaja, A. / Bolton, J. / Reeve, M. / Nakatake, N. / Evans, M. / Richards, T. / Powell, M. / Miguel, R.N. / Blundell, T.L. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#2: ジャーナル: Clinical Endocrinol. / 年: 2010
タイトル: Monoclonal Autoantibodies to the Tsh Receptor, One with Stimulating Activity and One with Blocking Activity, Obtained from the Same Blood Sample.
著者: Evans, M. / Sanders, J. / Tagami, T. / Sanders, P. / Young, S. / Roberts, E. / Wilmot, J. / Hu, X. / Kabelis, K. / Clark, J. / Holl, S. / Richards, T. / Collyer, A. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#3: ジャーナル: Horm.Metab.Res. / 年: 2009
タイトル: Tsh Receptor - Autoantibody Interactions.
著者: Rees Smith, B. / Sanders, J. / Evans, M. / Tagami, T. / Furmaniak, J.
#4: ジャーナル: Lancet / 年: 2003
タイトル: Human Monoclonal Thyroid Stimulating Autoantibody
著者: Sanders, J. / Evans, M. / Premawardhana, L.D.K.E. / Depraetere, H. / Jeffreys, J. / Richards, T. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#5: ジャーナル: Thyroid / 年: 2004
タイトル: Characteristics of a Human Monoclonal Autoantibody to the Thyrotropin Receptor: Sequence Structure and Function
著者: Sanders, J. / Jeffreys, J. / Depraetere, H. / Evans, M. / Richards, T. / Kiddie, A. / Brereton, K. / Premawardhana, L.D.K.E. / Chirgadze, D.Y. / Miguel, R.N. / Blundell, T.L. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#6: ジャーナル: J.Mol.Endocrinol. / 年: 2009
タイトル: Thyroid Stimulating Autoantibody M22 Mimics Tsh Binding to the Tsh Receptor Leucine Rich Domain: A Comparative Structural Study of Protein-Protein Interactions.
著者: Nunez Miguel, R. / Sanders, J. / Chirgadze, D.Y. / Furmaniak, J. / Rees Smith, B.
#7: ジャーナル: Thyroid / 年: 2006
タイトル: Effects of Tsh Receptor Mutations on Binding and Biological Activity of Monoclonal Antibodies and Tsh
著者: Sanders, J. / Bolton, J. / Sanders, P. / Jeffreys, J. / Nakatake, N. / Richards, T. / Evans, M. / Kiddie, A. / Summerhayes, S. / Roberts, E. / Miguel, R.N. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#8: ジャーナル: Thyroid / 年: 2007
タイトル: Molecular Interactions between the Tsh Receptor and a Thyroid-Stimulating Monoclonal Autoantibody
著者: Sanders, J. / Miguel, R.N. / Bolton, J. / Bhardwaja, A. / Sanders, P. / Nakatake, N. / Evans, M. / Furmaniak, J. / Smith, B.R.
#9: ジャーナル: J.Mol.Endocrinol. / 年: 2008
タイトル: Fsh and Tsh Binding to Their Respective Receptors: Similarities, Differences and Implication for Glycoprotein Hormone Specificity
著者: Miguel, R.N. / Sanders, J. / Chirgadze, D.Y. / Blundell, T.L. / Furmaniak, J. / Rees Smith, B.
履歴
登録2010年11月5日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02011年3月9日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年5月8日Group: Version format compliance
改定 1.22011年7月13日Group: Version format compliance
改定 1.32017年6月28日Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.type
改定 1.42019年4月3日Group: Data collection / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / Item: _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line
改定 2.02020年7月29日Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary
カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen
Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id
解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.12023年12月20日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn
Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 2.22024年11月6日Group: Structure summary
カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: THYROID BLOCKING HUMAN AUTOANTIBODY K1-70 HEAVY CHAIN
B: THYROID BLOCKING HUMAN AUTOANTIBODY K1-70 LIGHT CHAIN
C: THYROTROPIN RECEPTOR
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)74,7957
ポリマ－73,1793
非ポリマー1,6154
水14,376798
1


  • 登録構造と同一
  • ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area6450 Å2
ΔGint-29.3 kcal/mol
Surface area35920 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)83.020, 89.300, 101.270
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

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要素

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抗体 , 2種, 2分子 AB

#1: 抗体 THYROID BLOCKING HUMAN AUTOANTIBODY K1-70 HEAVY CHAIN


分子量: 23637.561 Da / 分子数: 1 / 断片: FAB FRAGMENT HEAVY CHAIN, RESIDUES 1-229 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト)
発現宿主: MOUSE-HUMAN HETEROHYBRIDOMA CELL LINE (その他)
#2: 抗体 THYROID BLOCKING HUMAN AUTOANTIBODY K1-70 LIGHT CHAIN


分子量: 22598.064 Da / 分子数: 1 / 断片: FAB FRAGMENT LIGHT CHAIN, RESIDUES 1-213 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト)
発現宿主: MOUSE-HUMAN HETEROHYBRIDOMA CELL LINE (その他)

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タンパク質 / 非ポリマー , 2種, 799分子 C

#3: タンパク質 THYROTROPIN RECEPTOR / THYROID-STIMULATING HORMONE RECEPTOR / TSH-R


分子量: 26943.828 Da / 分子数: 1 / 断片: LEUCINE RICH REPEAT DOMAIN, RESIDUES 22-260 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: TRICHOPLUSIA NI (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P16473
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 798 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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糖 , 3種, 4分子

#4: 多糖 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-Glycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}LINUCSPDB-CARE
#5: 多糖 alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1- ...alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 748.682 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-Glycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c6-d1WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}LINUCSPDB-CARE
#6: 糖 ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン


タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C8H15NO6
識別子タイププログラム
DGlcpNAcbCONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamineCOMMON NAMEGMML 1.0
b-D-GlcpNAcIUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLPDB-CARE 1.0
GlcNAcSNFG CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0

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詳細

Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.62 Å3/Da / 溶媒含有率: 53 % / 解説: NONE
結晶化pH: 5 / 詳細: 16% PEG 3350, 0.2 M SODIUM MALONATE PH 5.

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU MICROMAX-007 HF / 波長: 1.54
検出器タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2009年11月17日 / 詳細: COLLIMATOR
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.9→30 Å / Num. obs: 56573 / % possible obs: 94.5 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.1 % / Biso Wilson estimate: 0 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 11.7
反射 シェル解像度: 1.9→1.95 Å / Rmerge(I) obs: 0.3 / Mean I/σ(I) obs: 3.5 / % possible all: 64.8

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
REFMAC5.5.0072精密化
MOSFLMデータ削減
SCALAデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3G04

3g04


解像度: 1.9→66.98 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.952 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.924 / SU B: 2.911 / SU ML: 0.087 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.156 / ESU R Free: 0.149 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES REFINED INDIVIDUALLY.
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.22674 2861 5.1 %RANDOM
Rwork0.17691 ---
obs0.17943 53657 94.24 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 16.891 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1-1.32 Å20 Å20 Å2
2---0.7 Å20 Å2
3----0.62 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.9→66.98 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数5028 0 106 798 5932
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0110.0225303
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d0.0010.023469
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.3441.9857261
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg0.84538529
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg6.4785666
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg37.40924.822197
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg12.28815814
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg18.9451514
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.080.2852
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0060.0215804
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other0.0010.02983
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it0.6861.53315
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_other0.1661.51328
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it1.25925393
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it1.96531988
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it3.2114.51864
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded
LS精密化 シェル解像度: 1.9→1.949 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.314 138 -
Rwork0.262 2692 -
obs--64.8 %

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

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  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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