登録情報 データベース : PDB / ID : 2wda 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The X-ray structure of the Streptomyces coelicolor A3 Chondroitin AC Lyase in Complex with Chondroitin sulphate 要素PUTATIVE SECRETED LYASE 詳細 キーワード LYASE / HYALURONATE LYASE / CHONDROITIN LYASE / FAMILY 8機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
carbohydrate binding / carbohydrate metabolic process / lyase activity / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Polysaccharide lyase 8 / Polysaccharide lyase 8, N-terminal alpha-helical / Polysaccharide lyase family 8, N terminal alpha-helical domain / Polysaccharide lyase family 8, C-terminal / Polysaccharide lyase family 8, C-terminal beta-sandwich domain / Polysaccharide lyase family 8, central domain / Polysaccharide lyase family 8, super-sandwich domain / Polysaccharide lyase family 8-like, C-terminal / Chondroitin AC/alginate lyase / Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3 ... Polysaccharide lyase 8 / Polysaccharide lyase 8, N-terminal alpha-helical / Polysaccharide lyase family 8, N terminal alpha-helical domain / Polysaccharide lyase family 8, C-terminal / Polysaccharide lyase family 8, C-terminal beta-sandwich domain / Polysaccharide lyase family 8, central domain / Polysaccharide lyase family 8, super-sandwich domain / Polysaccharide lyase family 8-like, C-terminal / Chondroitin AC/alginate lyase / Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3 / Polysaccharide lyase family 8-like, C-terminal / Chondroitin AC/alginate lyase / Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 - #10 / Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding / Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 / Galactose mutarotase-like domain superfamily / Glycosyltransferase / Alpha/alpha barrel / Twin arginine translocation (Tat) signal profile. / Twin-arginine translocation pathway, signal sequence / Distorted Sandwich / Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 FORMIC ACID / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Secreted lyase 類似検索 - 構成要素生物種 STREPTOMYCES VIOLACEORUBER (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.3 Å 詳細データ登録者 Elmabrouk, Z.H. / Taylor, E.J. / Vincent, F. / Smith, N.L. / Turkenburg, J.P. / Davies, G.J. / Black, G.W. 引用ジャーナル : Proteins / 年 : 2011タイトル : Crystal Structures of a Family 8 Polysaccharide Lyase Reveal Open and Highly Occluded Substrate-Binding Cleft Conformations.著者 : Elmabrouk, Z.H. / Vincent, F. / Zhang, M. / Smith, N.L. / Turkenburg, J.P. / Charnock, S.J. / Black, G.W. / Taylor, E.J. 履歴 登録 2009年3月23日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2010年4月21日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Other / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.src_method / _entity.type / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_asym.entity_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年12月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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