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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2wt8 | ||||||
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タイトル | Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (Mcph1) | ||||||
![]() | MICROCEPHALIN | ||||||
![]() | CELL CYCLE / CHROMOSOME CONDENSATION / DWARFISM / POLYMORPHISM / MICROCEPHALY / PHOSPHOPROTEIN / MENTAL RETARDATION / PRIMARY MICROCEPHALY | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of chromosome condensation / neuronal stem cell population maintenance / regulation of centrosome cycle / protein localization to centrosome / establishment of mitotic spindle orientation / Condensation of Prophase Chromosomes / bone development / cerebral cortex development / mitotic cell cycle / regulation of inflammatory response ...regulation of chromosome condensation / neuronal stem cell population maintenance / regulation of centrosome cycle / protein localization to centrosome / establishment of mitotic spindle orientation / Condensation of Prophase Chromosomes / bone development / cerebral cortex development / mitotic cell cycle / regulation of inflammatory response / centrosome / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Richards, M.W. / Roe, S.M. / Bayliss, R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A Pocket on the Surface of the N-Terminal Brct Domain of Mcph1 is Required to Prevent Abnormal Chromosome Condensation. 著者: Richards, M.W. / Leung, J.W.C. / Roe, S.M. / Chen, J. / Bayliss, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 162.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 137 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 455.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 457.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 30.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10818.010 Da / 分子数: 4 / 断片: N-TERMINAL BRCT DOMAIN, RESIDUES 1-95 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-CL / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | N-TERMINAL GA FROM VECTOR SEQUENCE | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.77 % / 解説: NONE |
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結晶化 | 詳細: 100 MM MES, PH 6.0, 18% PEG 6000, 200 MM NH4CL |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.92 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.6→45.27 Å / Num. obs: 56453 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 4.3 % / Biso Wilson estimate: 19.66 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 16.1 |
反射 シェル | 解像度: 1.6→1.69 Å / 冗長度: 3.6 % / Rmerge(I) obs: 0.34 / Mean I/σ(I) obs: 3.2 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: NONE 解像度: 1.6→45.248 Å / SU ML: 0.24 / σ(F): 0.01 / 位相誤差: 21.55 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 49.822 Å2 / ksol: 0.357 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 28.02 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→45.248 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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