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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ov3 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of 138-173 ZnuA deletion mutant plus zinc bound | ||||||
![]() | Periplasmic binding protein component of an ABC type zinc uptake transporter | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / ABC Transporter / solute binding domain / zinc transport | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Smith, T.J. / Wei, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Possible Regulatory Role for the Histidine-Rich Loop in the Zinc Transport Protein, ZnuA 著者: Wei, B. / Randich, A.M. / Bhattacharyya-Pakrasi, M. / Pakrasi, H.B. / Smith, T.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 65.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 47.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28677.465 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.66 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.77 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 100mM ADA, pH 6.5, 1.8-2.0 ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: BRUKER SMART 6000 / 検出器: CCD / 日付: 2006年12月2日 |
放射 | モノクロメーター: Graphite / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→50 Å / Num. all: 11550 / Num. obs: 10719 / % possible obs: 92.8 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 3.4 % / Rsym value: 0.555 / Net I/σ(I): 16.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.49 Å / 冗長度: 2 % / Mean I/σ(I) obs: 3.4 / Rsym value: 0.297 / % possible all: 63.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB entry 2OV1 解像度: 2.4→48.44 Å / σ(F): 265 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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溶媒の処理 | Bsol: 29.221 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 26.152 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→48.44 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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