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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2vfc | ||||||
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タイトル | The structure of Mycobacterium marinum arylamine N-acetyltransferase in complex with CoA | ||||||
![]() | ARYLAMINE N-ACETYLTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fullam, E. / Westwood, I.M. / Anderton, M.C. / Lowe, E.D. / Sim, E. / Noble, M.E.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Divergence of Cofactor Recognition Across Evolution: Coenzyme a Binding in a Prokaryotic Arylamine N-Acetyltransferase. 著者: Fullam, E. / Westwood, I.M. / Anderton, M.C. / Lowe, E.D. / Sim, E. / Noble, M.E.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 118.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 91.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 901.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 915.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 25.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 35 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (0.08485, 0.97981, 0.18104), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30668.752 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | C-TERMINAL HIS TAG ADDED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.86 Å3/Da / 溶媒含有率: 33.9 % / 解説: NONE |
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結晶化 | pH: 5.6 詳細: 0.1M NA CITRATE PH5.6, 10% W/V 2-PROPANOL AND 22% PEG 4,000 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 詳細: TOROIDAL MIRROR |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.98 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.6→24.88 Å / Num. obs: 16557 / % possible obs: 97.3 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.27 % / Rmerge(I) obs: 0.16 / Net I/σ(I): 4.27 |
反射 シェル | 解像度: 2.7→2.85 Å / 冗長度: 3.39 % / Rmerge(I) obs: 0.4 / Mean I/σ(I) obs: 1.8 / % possible all: 88.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 2VFB 解像度: 2.7→30.23 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.933 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.888 / SU B: 24.74 / SU ML: 0.268 / TLS residual ADP flag: UNVERIFIED / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.378 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK BULK SOLVENT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 5.75 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→30.23 Å
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拘束条件 |
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