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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l7w | ||||||
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タイトル | Solution structure of the human Raf-1 kinase inhibitor protein | ||||||
要素 | Phosphatidylethanolamine-binding protein 1 | ||||||
キーワード | Signaling Protein Inhibitor / Raf-1 kinase inhibitor protein | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 phosphatidylethanolamine binding / negative regulation of MAPK cascade / Signaling by high-kinase activity BRAF mutants / serine-type endopeptidase inhibitor activity / MAP2K and MAPK activation / Negative regulation of MAPK pathway / Signaling by moderate kinase activity BRAF mutants / Paradoxical activation of RAF signaling by kinase inactive BRAF / Signaling downstream of RAS mutants / Signaling by BRAF and RAF1 fusions ...phosphatidylethanolamine binding / negative regulation of MAPK cascade / Signaling by high-kinase activity BRAF mutants / serine-type endopeptidase inhibitor activity / MAP2K and MAPK activation / Negative regulation of MAPK pathway / Signaling by moderate kinase activity BRAF mutants / Paradoxical activation of RAF signaling by kinase inactive BRAF / Signaling downstream of RAS mutants / Signaling by BRAF and RAF1 fusions / protein kinase binding / enzyme binding / RNA binding / extracellular exosome / ATP binding / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
データ登録者 | Yi, C.Y. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution structure of the human Raf-1 kinase inhibitor protein 著者: Yi, C.Y. / Lin, D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2l7w.cif.gz | 1.2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2l7w.ent.gz | 1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2l7w.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2l7w_validation.pdf.gz | 471.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2l7w_full_validation.pdf.gz | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | 2l7w_validation.xml.gz | 237.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2l7w_validation.cif.gz | 194 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l7/2l7w ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l7/2l7w | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21086.787 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RKIP / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P30086 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 3mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Raf-1 kinase inhibitor protein; 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 3 mM / 構成要素: Raf-1 kinase inhibitor protein-1 / Isotopic labeling: [U-100% 13C; U-100% 15N] |
試料状態 | イオン強度: 200 / pH: 4 / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software | 名称: CNS / 開発者: Brunger, Adams, Clore, Gros, Nilges and Read / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: closest to the average |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |