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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mb3 | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of an intramolecular (3+1) human telomeric G-quadruplex bound to a telomestatin derivative | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA_(5'-D(*![]() DNA/DNA INHIBITOR / intramolecular G-quadruplex / human telomere / anticancer targets / macrocyclic hexaoxazole / telomestatin derivative / DNA-DNA INHIBITOR complex | 機能・相同性 | Chem-L2H / DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing, simulated annealing, molecular dynamics | Model details | lowest energy, model1 | ![]() Chung, W.J. / Heddi, B. / Tera, M. / Iida, K. / Nagasawa, K. / Phan, A.T. | ![]() ![]() タイトル: Solution structure of an intramolecular (3 + 1) human telomeric g-quadruplex bound to a telomestatin derivative. 著者: Chung, W.J. / Heddi, B. / Tera, M. / Iida, K. / Nagasawa, K. / Phan, A.T. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 168 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 141.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 547.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 616.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 7591.883 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: 化合物 | ChemComp-L2H / ( |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing, simulated annealing, molecular dynamics ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 579 / NOE intraresidue total count: 279 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |