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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2qtj | ||||||
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タイトル | Solution structure of human dimeric immunoglobulin A | ||||||
要素 |
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キーワード | IMMUNE SYSTEM / X-ray and neutron solution scattering / immunology / antibody / immunoglobulin A1 / Chromophore / Glycoprotein / Immunoglobulin C region / Immunoglobulin domain | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 secretory dimeric IgA immunoglobulin complex / monomeric IgA immunoglobulin complex / secretory IgA immunoglobulin complex / glomerular filtration / IgA immunoglobulin complex / IgG immunoglobulin complex / positive regulation of respiratory burst / Scavenging of heme from plasma / immunoglobulin complex, circulating / complement activation, classical pathway ...secretory dimeric IgA immunoglobulin complex / monomeric IgA immunoglobulin complex / secretory IgA immunoglobulin complex / glomerular filtration / IgA immunoglobulin complex / IgG immunoglobulin complex / positive regulation of respiratory burst / Scavenging of heme from plasma / immunoglobulin complex, circulating / complement activation, classical pathway / antigen binding / Cell surface interactions at the vascular wall / B cell receptor signaling pathway / antibacterial humoral response / adaptive immune response / blood microparticle / immune response / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液散乱 | ||||||
データ登録者 | Bonner, A. / Furtado, P.B. / Almogren, A. / Kerr, M.A. / Perkins, S.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Immunol. / 年: 2008 タイトル: Implications of the near-planar solution structure of human myeloma dimeric IgA1 for mucosal immunity and IgA nephropathy 著者: Bonner, A. / Furtado, P.B. / Almogren, A. / Kerr, M.A. / Perkins, S.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2qtj.cif.gz | 630.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2qtj.ent.gz | 517.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2qtj.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qt/2qtj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qt/2qtj | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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モデル数 | 10 |
詳細 | Two light chains (L and M or N and O) bind to two heavy chains (A and B or C and D) within each IgA monomer. Two IgA monomers then form the dimeric IgA molecule. |
-要素
#1: 抗体 | 分子量: 23216.770 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 詳細: Dimeric IgA1 was purified by thiophilic and jacalin affinity chromatography. 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) #2: 抗体 | 分子量: 51068.383 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 詳細: Kappa light chain dimeric IgA1 was isolated from myeloma serum. 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P01876, UniProt: Q6MZW0*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液散乱 |
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-データ収集
検出器 | 日付: 2001年7月1日 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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放射 | モノクロメーター: MIRROR / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Soln scatter | Buffer name: 140 MM NACL 12.5 MM NAHPO4 0.5 MM EDTA 0.02% NA AZIDE / Data analysis software list: SCTPL7, GNOM / Protein length: 1 / Sample pH: 7.5 / Source class: Y / 温度: 288 K
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-解析
ソフトウェア |
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精密化ステップ | サイクル: LAST
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Soln scatter model | Num. of conformers submitted: 10 / 代表コンフォーマー: 1 / Software list: INSIGHT II, SCTPL7, GNOM |