分子量: 11887.097 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) 解説: RNA WAS PREPARED BY IN VITRO TRANSCRIPTION USING T7 RNA POLYMERASE AND DNA OLIGONUCLEOTIDE TEMPLATE プラスミド: pUC19 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
2
1
1
2D 1H-15N HSQC
2
2
1
2D HNN-COSY
2
3
1
2D 1H-1H NOESY
2
4
1
3D 1H-15N NOESY
2
5
1
2D 1H-15N CPMG-NOESY
1
6
2
2D 1H-13C HSQC
1
7
2
2D 1H-1H NOESY
1
8
2
2D DQF-COSY
1
9
2
2D 1H-1H TOCSY
-
試料調製
詳細
Solution-ID
内容
溶媒系
1
1 mM [U-100% 15N] RNA (37-MER), 50 mM potassium chloride, 25 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
2
1 mM [U-100% 15N] RNA (37-MER), 50 mM potassium chloride, 25 mM potassium phosphate, 100% D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1mM
RNA (37-MER)-1
[U-100% 15N]
1
50mM
potassium chloride-2
1
25mM
potassium phosphate-3
1
1mM
RNA (37-MER)-4
[U-100% 15N]
2
50mM
potassium chloride-5
2
25mM
potassium phosphate-6
2
試料状態
Conditions-ID
イオン強度
pH
圧 (kPa)
温度 (K)
1
75
6.2
ambient
298K
2
75
6.2
ambient
278K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
900
1
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
800
2
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
700
3
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
600
4
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
ARIA
1.2
Linge, O'DonoghueandNilges
精密化
TopSpin
2.1
BrukerBiospin
collection
TopSpin
2.1
BrukerBiospin
解析
Sparky
3.113
Goddard
データ解析
CNS
1.1
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
精密化
手法: simulated annealing, energy minimization / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 783 / NOE intraresidue total count: 315 / NOE medium range total count: 143 / NOE sequential total count: 325
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10