PDB-2uvd: The crystal structure of a 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reduc...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2uvd

タイトル

The crystal structure of a 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase from Bacillus anthracis (BA3989)

要素

3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

キーワード

OXIDOREDUCTASE / 3-OXOACYL-(ACYL CARRIER PROTEIN) REDUCTASE / BETA-KETOACYL-(ACYL CARRIER PROTEIN) REDUCTASE / SHORT-CHAIN DEHYDROGENASE/REDUCTASE (SDR) / OXFORD PROTEIN PRODUCTION FACILITY / NADP / FABG / OPPF / LIPID SYNTHESIS / STRUCTURAL PROTEOMICS IN EUROPE (SPINE) / STRUCTURAL GENOMICS / FATTY ACID BIOSYNTHESIS

機能・相同性

機能・相同性情報

: / : / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity / fatty acid biosynthetic process / NAD binding
類似検索 - 分子機能

生物種

BACILLUS ANTHRACIS (炭疽菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Zaccai, N.R. / Carter, L.G. / Berrow, N.S. / Sainsbury, S. / Nettleship, J.E. / Walter, T.S. / Harlos, K. / Owens, R.J. / Wilson, K.S. / Stuart, D.I. ...

引用

ジャーナル: Proteins: Struct., Funct., Bioinf. / 年: 2008
タイトル: Crystal Structure of a 3-Oxoacyl-(Acylcarrier Protein) Reductase (Ba3989) from Bacillus Anthracis at 2.4-A Resolution.
著者: Zaccai, N.R. / Carter, L.G. / Berrow, N.S. / Sainsbury, S. / Nettleship, J.E. / Walter, T.S. / Harlos, K. / Owens, R.J. / Wilson, K.S. / Stuart, D.I. / Esnouf, R.M.

履歴

登録	2007年3月9日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2007年4月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年5月8日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.3	2017年5月24日	Group: Structure summary
改定 1.4	2023年12月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb2uvd.ent.gz	305.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2uvd.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	2uvd_validation.pdf.gz	486.9 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2uvd_full_validation.pdf.gz	523.2 KB	表示
XML形式データ	2uvd_validation.xml.gz	72.2 KB	表示
CIF形式データ	2uvd_validation.cif.gz	100 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uv/2uvd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uv/2uvd	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1q7cS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3awd-d 4jro-d 5zfm-d 1h5q-3 1i01-1 3svt-1 3pib-d 4wk6-d 3ezl-1 3jq9-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#90 - 2007年6月脂肪酸合成酵素 (Fatty Acid Synthase) 類似性 (2)

登録構造単位

A: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

B: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

C: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

D: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

E: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

F: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

G: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

H: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

209 kDa, 8 ポリマー
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1

A: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

B: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

C: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

D: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
105 kDa, 4 ポリマー
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2

E: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

F: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

G: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

H: 3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
105 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	70.620, 120.650, 136.380
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 104.42, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E
6	1	F
7	1	G
8	1	H

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LEU	LEU	ALA	ALA	A	A	2 - 36	2 - 36
2	1	LEU	LEU	ALA	ALA	B	B	2 - 36	2 - 36
3	1	LEU	LEU	ALA	ALA	C	C	2 - 36	2 - 36
4	1	LEU	LEU	ALA	ALA	D	D	2 - 36	2 - 36
5	1	LEU	LEU	ALA	ALA	E	E	2 - 36	2 - 36
6	1	LEU	LEU	ALA	ALA	F	F	2 - 36	2 - 36
7	1	LEU	LEU	ALA	ALA	G	G	2 - 36	2 - 36
8	1	LEU	LEU	ALA	ALA	H	H	2 - 36	2 - 36
1	2	LYS	LYS	VAL	VAL	A	A	41 - 59	41 - 59
2	2	LYS	LYS	VAL	VAL	B	B	41 - 59	41 - 59
3	2	LYS	LYS	VAL	VAL	C	C	41 - 59	41 - 59
4	2	LYS	LYS	VAL	VAL	D	D	41 - 59	41 - 59
5	2	LYS	LYS	VAL	VAL	E	E	41 - 59	41 - 59
6	2	LYS	LYS	VAL	VAL	F	F	41 - 59	41 - 59
7	2	LYS	LYS	VAL	VAL	G	G	41 - 59	41 - 59
8	2	LYS	LYS	VAL	VAL	H	H	41 - 59	41 - 59
1	3	VAL	VAL	ALA	ALA	A	A	63 - 66	63 - 66
2	3	VAL	VAL	ALA	ALA	B	B	63 - 66	63 - 66
3	3	VAL	VAL	ALA	ALA	C	C	63 - 66	63 - 66
4	3	VAL	VAL	ALA	ALA	D	D	63 - 66	63 - 66
5	3	VAL	VAL	ALA	ALA	E	E	63 - 66	63 - 66
6	3	VAL	VAL	ALA	ALA	F	F	63 - 66	63 - 66
7	3	VAL	VAL	ALA	ALA	G	G	63 - 66	63 - 66
8	3	VAL	VAL	ALA	ALA	H	H	63 - 66	63 - 66
1	4	ASP	ASP	THR	THR	A	A	68 - 70	68 - 70
2	4	ASP	ASP	THR	THR	B	B	68 - 70	68 - 70
3	4	ASP	ASP	THR	THR	C	C	68 - 70	68 - 70
4	4	ASP	ASP	THR	THR	D	D	68 - 70	68 - 70
5	4	ASP	ASP	THR	THR	E	E	68 - 70	68 - 70
6	4	ASP	ASP	THR	THR	F	F	68 - 70	68 - 70
7	4	ASP	ASP	THR	THR	G	G	68 - 70	68 - 70
8	4	ASP	ASP	THR	THR	H	H	68 - 70	68 - 70
1	5	MET	MET	LEU	LEU	A	A	72 - 98	72 - 98
2	5	MET	MET	LEU	LEU	B	B	72 - 98	72 - 98
3	5	MET	MET	LEU	LEU	C	C	72 - 98	72 - 98
4	5	MET	MET	LEU	LEU	D	D	72 - 98	72 - 98
5	5	MET	MET	LEU	LEU	E	E	72 - 98	72 - 98
6	5	MET	MET	LEU	LEU	F	F	72 - 98	72 - 98
7	5	MET	MET	LEU	LEU	G	G	72 - 98	72 - 98
8	5	MET	MET	LEU	LEU	H	H	72 - 98	72 - 98
1	6	MET	MET	VAL	VAL	A	A	101 - 124	101 - 124
2	6	MET	MET	VAL	VAL	B	B	101 - 124	101 - 124
3	6	MET	MET	VAL	VAL	C	C	101 - 124	101 - 124
4	6	MET	MET	VAL	VAL	D	D	101 - 124	101 - 124
5	6	MET	MET	VAL	VAL	E	E	101 - 124	101 - 124
6	6	MET	MET	VAL	VAL	F	F	101 - 124	101 - 124
7	6	MET	MET	VAL	VAL	G	G	101 - 124	101 - 124
8	6	MET	MET	VAL	VAL	H	H	101 - 124	101 - 124
1	7	MET	MET	LEU	LEU	A	A	128 - 172	128 - 172
2	7	MET	MET	LEU	LEU	B	B	128 - 172	128 - 172
3	7	MET	MET	LEU	LEU	C	C	128 - 172	128 - 172
4	7	MET	MET	LEU	LEU	D	D	128 - 172	128 - 172
5	7	MET	MET	LEU	LEU	E	E	128 - 172	128 - 172
6	7	MET	MET	LEU	LEU	F	F	128 - 172	128 - 172
7	7	MET	MET	LEU	LEU	G	G	128 - 172	128 - 172
8	7	MET	MET	LEU	LEU	H	H	128 - 172	128 - 172
1	8	ILE	ILE	ALA	ALA	A	A	177 - 188	177 - 188
2	8	ILE	ILE	ALA	ALA	B	B	177 - 188	177 - 188
3	8	ILE	ILE	ALA	ALA	C	C	177 - 188	177 - 188
4	8	ILE	ILE	ALA	ALA	D	D	177 - 188	177 - 188
5	8	ILE	ILE	ALA	ALA	E	E	177 - 188	177 - 188
6	8	ILE	ILE	ALA	ALA	F	F	177 - 188	177 - 188
7	8	ILE	ILE	ALA	ALA	G	G	177 - 188	177 - 188
8	8	ILE	ILE	ALA	ALA	H	H	177 - 188	177 - 188
1	9	LEU	LEU	ALA	ALA	A	A	204 - 219	204 - 219
2	9	LEU	LEU	ALA	ALA	B	B	204 - 219	204 - 219
3	9	LEU	LEU	ALA	ALA	C	C	204 - 219	204 - 219
4	9	LEU	LEU	ALA	ALA	D	D	204 - 219	204 - 219
5	9	LEU	LEU	ALA	ALA	E	E	204 - 219	204 - 219
6	9	LEU	LEU	ALA	ALA	F	F	204 - 219	204 - 219
7	9	LEU	LEU	ALA	ALA	G	G	204 - 219	204 - 219
8	9	LEU	LEU	ALA	ALA	H	H	204 - 219	204 - 219
1	10	ALA	ALA	VAL	VAL	A	A	221 - 245	221 - 245
2	10	ALA	ALA	VAL	VAL	B	B	221 - 245	221 - 245
3	10	ALA	ALA	VAL	VAL	C	C	221 - 245	221 - 245
4	10	ALA	ALA	VAL	VAL	D	D	221 - 245	221 - 245
5	10	ALA	ALA	VAL	VAL	E	E	221 - 245	221 - 245
6	10	ALA	ALA	VAL	VAL	F	F	221 - 245	221 - 245
7	10	ALA	ALA	VAL	VAL	G	G	221 - 245	221 - 245
8	10	ALA	ALA	VAL	VAL	H	H	221 - 245	221 - 245

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.93814, 0.23725, 0.2522), (0.24607, -0.05561, 0.96765), (0.2436, 0.96986, -0.00621)	32.275, -31.075, 22.29
2	given	(-0.19925, -0.79471, 0.57336), (-0.78999, -0.21594, -0.57383), (0.57984, -0.56728, -0.58479)	-1.965, -11.003, -11.919
3	given	(0.15715, 0.55015, -0.82015), (0.54577, -0.74051, -0.39215), (-0.82307, -0.38598, -0.41663)	28.416, -42.705, 11.671
4	given	(-0.97921, -0.19686, -0.04897), (0.04646, 0.01734, -0.99877), (0.19747, -0.98028, -0.00783)	53.482, 34.802, 20.066
5	given	(0.98263, -0.05032, -0.17863), (-0.04321, -0.99812, 0.04347), (-0.18048, -0.035, -0.98296)	-5.521, -1.11, 68.768
6	given	(0.28027, -0.53824, 0.79482), (0.6457, 0.7184, 0.25881), (-0.7103, 0.44068, 0.54888)	-28.85, -72.151, -12.895
7	given	(-0.28424, 0.77964, -0.558), (-0.65918, 0.2637, 0.70423), (0.69619, 0.568, 0.43897)	39.956, -46.215, -54.575

#1: タンパク質	3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE / 3-OXOACYL-ACYL CARRIER PROTEIN REDUCTASE 分子量: 26157.039 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) BACILLUS ANTHRACIS (炭疽菌) / 株: AMES / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): B834(DE3) 参照: UniProt: Q81JG6, UniProt: A0A6L7H0J7*PLUS, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 575 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

#1: タンパク質

3-OXOACYL-(ACYL-CARRIER-PROTEIN) REDUCTASE / 3-OXOACYL-ACYL CARRIER PROTEIN REDUCTASE

分子量: 26157.039 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

BACILLUS ANTHRACIS (炭疽菌) / 株: AMES / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): B834(DE3)
参照: UniProt: Q81JG6, UniProt: A0A6L7H0J7*PLUS, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase

#2: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 575 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.54 Å³/Da / 溶媒含有率: 52 %
結晶化	pH: 7 詳細: HAMPTON INDEX CONDITION 88: POLYETHYLENE GLYCOL 3350 20 % (W/V) AND 0.2 M TRI-AMMONIUM CITRATE PH 7.0

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SRS / ビームライン: PX14.1 / 波長: 1.488
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2004年2月27日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.488 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.4→30 Å / Num. obs: 82223 / % possible obs: 94.3 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.1 % / R_merge(I) obs: 0.15 / Net I/σ(I): 9
反射シェル	解像度: 2.4→2.46 Å / 冗長度: 1.5 % / R_merge(I) obs: 0.55 / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / % possible all: 64.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0019	精密化
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
AMoRE		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1Q7C

1q7c

解像度: 2.4→27.77 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.953 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.926 / SU B: 17.483 / SU ML: 0.203 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.432 / ESU R Free: 0.249 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.225	4130	5.1 %	RANDOM
R_work	0.18	-	-	-
obs	0.182	77199	94 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 47.94 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.9 Å²	0 Å²	2.07 Å²
2-	-	-1.52 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.65 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→27.77 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14624	0	0	575	15199

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.013	0.022	14744
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.005	0.02	9544
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.34	1.952	19928
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.358	3	23560
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.402	5	1960
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	40.313	26.053	608
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	18.975	15	2656
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	21.148	15	72
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.096	0.2	2424
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	16608
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.002	0.02	2656
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.207	0.2	3180
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.203	0.2	9963
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.167	0.2	7416
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.089	0.2	8215
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.164	0.2	481
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.407	0.2	59
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.426	0.2	159
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.382	0.2	13
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	4.725	5	12700
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	5.227	10	15552
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	8.884	10	5654
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	12.132	20	4376
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 2529 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	tight positional	0.03	0.05
2	B	tight positional	0.04	0.05
3	C	tight positional	0.04	0.05
4	D	tight positional	0.04	0.05
5	E	tight positional	0.05	0.05
6	F	tight positional	0.05	0.05
7	G	tight positional	0.03	0.05
8	H	tight positional	0.03	0.05
1	A	tight thermal	3.06	10
2	B	tight thermal	3.32	10
3	C	tight thermal	3.33	10
4	D	tight thermal	3.33	10
5	E	tight thermal	3.42	10
6	F	tight thermal	3.27	10
7	G	tight thermal	3.46	10
8	H	tight thermal	3.31	10

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.46 Å / Total num. of bins used: 20 /

	R_factor	反射数
R_free	0.326	175
R_work	0.263	3687

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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