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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l1t | ||||||
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タイトル | Solution Structure of the N-terminal Domain of NP_954075.1 | ||||||
![]() | Uncharacterized protein | ||||||
![]() | Structural Genomics / Unknown function / putative c-di-GMP binding / GSU3033 / PilZ / PSI-Biology / Protein Structure Initiative / Joint Center for Structural Genomics / JCSG | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | closest to the average, model 17 | ||||||
![]() | Susac, L. / Serrano, P. / Geralt, M. / Wuthrich, K. / Joint Center for Structural Genomics (JCSG) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: NMR structure of the protein NP_954075.1 from Geobacter sulfurreducens 著者: Susac, L. / Serrano, P. / Geralt, M. / Wuthrich, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 651.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 543.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 355.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 490.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 31.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 55.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12045.441 Da / 分子数: 1 / 断片: N-terminal residues 1-108 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: GSU3033 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 0.9 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] NP_954075.1, 25 mM sodium phosphate, 4.5 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.075 / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |