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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k92 | ||||||
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タイトル | Structural modification of acyl carrier protein by butyryl group | ||||||
要素 | Acyl carrier protein | ||||||
キーワード | LIPID TRANSPORT / Apo Form of Acyl Carrier Protein / Fatty Acid Synthesis Protein / Cytoplasm / Fatty acid biosynthesis / Lipid synthesis / Phosphopantetheine | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 lipid biosynthetic process / lipid A biosynthetic process / phosphopantetheine binding / acyl binding / acyl carrier activity / fatty acid biosynthetic process / response to xenobiotic stimulus / lipid binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Wu, B.N. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2009 タイトル: Structural modification of acyl carrier protein by butyryl group. 著者: Wu, B.N. / Zhang, Y.M. / Rock, C.O. / Zheng, J.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2k92.cif.gz | 456.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2k92.ent.gz | 380.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2k92.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2k92_validation.pdf.gz | 340.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2k92_full_validation.pdf.gz | 511 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2k92_validation.xml.gz | 41 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2k92_validation.cif.gz | 60.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k9/2k92 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k9/2k92 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8513.279 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: apo form / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 遺伝子: acpP, b1094, JW1080 / プラスミド: pET11a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P0A6A8 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 1.5 mM [U-13C; U-15N] apoacp, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 1.5 mM / 構成要素: apoacp / Isotopic labeling: [U-13C; U-15N] |
試料状態 | イオン強度: 40 / pH: 6.5 / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software | 名称: DYANA / 開発者: Guentert, P. / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: fewest violations |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: 20 / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |