PDB-2qsp: Bovine Hemoglobin at pH 5.7

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2qsp

タイトル

Bovine Hemoglobin at pH 5.7

要素

Hemoglobin subunit alpha
Hemoglobin subunit beta

キーワード

TRANSPORT PROTEIN / hemoglobin / Heme / Iron / Metal-binding / Oxygen transport / Transport

機能・相同性

機能・相同性情報

Scavenging of heme from plasma / Heme signaling / Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen / Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide / Cytoprotection by HMOX1 / Neutrophil degranulation / hemoglobin alpha binding / cellular oxidant detoxification / haptoglobin-hemoglobin complex / hemoglobin complex ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Bos taurus (ウシ)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 1.85 Å

データ登録者

Aranda IV, R. / Richards, M.P. / Phillips Jr., G.N.

引用

ジャーナル: Proteins / 年: 2008
タイトル: Structural analysis of fish versus mammalian hemoglobins: Effect of the heme pocket environment on autooxidation and hemin loss.
著者: Aranda, R. / Cai, H. / Worley, C.E. / Levin, E.J. / Li, R. / Olson, J.S. / Phillips, G.N. / Richards, M.P.

履歴

登録	2007年7月31日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2008年9月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2023年8月30日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2qsp.cif.gz	145.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2qsp.ent.gz	115.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2qsp.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	2qsp_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2qsp_full_validation.pdf.gz	1.8 MB	表示
XML形式データ	2qsp_validation.xml.gz	33 KB	表示
CIF形式データ	2qsp_validation.cif.gz	48 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qs/2qsp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qs/2qsp	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2qssC 2r1hC 3bj1C 3bj2C 3bj3C 1g0aS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1ljw-1 3gdj-d 1aj9-1 3p5q-1 1ibe-1 2mhb-1 6kye-1 1qxd-d 3r5i-d 1sdl-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

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「今月の分子」の関連する項目

#41 - 2003年5月
ヘモグロビン (Hemoglobin)
類似性 (5)
#206 - 2017年2月
グロビンの進化 (Globin Evolution)
類似性 (4)
#257 - 2021年5月
胎児ヘモグロビン (Fetal Hemoglobin)
類似性 (4)
#233 - 2019年5月
S-ニトロシル化ヘモグロビン (S-Nitrosylated Hemoglobin)
類似性 (4)
#177 - 2014年9月
アポトソーム (Apoptosomes)
類似性 (1)
#36 - 2002年12月
シトクロムc (Cytochrome c)
類似性 (1)
#5 - 2000年5月
シトクロムc酸化酵素 (Cytochrome c Oxidase)
類似性 (1)
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エリスロクルオリン (Erythrocruorin)
類似性 (4)
#186 - 2015年6月
終末糖化産物受容体 (Receptor for Advanced Glycation End Products)
類似性 (4)
#262 - 2021年10月
PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures )
類似性 (4)
#142 - 2011年10月
PDBの先駆者たち (PDB Pioneers)
類似性 (4)

登録構造単位

A: Hemoglobin subunit alpha

B: Hemoglobin subunit beta

C: Hemoglobin subunit alpha

D: Hemoglobin subunit beta

ヘテロ分子

64.6 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	65.033, 78.273, 109.085
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Hemoglobin subunit alpha / Hemoglobin alpha chain / Alpha-globin 分子量: 15077.171 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P01966
#2: タンパク質	Hemoglobin subunit beta / Hemoglobin beta chain / Beta-globin 分子量: 15977.382 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P02070
#3: 化合物	ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME 分子量: 616.487 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₂FeN₄O₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 684 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.24 Å³/Da / 溶媒含有率: 44.97 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.7 詳細: 0.4 M Na Cacodylate 12-15% PEG 3350, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 93 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.5418 Å
検出器	タイプ: BRUKER PROTEUM-R / 検出器: CCD / 日付: 2006年6月15日 / 詳細: MONTEL OPTICS
放射	モノクロメーター: GRADED MULTILAYER / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.85→63.63 Å / Num. obs: 52808 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 7.4 %
反射シェル	解像度: 1.85→1.9 Å / 冗長度: 3.7 %

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0005	精密化
PDB_EXTRACT	3	データ抽出
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1G0A

1g0a

解像度: 1.85→63.63 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.95 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.91 / SU B: 3.445 / SU ML: 0.107 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.164 / ESU R Free: 0.166 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.25768	2434	5.1 %	RANDOM
R_work	0.18663	-	-	-
obs	0.19027	45628	99.63 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 19.192 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.73 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.28 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.45 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.85→63.63 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4386	0	172	684	5242

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.016	0.022	4779
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.525	2.063	6554
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.477	5	596
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	37.313	23.968	189
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.097	15	767
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	18.231	15	16
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.112	0.2	712
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.007	0.02	3614
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.22	0.2	2558
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.302	0.2	3274
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.166	0.2	567
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined	0.069	0.2	1
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.199	0.2	59
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.205	0.2	42
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.278	1.5	2941
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.526	2	4615
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.583	3	2061
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.679	4.5	1917
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.85→1.898 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.339	157	-
R_work	0.251	3206	-
obs	-	-	96.47 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.7403	3.0277	3.0026	5.8469	4.6796	6.5861	0.1578	-0.2151	-0.1572	0.2236	-0.0955	-0.0713	0.2649	-0.1283	-0.0623	0.0127	0.0068	0.0278	0.0094	-0.0286	0.0384	30.9275	-14.0713	12.4019
2	5.121	-1.6612	-0.2421	2.375	0.123	1.3964	0.0174	-0.168	0.139	-0.0473	0.0372	-0.1052	-0.0019	0.1633	-0.0546	0.0344	-0.0007	0.0018	0.0379	-0.0181	0.009	28.9206	1.7241	25.4898
3	11.9694	0.6804	4.9043	1.0414	0.3395	2.8954	-0.1344	-0.2641	0.483	0.123	-0.0331	-0.0389	-0.1	-0.0725	0.1675	0.008	-0.0196	-0.0094	0.0435	-0.0315	-0.0283	23.8704	3.7702	35.6196
4	1.15	0.7943	1.2237	8.7356	5.0666	5.7852	0.0046	-0.1509	-0.0977	0.0984	-0.0454	-0.0244	0.1318	-0.0541	0.0408	0.0154	0.0143	0.0013	0.035	0.0116	0.0161	29.1475	-9.0542	28.4428
5	6.5794	-4.3892	-5.1758	4.3237	3.1818	8.3651	-0.212	-0.0797	-0.7098	0.1041	0.0665	0.1777	0.7966	-0.107	0.1454	0.0338	-0.0464	-0.0037	-0.0536	0.0149	0.0434	19.4319	-16.4205	25.3442
6	1.1801	0.1414	-0.4356	0.4061	0.0336	1.291	-0.0081	0.0015	-0.0622	0.0138	0.0073	-0.0178	0.0437	-0.0453	0.0008	0.0335	0.0003	-0.0032	0.0118	-0.0043	0.0259	24.1554	-4.3865	17.9045
7	30.4862	-18.9777	-14.1836	12.4278	6.0836	18.8737	-1.2812	-0.4227	-1.7206	0.0884	0.7365	1.3045	0.9138	-0.6267	0.5447	-0.0267	-0.0617	0.0203	-0.005	0.0379	0.0963	9.0884	-11.8093	24.8858
8	15.2326	-1.8189	2.9169	22.5251	2.6297	24.2319	-0.5345	-0.7774	-0.3875	1.0956	0.1163	0.6719	-0.2375	-0.7954	0.4182	0.0715	0.1085	0.0128	-0.0962	-0.0418	-0.0136	24.7258	22.8994	21.0076
9	3.0896	-0.842	-0.3978	3.3427	1.144	0.5346	-0.127	0.4218	-0.0077	-0.585	-0.0775	-0.3207	-0.3249	0.048	0.2046	0.0963	-0.0804	0.0056	-0.0303	0.0319	0.0048	34.1008	17.6571	9.9678
10	2.0969	0.5547	0.2982	0.39	-0.0948	2.3174	-0.0512	0.1503	0.0261	-0.0708	0.0287	0.0133	-0.1241	0.0165	0.0225	0.0243	-0.0119	0.0099	0.0334	-0.0025	-0.0093	22.1989	1.2538	0.6059
11	1.3178	-0.0932	0.1686	4.9722	-0.6877	3.3591	-0.1166	0.0972	-0.0567	-0.1868	-0.0105	-0.0288	-0.1448	0.2847	0.1271	0.0506	-0.0571	0.0403	0.0472	0.0064	-0.0426	27.9356	2.2985	-6.5178
12	1.7286	0.1717	1.9155	4.4328	0.8799	2.8413	-0.3933	-0.0204	0.3128	-0.3059	0.1079	0.3545	-0.7816	-0.0267	0.2854	0.195	-0.022	-0.0776	-0.1026	0.0425	-0.0108	21.5979	20.676	5.7854
13	2.1602	0.5771	0.7998	0.811	0.4484	1.7492	-0.1403	0.064	0.1809	-0.1253	0.0226	0.1039	-0.2241	-0.0611	0.1177	0.0784	-0.002	-0.004	-0.0068	0.0126	0.0384	22.5382	10.4157	9.8633
14	17.3975	5.8368	10.5457	4.3732	-0.1633	15.4054	-1.1788	-0.976	1.0484	0.5579	0.3256	0.5786	-0.7444	-1.6041	0.8532	0.0397	0.1757	-0.0754	0.0598	-0.0266	0.0323	7.5699	14.744	5.6367
15	2.456	-0.8437	2.992	2.1433	-1.656	5.9201	0.0647	0.046	-0.1807	0.0637	-0.0861	-0.0268	0.1372	0.1012	0.0214	0.0266	-0.0017	0.0187	-0.0083	-0.0014	0.0568	-4.8412	-19.6882	12.7187
16	0.9374	-0.2686	-1.0052	0.5029	0.8894	1.9718	0.1072	0.1936	0.1325	-0.0268	-0.0292	0.0536	-0.2392	-0.1464	-0.078	0.034	0.014	0.0129	0.0261	0.0045	0.0084	-3.0843	-2.1856	-2.468
17	2.5215	-2.5256	2.2221	7.1781	-6.5245	8.1586	-0.0303	0.1081	-0.2099	-0.1271	0.0172	-0.0573	0.1674	0.0898	0.0131	0.0261	-0.0226	0.0212	0.0181	-0.0571	0.0531	-2.3919	-16.0516	-0.6875
18	2.636	3.9204	-6.0767	9.073	-12.2547	17.2004	-0.1122	0.1087	-0.3808	-0.6472	-0.1537	-0.76	0.9218	0.1206	0.266	-0.0535	0.0694	0.1068	-0.0225	0.0597	0.2264	9.3558	-22.1516	5.4838
19	1.4746	0.0671	-0.6417	6.8063	1.1306	1.2262	-0.0681	0.1263	-0.1791	-0.1789	-0.0079	-0.0475	0.0099	0.1771	0.076	-0.0108	-0.0059	0.0097	0.0387	-0.0424	0.0277	12.2462	-9.1227	-1.2459
20	1.2059	-0.2041	0.049	1.1825	0.225	1.0493	0.0213	-0.0054	-0.1418	-0.0428	-0.0252	0.0148	0.0375	-0.0702	0.004	0.0357	-0.0061	-0.0021	-0.0078	-0.0096	0.0333	-5.1881	-8.5881	12.2206
21	7.2786	0.5103	-6.4268	5.2065	0.5514	6.7007	-0.1465	-0.0438	-0.0336	-0.2786	0.1933	-0.8012	0.0723	0.5055	-0.0468	-0.033	-0.0117	0.0159	0.0148	0.0032	0.1172	9.0996	-13.0022	8.3656
22	2.8549	-0.1888	-1.2201	5.103	-3.4264	5.8161	0.1941	0.0262	0.2461	-0.4299	-0.3313	-0.4269	-0.1225	0.174	0.1373	0.0603	0.0352	0.0552	-0.0346	-0.003	0.0391	-15.0483	11.0915	10.8879
23	4.1911	-2.4227	1.3923	3.5392	-0.7475	3.4682	-0.0246	-0.3933	-0.0626	0.2044	0.0433	0.1381	-0.1102	-0.1803	-0.0187	0.0382	-0.0327	0.0083	0.0552	-0.0066	0.0179	-7.7716	-2.2703	24.6989
24	1.6082	-0.3682	0.2105	1.5961	0.977	1.9071	0.1584	-0.3993	-0.0674	0.18	-0.1032	0.0828	0.2396	-0.2035	-0.0552	-0.001	-0.0829	-0.0095	0.0819	0.0085	-0.0498	-2.8414	-2.7732	31.8178
25	1.7536	-1.1761	1.3326	3.0231	-0.4271	4.0647	0.0694	0.0665	0.1656	-0.1091	-0.1609	0.0597	-0.3793	0.0656	0.0914	0.0745	0.0088	0.0294	-0.0206	-0.0521	0.036	-3.0261	15.2106	22.6549
26	5.2046	0.4211	1.4726	0.6659	0.4386	1.582	-0.0347	0.094	0.1796	-0.0459	-0.0057	0.0251	-0.0599	0.0455	0.0404	0.0722	0.0047	0.0216	0.0054	-0.012	0.0243	-5.2417	1.4756	17.0547
27	4.6591	2.2117	3.0414	3.0034	1.907	2.4485	0.0072	0.1154	0.143	-0.0194	0.0378	-0.0249	-0.0965	0.0739	-0.045	0.0572	0.0157	0.0369	-0.008	0.0076	0.0125	-5.7581	7.8094	10.6629
28	68.2808	75.3098	-38.8686	157.5586	-14.2165	33.1467	2.626	-1.1734	0.3714	-1.5636	-0.0461	-3.7565	-0.4581	2.65	-2.58	0.1605	-0.2125	-0.0317	0.1122	-0.1115	0.1484	9.5142	15.581	20.1513

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	1 - 16	1 - 16
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	17 - 39	17 - 39
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	40 - 54	40 - 54
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	55 - 70	55 - 70
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	A	71 - 89	71 - 89
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	A	90 - 136	90 - 136
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	A	137 - 141	137 - 141
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	1 - 6	1 - 6
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	B	7 - 21	7 - 21
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	B	22 - 41	22 - 41
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	B	42 - 64	42 - 64
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	B	65 - 86	65 - 86
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	B	87 - 139	87 - 139
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	B	140 - 145	140 - 145
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	C	1 - 22	1 - 22
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	C	23 - 50	23 - 50
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	C	51 - 73	51 - 73
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	C	74 - 82	74 - 82
19	X-RAY DIFFRACTION	19	C	C	83 - 96	83 - 96
20	X-RAY DIFFRACTION	20	C	C	97 - 124	97 - 124
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	C	125 - 141	125 - 141
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	D	1 - 19	1 - 19
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	D	20 - 33	20 - 33
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	D	34 - 64	34 - 64
25	X-RAY DIFFRACTION	25	D	D	65 - 95	65 - 95
26	X-RAY DIFFRACTION	26	D	D	96 - 121	96 - 121
27	X-RAY DIFFRACTION	27	D	D	122 - 140	122 - 140
28	X-RAY DIFFRACTION	28	D	D	141 - 145	141 - 145

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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