+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l59 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution Structures of Oxidized and Reduced Thioredoxin C from M. tb | ||||||
![]() | Thioredoxin | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / Trx / M. tb / Tuberculosis / TrxC | ||||||
機能・相同性 | ![]() Cysteine synthesis from O-acetylserine / Cell redox homeostasis / Tolerance by Mtb to nitric oxide produced by macrophages / glutathione disulfide oxidoreductase activity / disulfide oxidoreductase activity / protein-disulfide reductase activity / peptidoglycan-based cell wall / cell redox homeostasis / electron transfer activity / extracellular region ...Cysteine synthesis from O-acetylserine / Cell redox homeostasis / Tolerance by Mtb to nitric oxide produced by macrophages / glutathione disulfide oxidoreductase activity / disulfide oxidoreductase activity / protein-disulfide reductase activity / peptidoglycan-based cell wall / cell redox homeostasis / electron transfer activity / extracellular region / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 16 | ||||||
![]() | Olson, A.L. / Cai, S. / Sem, D.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structures of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin C and models of intact thioredoxin system suggest new approaches to inhibitor and drug design. 著者: Olson, A.L. / Neumann, T.S. / Cai, S. / Sem, D.S. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 686.2 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 596.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 352.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 414.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 30.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 55.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12557.433 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: trxA, trx, trxC, Rv3914, MT4033, MTV028.05 / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | 内容: 50 mM potassium phosphate-1, 1.2 mM [U-13C, U-15N] Thioredoxin, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| ||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 0.05 / pH: 6.3 / 圧: ambient / 温度: 298.4 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |